Cordyceps, comprising over 400 spec

Cordyceps, comprising over 400 species, was historically classified in the Clavicipitaceae, based on cylindrical asci, thickened
ascus apices and filiform ascospores, which often disarticulate into part-spores. Cordyceps was characterized by the production of welldeveloped often stipitate stromata and an ecology as a pathogen of arthropods and Elaphomyces with infrageneric classifications emphasizing
arrangement of perithecia, ascospore morphology and host affiliation. To refine the classification of Cordyceps and the Clavicipitaceae, the
phylogenetic relationships of 162 taxa were estimated based on analyses consisting of five to seven loci, including the nuclear ribosomal
small and large subunits (nrSSU and nrLSU), the elongation factor 1α (tef1), the largest and the second largest subunits of RNA polymerase
ІІ (rpb1 and rpb2), β-tubulin (tub), and mitochondrial ATP6 (atp6). Our results strongly support the existence of three clavicipitaceous clades
and reject the monophyly of both Cordyceps and Clavicipitaceae. Most diagnostic characters used in current classifications of Cordyceps (e.g.,
arrangement of perithecia, ascospore fragmentation, etc.) were not supported as being phylogenetically informative; the characters that were
most consistent with the phylogeny were texture, pigmentation and morphology of stromata. Therefore, we revise the taxonomy of Cordyceps
and the Clavicipitaceae to be consistent with the multi-gene phylogeny. The family Cordycipitaceae is validated based on the type of Cordyceps,
C. militaris, and includes most Cordyceps species that possess brightly coloured, fleshy stromata. The new family Ophiocordycipitaceae is
proposed based on Ophiocordyceps Petch, which we emend. The majority of species in this family produce darkly pigmented, tough to pliant
stromata that often possess aperithecial apices. The new genus Elaphocordyceps is proposed for a subclade of the Ophiocordycipitaceae, which
includes all species of Cordyceps that parasitize the fungal genus Elaphomyces and some closely related species that parasitize arthropods.
The family Clavicipitaceae s. s. is emended and includes the core clade of grass symbionts (e.g., Balansia, Claviceps, Epichloë, etc.), and
the entomopathogenic genus Hypocrella and relatives. In addition, the new genus Metacordyceps is proposed for Cordyceps species that are
closely related to the grass symbionts in the Clavicipitaceae s. s. Metacordyceps includes teleomorphs linked to Metarhizium and other closely
related anamorphs. Two new species are described, and lists of accepted names for species in Cordyceps, Elaphocordyceps, Metacordyceps
and Ophiocordyceps are provided.

Kết quả (Việt) 1:

Trùng thảo, bao gồm hơn 400 loài, trong lịch sử được phân loại trong họ, dựa trên hình trụ asci, dàyascus apices và ascospores filiform, thường disarticulate thành phần-bào tử. Trùng thảo được đặc trưng bởi sản xuất welldeveloped thường cuống stromata và một sinh thái học là một mầm bệnh của động vật chân đốt và Elaphomyces với infrageneric phân loại nhấn mạnhsắp xếp của perithecia, ascospore hình Thái và máy chủ liên kết. Để tinh chỉnh việc phân loại của Cordyceps và họ, cácmối quan hệ phát sinh loài của đơn vị phân loại 162 được ước tính dựa trên phân tích bao gồm 5 đến 7 loci, bao gồm các hạt nhân ribosomesubunits nhỏ và lớn (nrSSU và nrLSU), 1α yếu tố kéo dài (tef1), lớn nhất và subunits lớn thứ hai của RNA-polymeraseІІ (rpb1 và rpb2), β-transistor (sục), và ti thể ATP6 (atp6). Kết quả chúng tôi ủng hộ mạnh mẽ sự tồn tại trong ba clavicipitaceous nhómvà từ chối tính đơn ngành của Cordyceps và họ. Hầu hết các ký tự chẩn đoán được sử dụng trong các phân loại hiện nay của trùng (ví dụ:sắp xếp của perithecia, ascospore phân mảnh, vv.) không được hỗ trợ như là ba thông tin; các ký tựphù hợp nhất với phát sinh loài kết cấu, sắc tố da và hình thái của stromata. Vì vậy, chúng tôi sửa đổi phân loại trùng thảovà họ phải phù hợp với phát sinh loài đa gen. Gia đình Cordycipitaceae được soát hợp thức dựa trên loại trùng thảo,C. militaris, và bao gồm phần lớn các loài trùng thảo có sáng màu, nhiều thịt stromata. Gia đình mới Ophiocordycipitaceae làđề xuất dựa trên Ophiocordyceps Petch, mà chúng tôi emend. Phần lớn các loài trong họ này sản xuất sắc tố người da đen, khó khăn để pliantstromata thường có aperithecial apices. Chi mới Elaphocordyceps được đề xuất cho một subclade của Ophiocordycipitaceae, màbao gồm tất cả các loài trùng thảo parasitize chi nấm Elaphomyces và một số loài liên quan chặt chẽ parasitize động vật chân đốt.S. s. chính của gia đình họ emended và bao gồm các nhánh cốt lõi của cỏ symbionts (ví dụ như, Balansia, Claviceps, Epichloë, vv), vàentomopathogenic chi Hypocrella và người thân. Ngoài ra, chi mới Metacordyceps được đề xuất cho loài trùng thảochặt chẽ liên quan đến symbionts cỏ Clavicipitaceae s. s. Metacordyceps bao gồm teleomorphs và các liên kết đến Metarhizium khác chặt chẽliên quan toxigenic. Hai loài mới được mô tả, và danh sách được chấp nhận tên cho loài trùng, Elaphocordyceps, Metacordycepsvà Ophiocordyceps được cung cấp.

