(Tsoi et al. 2003). At the time of

(Tsoi et al. 2003). At the time of their study, there
were no microarrays available for fish. Therefore,
these researchers used a commercially available human
cDNA microarray to identify differentially expressed
genes in the liver of Atlantic salmon challenged
with A. salmonicida. This study had limited
success in identifying differentially expressed genes
because of the high levels of sequence divergence
between Atlantic salmon and humans.
Building upon this earlier work, six SSH cDNA
libraries were constructed for liver, head kidney,
and spleen tissues following i.p. challenge with A.
salmonicida (Tsoi et al. 2004). From these libraries,
1778 clones were selected and used to create a custom
cDNA microarray, which was used to study
the transcriptional responses of Atlantic salmon following
cohabitation challenge with A. salmonicida
and Atlantic salmon macrophages exposed in vitro
to in vivo and in vitro cultured A. salmonicida
(Ewart et al. 2005, 2008). These studies have provided
insights into the early (

Kết quả (Việt) 1:

(Tsoi et al. năm 2003). Tại thời điểm các nghiên cứu của họ, cókhông có microarrays đã có sẵn cho cá. Do đó,Các nhà nghiên cứu sử dụng một con người thương mại có sẵncDNA microarray để xác định differentially bày tỏgen trong gan salmon Đại Tây Dương thách thứcvới A. salmonicida. Nghiên cứu này có giới hạnthành công trong việc xác định differentially thể hiện genbởi vì các cấp cao của chuỗi phân kỳgiữa salmon Đại Tây Dương và con người.Xây dựng dựa trên tác phẩm trước đó này, sáu SSH cDNAthư viện được xây dựng cho gan, đầu thận,và lá lách mô sau với thách thức với A.salmonicida (Tsoi et al. năm 2004). Từ các thư viện,1778 nhái đã được lựa chọn và được sử dụng để tạo ra một tùy chỉnhcDNA microarray, được sử dụng để nghiên cứuphản ứng transcriptional của cá hồi Đại Tây Dương sauthách thức cùng chung sống với A. salmonicidavà đại thực bào salmon Đại Tây Dương tiếp xúc trong ống nghiệmtại vivo và trong ống nghiệm nuôi cấy A. salmonicida(Ewart et al. 2005, 2008). Các nghiên cứu đã cung cấpcái nhìn sâu vào đầu những năm (< 2 giờ postinfection)và cuối (bệnh mãn tính, 13 ngày postinfection)Phiên mã phản ứng của salmon Đại Tây Dương nàymầm bệnh và đã xác định một số lượng chưa biếtgen differentially quy định và xứng đángnghiên cứu trong tương lai. Ngoài ra, cung cấp Ewart et al. (2008)bằng chứng cho sự khác biệt trong các transcriptionalphản ứng của đại thực bào với vi khuẩn phát triển tại vivovà trong ống nghiệm. Các nghiên cứu chứng minh giá trị củaMicroarray công nghệ và giá trị nhắm mục tiêu củaCác nghiên cứu trong lĩnh vực này để kiểm tra chi tiết hơn cácảnh hưởng của protein cụ thể A. salmonicida hoặc khácsản phẩm trên các máy chủ.Như đã đề cập trước đó, sự sẵn có của Atlanticcá hồi microarrays từ cGRASP đã làm cho nó có thểĐối với một số nhóm nghiên cứu để kiểm tra cáctranscriptional để đáp ứng với tác nhân gây bệnh. Martin et al.