Q
replicase (RNA-directed RNA poly

Q
replicase (RNA-directed RNA polymerase of bacteriophage
Q
) exponentially amplifies certain RNAs (RQ
RNAs) in vitro. Here we characterize template properties
of the 5
and 3
fragments obtained by cleaving one
of such RNAs at an internal site. We unexpectedly found
that, besides the 3
fragment, Q
replicase can copy the
5
fragment and a number of its variants, although they
lack the initiator region of RQ RNA. This copying can
occur as a 3
-terminal elongation or through de novo
initiation. In contradistinction to RQ RNA and its 3

fragment, initiation on these templates occurs without
regard to the 3
-terminal or internal oligo(C) clusters, is
GTP-independent, and does not result in a stable replicative
complex capable of elongation in the presence of
aurintricarboxylic acid. The results suggest that, although
Q
replicase can initiate and elongate on a variety
of RNAs, only some of them are recognized as legitimate
templates. GTP-dependent initiation on a
legitimate template drives the enzyme to a “closed” conformation
that may be important for keeping the template
and the complementary nascent strand unannealed,
without which the exponential replication is
impossible. Triggering the GTP-dependent conformational
transition at the initiation step could serve as a
discriminative feature of legitimate templates providing
for the high template specificity of Q
replicase.

Kết quả (Việt) 2:

Q? replicase (RNA-RNA polymerase đạo của bacteriophage
Q?) theo cấp số khuếch đại một số RNA (RQ
RNA) trong ống nghiệm. Ở đây chúng ta mô tả các thuộc tính mẫu
của 5? và 3? mảnh vỡ thu được bằng cách tách một trong
các RNA như vậy tại một trang web nội bộ. Chúng tôi bất ngờ phát hiện
rằng, bên cạnh 3? fragment, Q? replicase có thể sao chép
5? mảnh và một số biến thể của nó, mặc dù họ
thiếu các khu vực khởi xướng của RQ RNA. Việc sao chép này có thể
xảy ra như là 3? kéo dài -terminal hoặc qua de novo
khởi. Đối chiếu lại với RQ RNA và nó 3?
fragment, khởi về những mẫu này xảy ra mà không
liên quan đến 3? -terminal hoặc nội oligo (C) các cụm, là
GTP-độc lập, và không dẫn đến một ổn định nhân lên
phức tạp có khả năng kéo dài trong sự hiện diện của
axit aurintricarboxylic. Kết quả cho thấy, mặc dù
Q? replicase có thể bắt đầu và kéo dài ra trên một loạt
các RNA, chỉ có một số trong số họ được công nhận là hợp pháp
mẫu. Khởi GTP-phụ thuộc vào một
mẫu hợp pháp thúc đẩy các enzyme để một "khép kín" cấu
có thể quan trọng để giữ cho các mẫu
và các sợi sơ khai bổ sung unannealed,
mà nếu không có sự sao chép hàm mũ là
không thể. Kích hoạt các cấu hình không GTP phụ thuộc vào
quá trình chuyển đổi ở bước khởi đầu có thể phục vụ như là một
tính năng phân biệt các mẫu hợp pháp cung cấp
cho các mẫu đặc hiệu cao của Q? replicase.