Kết quả (Việt) 2:

Trùng Thảo, bao gồm hơn 400 loài, được xếp vào lịch sử Clavicipitaceae, dựa trên ASCI hình trụ, dày
apices Nang và ascospores filiform, thường cắt lìa khớp xương vào phần-bào tử. Trùng Thảo được đặc trưng bởi việc sản xuất welldeveloped stromata thường stipitate và một hệ sinh thái như là một tác nhân gây bệnh của động vật chân đốt và Elaphomyces với phân loại infrageneric nhấn mạnh
sắp xếp các quả thể, ascospore hình thái và máy chủ liên kết. Để tinh chỉnh các phân loại của Trùng Thảo và Clavicipitaceae, các
mối quan hệ phát sinh loài của 162 loài đã được ước tính dựa trên các phân tích gồm 5-7 loci, bao gồm cả các ribosome hạt nhân
tiểu đơn vị nhỏ và lớn (nrSSU và nrLSU), các yếu tố kéo dài 1α (tef1), lớn nhất và các tiểu đơn vị lớn thứ hai của RNA polymerase
ІІ (rpb1 và rpb2), β-tubulin (bồn tắm), và ATP6 ty lạp thể (atp6). Kết quả của chúng tôi rất ủng hộ sự tồn tại của ba nhánh clavicipitaceous
và từ chối các Đơn ngành của cả Cordyceps và Clavicipitaceae. Hầu hết các ký tự được sử dụng trong chẩn đoán phân loại hiện tại của Trùng Thảo (ví dụ,
sắp xếp các quả thể, ascospore phân mảnh, vv) không được hỗ trợ như là phylogenetically thông tin; những nhân vật mà là
phù hợp nhất với các phát sinh loài là kết cấu, màu và hình thái của stromata. Do đó, chúng tôi xem xét lại các nguyên tắc phân loại của Trùng Thảo
và Clavicipitaceae để phù hợp với sự phát sinh loài đa gen. Các gia đình Cordycipitaceae được xác nhận dựa trên các loại của Trùng Thảo,
C. Militaris, và bao gồm hầu hết các loài Cordyceps đó có màu sắc rực rỡ, stromata thịt. Các Ophiocordycipitaceae gia đình mới được
đề xuất dựa trên Ophiocordyceps Petch, mà chúng tôi sửa lời. Phần lớn các loài trong họ này sản xuất sắc tố sẫm, khó khăn để có thể uốn
stromata thường có apices aperithecial. Các chi mới Elaphocordyceps được đề xuất cho một subclade của Ophiocordycipitaceae, trong đó
bao gồm tất cả các loài Cordyceps ký sinh trên các Elaphomyces chi nấm và một số loài có quan hệ chặt chẽ ký sinh trên động vật chân đốt.
Các gia đình Clavicipitaceae ss được emended và bao gồm các nhánh chính của vật cộng sinh cỏ (ví dụ: , Balansia, Claviceps, Epichloë, vv), và
các chi entomopathogenic Hypocrella và người thân. Ngoài ra, các chi mới Metacordyceps được đề xuất cho Cordyceps loài có
liên quan chặt chẽ với cộng sinh cỏ trong ss Clavicipitaceae Metacordyceps bao gồm teleomorphs liên quan đến Metarhizium và khác chặt chẽ
anamorphs liên quan. Hai loài mới được mô tả, và danh sách các tên được chấp nhận đối với các loài ở Trùng Thảo, Elaphocordyceps, Metacordyceps
và Ophiocordyceps được cung cấp.