Hầu hết các nghiên cứu sử dụng kỹ thuật phân tử đã sử dụng nước thải chứ không phải là phần rắn rác để đánh giá sự đa dạng vi sinh vật. Đây có lẽ là do sự dễ dàng tương đối mà nước rò rỉ có thể được thu thập và xử lý cho DNA hoặc RNA khai thác so với chế biến và khai thác các vật liệu rắn (rác). Ví dụ, bộ thương mại và nhiều giao thức thí nghiệm được sử dụng để trích xuất axit nucleic đòi hỏi khối lượng mẫu 0,25-1 g với giới hạn trên và dưới của khoảng 0,1 và 10 g, tương ứng. Phạm vi này được quy định bởi một số yếu tố, bao gồm cả kích thước có sẵn ống, khối lượng thuốc thử / tỷ lệ khối lượng mẫu, và tế bào hiệu quả lysing. khối lượng nhỏ như vậy, cùng với các kích thước hạt lớn được tìm thấy trong rác, thường loại trừ vị trí trực tiếp của rác vào ống khai thác. Một vấn đề khác là sự khó khăn của việc DNA hoặc RNA đại diện từ một ma trận không đồng nhất như rác, dẫn đến những thành kiến mà có thể mang lại một cấu trúc cộng đồng vi khuẩn đo khác với sự đa dạng của vi sinh vật thực sự.
đang được dịch, vui lòng đợi..