Porcine Reproductive and Respirator

Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Comparison: Divergent Evolution on Two Continents
Chris J. Nelsen, Michael P. Murtaugh, and Kay S. Faaberg*
+ Author Affiliations

Department of Veterinary PathoBiology, University of Minnesota, St. Paul, Minnesota 55108
ABSTRACT

Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) is a recently described arterivirus responsible for disease in swine worldwide. Comparative sequence analysis of 3′-terminal structural genes of the single-stranded RNA viral genome revealed the presence of two genotypic classes of PRRSV, represented by the prototype North American and European strains, VR-2332 and Lelystad virus (LV), respectively. To better understand the evolution and pathogenicity of PRRSV, we obtained the 12,066-base 5′-terminal nucleotide sequence of VR-2332, encoding the viral replication activities, and compared it to those of LV and other arteriviruses. VR-2332 and LV differ markedly in the 5′ leader and sections of the open reading frame (ORF) 1a region. The ORF 1b sequence was nearly colinear but varied in similarity of proteins encoded in identified regions. Furthermore, molecular and biochemical analysis of subgenomic mRNA (sgmRNA) processing revealed extensive variation in the number of sgmRNAs which may be generated during infection and in the lengths of noncoding sequence between leader-body junctions and the translation-initiating codon AUG. In addition, VR-2332 and LV select different leader-body junction sites from a pool of similar candidate sites to produce sgmRNA 7, encoding the viral nucleocapsid protein. The presence of substantial variations across the entire genome and in sgmRNA processing indicates that PRRSV has evolved independently on separate continents. The near-simultaneous global emergence of a new swine disease caused by divergently evolved viruses suggests that changes in swine husbandry and management may have contributed to the emergence of PRRS.

Kết quả (Việt) 1:

So sánh Virus Hội chứng sinh sản và hô hấp Porcine: sự tiến hóa khác nhau trên hai châu lụcChris J. Nelsen, Michael P. Murtaugh và Kay S. Faaberg *+ Tác giả chi nhanhSở thú y PathoBiology, đại học Minnesota, St Paul, Minnesota 55108TÓM TẮTVirus hội chứng sinh sản và hô hấp Porcine (PRRSV) là một mô tả mới arterivirus chịu trách nhiệm về bệnh ở lợn trên toàn thế giới. So sánh trình tự phân tích của nhà ga 3 ' cấu trúc gen của bộ gen virus RNA đơn-stranded tiết lộ sự hiện diện của hai lớp genotypic của PRRSV, đại diện bởi các nguyên mẫu các chủng châu Âu và Bắc Mỹ, VR-2332 và Lelystad virus (LV), tương ứng. Để hiểu rõ hơn về sự tiến hóa và bài của PRRSV, chúng ta thu được dãy 12,066-cơ sở 5 '-ga nucleotide VR-2332, mã hóa các hoạt động virus nhân rộng, và so sánh nó với những người của LV và arteriviruses khác. VR-2332 và LV khác biệt rõ rệt trong 5 ' lãnh đạo và các phần của khung đọc mở (ORF) 1a khu vực. ORF 1b chuỗi là gần như colinear nhưng khác nhau ở điểm giống nhau của các protein được mã hóa trong các khu vực được xác định. Hơn nữa, phân tích phân tử và hóa sinh subgenomic mRNA (sgmRNA) chế biến tiết lộ biến thể rộng rãi trong số các sgmRNAs mà có thể được tạo ra trong quá trình bị nhiễm trùng và theo chiều dài của chuỗi DNA giữa cơ thể nhà lãnh đạo liên kết và bắt đầu các dịch codon AUG. Ngoài ra, VR-2332 và LV chọn các trang web giao lộ cơ thể nhà lãnh đạo khác nhau từ một trang web tương tự như ứng cử viên để sản xuất sgmRNA 7, mã hóa protein nucleocapsid virus. Sự hiện diện của các biến thể đáng kể trên toàn bộ gen và xử lý sgmRNA chỉ ra rằng PRRSV đã phát triển một cách độc lập trên lục địa riêng biệt. Gần đồng thời xuất hiện toàn cầu của một bệnh dịch mới gây ra bởi virus divergently phát triển cho thấy rằng những thay đổi trong chăn nuôi lợn và quản lý có thể đã góp phần vào sự nổi lên của tai.

Kết quả (Việt) 2:

Lợn sinh sản và hô hấp Syndrome Virus So sánh: phân kỳ tiến hóa trên hai châu lục
Chris J. Nelsen, Michael P. Murtaugh, và Kay S. Faaberg *
+ Tác giả Chi nhánh Sở Thú bệnh lý học, Đại học Minnesota, St. Paul, Minnesota 55.108 TÓM TẮT sinh sản ở lợn và virus hội chứng hô hấp (PRRS) là một arterivirus mô tả gần đây gây bệnh ở lợn trên toàn thế giới. Phân tích trình tự so sánh của 3'-terminal gen cấu trúc của RNA hệ gen virus sợi đơn tiết lộ sự hiện diện của hai lớp kiểu gen của virus PRRS, đại diện bởi các nguyên mẫu Bắc Mỹ và châu Âu chủng, VR-2332 và virus Lelystad (LV), tương ứng. Để hiểu rõ hơn về sự phát triển và gây bệnh của virus PRRS, chúng tôi thu được 12.066 cơ sở 5'-thiết bị đầu cuối tự nucleotide của VR-2332, mã hóa các hoạt động nhân lên của virus, và so sánh nó với những người của LV và arteriviruses khác. VR-2332 và LV khác nhau rõ rệt trong 'lãnh đạo và các phần của khu vực 1a mở khung đọc (ORF) 5. Trình tự 1b ORF là gần colinear nhưng thay đổi trong tương đồng của các protein được mã hóa trong các khu vực được xác định. Hơn nữa, phân tích phân tử và sinh hóa của mRNA subgenomic (sgmRNA) xử lý tiết lộ sự thay đổi sâu rộng trong các số sgmRNAs có thể được tạo ra trong quá trình nhiễm và độ dài của chuỗi không mã hoá giữa các nút giao lãnh đạo thân và tháng tám codon dịch-khởi. Ngoài ra, VR-2332 và LV chọn địa điểm ngã ba lãnh đạo-cơ thể khác nhau từ một hồ bơi của các trang web ứng cử viên tương tự sản xuất sgmRNA 7, mã hóa các protein nucleocapsid của virus. Sự hiện diện của các biến thể đáng kể trên toàn bộ hệ gen và chế biến sgmRNA chỉ ra rằng virus PRRS đã tiến hóa độc lập trên lục địa. Sự xuất hiện toàn cầu gần như đồng thời của một bệnh lợn mới gây ra bởi virus divergently tiến hóa cho thấy rằng những thay đổi trong chăn nuôi và quản lý lợn có thể đã góp phần vào sự xuất hiện của PRRS.