(2006) sử dụng thời gian thực Đảng Cộng sản Romania, SSH xây dựng thư viện,và phiên bản đầu tiên của cGRASP microarrayđể kiểm tra phản ứng của salmon Đại Tây Dương gill,thận và gan mô để thách thức với một loạicăng thẳng của A. salmonicida. Căng thẳng này cómột đột biến trong gen aeroA của nó mà kết quả trong nónhanh chóng xóa từ các máy chủ sau khi chỉ là một đoạn ngắngiai đoạn sao chép mà không có bệnh suất ở các máy chủ.Ngoài ra, tiêm phòng với đột biến này được biết đếnđể cung cấp một phản ứng miễn dịch bảo vệ. Trong điều nàynghiên cứu, phân tích microarray và Đảng Cộng sản Romania thời gian thựcđược sử dụng để xác nhận kết quả thu được từ phân tíchSSH thư viện, cũng như xác định bổ sunggen không được tiết lộ trong các thư viện nhưngbiểu hiện có thay đổi để đáp ứng với thách thức.Bao gồm trong các gen là nhiều thành viên củaCác con đường phản ứng giai đoạn cấp tính. Loại nghiên cứurất nhiều cải thiện sự hiểu biết của chúng tôi về làm thế nào miễn dịchHệ thống đáp ứng thách thức do vi khuẩn, cáctác động của các thách thức trên con đường nonimmune liên quanvà các cơ chế mà kháng phát triển.Các quan sát này rất quan trọng đối vớisự phát triển của thereaputants mới và vắc xincho cá.Gần đây, Pardo et al. (2008) báo cáo về9256 ESTs (3482 độc đáo chuỗi) từ turbot(S. maximus) mà đã được thử thách với A.salmonicida salmonicida và ectoparasitic protozoanDicentrarchi Philasterides, cũng như từunchallenged cá nhân. Trên cơ sở phân tíchtần số EST, bằng cách sử dụng một tập hợp con của 72 gen, họđã có thể xác định sự khác biệt trong tần số củamột số gen giữa các loài động vật thách thức vớiCác tác nhân gây bệnh hai. Sử dụng các dữ liệu ESTs, một lowdensity2716 thăm dò dựa trên oligo Agilent microarraymới được phát triển để nghiên cứu các phản ứng của turbotđể tác nhân gây bệnh (Millan et al. năm 2009). Tác giả ´lưu ý rằng microarray này là công khai có sẵn trêncơ sở chi phí phục hồi. Thử nghiệm này sử dụng microarraylá lách mô từ A. salmonicida thách thứccá đã chứng minh tính hữu dụng của nó như là một công cụ để hỗ trợnghiên cứu về và một chương trình lựa chọn broodstockcá thương mại quan trọng này.Sử dụng một microarray phát triển bởi khuôn khổ EU5 GENIPOL tập đoàn cho toxicogenomicsCác nghiên cứu của người châu Âu flounder, Diab et al. (2008)kiểm tra các phản ứng transcriptional của gan củaChâu Âu flounder tiêm với một thương mạiA. salmonicida các vắc xin trong một khoảng thời gian 16 ngày. Mặc dùmicroarray này ban đầu được thiết kế đểtrả lời nghiên cứu gan của cá bơn về toxicants, khôngđã có mặt để cho phép đủ gen liên quan đến miễn dịchCác tác giả để có được các thông tin tốt nhấtmột số nhóm liên quan đến miễn dịch như kháng khuẩnprotein, protein giai đoạn cấp tính, bổ sungHệ thống, chemokine, và phân bào. Nghiên cứu nàychứng minh rằng mảng này là thích hợp để bắt đầukiểm tra những ảnh hưởng của tiếp xúc với toxicants trên cácHệ thống miễn dịch của điều này và các loài có liên quan

Kết quả (Việt) 2:

(Tsoi et al. 2003). Tại thời điểm nghiên cứu của họ, có
là không có microarray có sẵn cho cá. Do đó,
các nhà nghiên cứu sử dụng một thương mại sẵn có của con người
cDNA microarray để xác định các kiểu khác thể hiện
gen trong gan của cá hồi Đại Tây Dương thách thức
với A. salmonicida. Nghiên cứu này đã hạn chế
sự thành công trong việc xác định gen theo kiểu khác bày tỏ
vì các cấp độ cao của dãy phân kỳ
giữa hồi Đại Tây Dương và con người.
Dựa trên công trình trước đây, sáu SSH cDNA
thư viện được xây dựng cho gan, thận đầu,
và các mô lách sau ip thách thức với A .
salmonicida (Tsoi et al. 2004). Từ các thư viện,
1.778 dòng vô tính đã được lựa chọn và sử dụng để tạo ra một tùy chỉnh
microarray cDNA, được sử dụng để nghiên cứu
các phản ứng phiên mã của hồi Đại Tây Dương sau
chung sống với thách thức A. salmonicida
và hồi Đại Tây Dương đại thực bào tiếp xúc trong ống nghiệm
để in vivo và in vitro nuôi A . salmonicida
(Ewart et al. 2005, 2008). Những nghiên cứu này đã cung cấp
cái nhìn sâu vào đầu (<2 giờ postinfection)
và muộn (bệnh mãn tính, 13 ngày postinfection)
phản ứng phiên mã của hồi Đại Tây Dương để này
mầm bệnh và đã xác định được một số lượng không xác định
các gien quy định theo kiểu khác và xứng đáng
nghiên cứu trong tương lai. Ngoài ra, Ewart et al. (2008) đã cung cấp
bằng chứng về sự khác biệt trong phiên mã
phản ứng của đại thực bào vi khuẩn phát triển trong cơ thể
và trong ống nghiệm. Các nghiên cứu chứng minh giá trị của
công nghệ microarray và giá trị của mục tiêu của
nghiên cứu trong lĩnh vực này để kiểm tra chi tiết các
tác động của các protein A. salmonicida cụ thể hoặc các
sản phẩm trên máy chủ.
Như đã đề cập trước đó, sự sẵn có của Đại Tây Dương
microarray cá hồi từ cGRASP đã làm cho nó có thể
cho một số nhóm nghiên cứu để kiểm tra
phản ứng phiên mã để các mầm bệnh. Martin et al.
(2006) sử dụng real-time PCR, SSH xây dựng thư viện,
và một phiên bản đầu của microarray cGRASP
để kiểm tra phản ứng của Đại Tây Dương mang cá hồi,
thận, gan và các mô để thách thức với một nhược độc
chủng A. salmonicida. Dòng này có
một đột biến ở gen aeroA của nó mà kết quả là nó bị
thải nhanh chóng từ các máy chủ chỉ sau một thời gian ngắn
thời gian sao chép mà không mắc bệnh ở vật chủ.
Ngoài ra, tiêm chủng đột biến này được biết đến
để cung cấp một phản ứng miễn dịch bảo vệ. Trong
nghiên cứu, phân tích microarray và real-time PCR được
sử dụng để xác nhận các kết quả thu được từ phân tích
của các thư viện SSH, cũng như để xác định thêm
các gen không được xác định trong các thư viện nhưng
có biểu hiện thay đổi để đáp ứng với thách thức.
Bao gồm trong các gen Đã có nhiều thành viên của
các con đường phản ứng giai đoạn cấp tính. Đây là loại hình nghiên cứu
cải thiện đáng kể sự hiểu biết của chúng ta về các miễn dịch
hệ thống phản ứng với thách thức do vi khuẩn, các
tác động của các thách thức trên con đường không có miễn dịch liên quan
và các cơ chế mà các kháng phát triển.
Những hiểu biết rất quan trọng đối với
sự phát triển của thereaputants mới và vắc-xin
cho cá.
Gần đây hơn, Pardo et al. (2008) báo cáo về
9256 ESTs (3482 chuỗi duy nhất) từ cá bơn
(S. maximus) đã được thử thách với A.
salmonicida salmonicida và các sinh vật đơn bào ký sinh ngoài da
Philasterides dicentrarchi, cũng như từ các
cá nhân không bị thách thức. Trên cơ sở phân tích
các tần số EST, sử dụng một tập hợp con của 72 gen, họ
đã có thể xác định sự khác biệt về tần số của
một số gen giữa các loài động vật thử thách với
hai tác nhân gây bệnh này. Sử dụng các dữ liệu ESTs, một lowdensity
2716 thăm dò oligo-dựa Agilent microarray
gần đây đã được phát triển để nghiên cứu phản ứng của cá bơn
để các mầm bệnh (Millan et al. 2009). Các tác giả
lưu ý rằng microarray này là công khai có sẵn trên
cơ sở chi phí phục hồi. Thử nghiệm microarray này sử dụng
mô lách từ A. salmonicida-thách thức
cá chứng minh tính hữu dụng của nó như là một công cụ để hỗ trợ
các nghiên cứu trên và một chương trình lựa chọn cá bố mẹ cho
cá thương mại quan trọng này.
Sử dụng một microarray được phát triển bởi các khung EU
GENIPOL consortium 5 cho toxicogenomics
nghiên cứu của các cá bơn châu Âu, Diab et al. (2008)
đã kiểm tra phản ứng phiên mã của gan của
cá bơn châu Âu tiêm với một thương mại
A. salmonicida vaccine trong thời gian 16 ngày. Mặc dù
microarray này ban đầu được thiết kế để
nghiên cứu phản ứng của gan cá bẹt để các chất độc hại, có
những gen miễn dịch liên quan đến đủ mặt để cho phép
các tác giả để có được thông tin tốt cho
một số nhóm miễn dịch liên quan đến kháng sinh như
protein, protein pha cấp, bổ sung
hệ thống , chemokine và cytokine. Nghiên cứu này
đã chứng minh rằng mảng này là thích hợp để bắt đầu
xem xét các tác động của việc tiếp xúc với các chất độc hại vào
hệ thống miễn dịch này và các loài khác có liên quan