Pseudomonas fluorescens Pf-5 is a p

Pseudomonas fluorescens Pf-5 is a plant commensal bacterium that inhabits the rhizosphere and produces secondary metabolites that suppress soilborne plant pathogens. The complete sequence of the 7.1-Mb Pf-5 genome was determined. We analyzed repeat sequences to identify genomic islands that, together with other approaches, suggested P. fluorescens Pf-5's recent lateral acquisitions include six secondary metabolite gene clusters, seven phage regions and a mobile genomic island. We identified various features that contribute to its commensal lifestyle on plants, including broad catabolic and transport capabilities for utilizing plant-derived compounds, the apparent ability to use a diversity of iron siderophores, detoxification systems to protect from oxidative stress, and the lack of a type III secretion system and toxins found in related pathogens. In addition to six known secondary metabolites produced by P. fluorescens Pf-5, three novel secondary metabolite biosynthesis gene clusters were also identified that may contribute to the biocontrol properties of P. fluorescens Pf-5.

Kết quả (Việt) 1:

Pseudomonas fluorescens Pf-5 là một thực vật commensal rằng rhizosphere sinh sống và sản xuất phụ chất ức chế tác nhân gây bệnh thực vật soilborne. Trình tự hoàn chỉnh của Pf 7,1 Mb-5 gen đã được xác định. Chúng tôi phân tích các trình tự lặp lại để xác định các gen đảo, cùng với phương pháp tiếp cận khác, đề nghị P. fluorescens Pf-5 tại bên mua lại bao gồm sáu chất chuyển hóa thứ cấp gen cụm, bảy thực khuẩn vùng và một điện thoại di động gen đảo. Chúng tôi xác định được các tính năng khác nhau đóng góp cho mình lối sống commensal trên thực vật, bao gồm rộng catabolic và vận chuyển các khả năng cho việc sử dụng hợp chất có nguồn gốc thực vật, rõ ràng khả năng sử dụng một sự đa dạng của sắt siderophores, Hệ thống giải độc để bảo vệ từ stress oxy hóa, và sự thiếu hụt một kiểu III Hệ thống bài tiết và độc tố tìm thấy trong các tác nhân gây bệnh có liên quan. Ngoài sáu tiếng Trung chất chuyển hóa được sản xuất bởi P. fluorescens Pf-5, ba chất chuyển hóa thứ cấp tiểu thuyết sinh tổng hợp gen cụm đã được xác định cũng có thể đóng góp vào các thuộc tính biocontrol của P. fluorescens Pf-5.

Kết quả (Việt) 2:

Pseudomonas fluorescens Pf-5 là một commensal vi khuẩn thực vật sinh sống trong vùng rễ và sản xuất các chất chuyển hóa thứ cấp mà ức chế tác nhân gây bệnh soilborne. Các trình tự hoàn chỉnh của 7,1 Mb Pf-5 bộ gen đã được xác định. Chúng tôi đã phân tích trình tự lặp lại để xác định đảo gen đó, cùng với các phương pháp khác, đề nghị P. fluorescens Pf-5 mua bên gần đây bao gồm sáu cụm gen chuyển hóa thứ cấp, bảy khu vực thực khuẩn và một hòn đảo của bộ gen di động. Chúng tôi xác định các tính năng khác nhau mà đóng góp vào lối sống commensal của nó trên thực vật, bao gồm cả khả năng dị hóa và giao thông rộng cho việc sử dụng hợp chất thực vật có nguồn gốc, khả năng rõ ràng để sử dụng đa dạng của siderophores sắt, hệ thống giải độc để bảo vệ khỏi stress oxy hóa, và việc thiếu một hệ thống bài tiết loại III và độc tố được tìm thấy trong các mầm bệnh có liên quan. Ngoài ra đến sáu chất chuyển hóa trung học nổi tiếng được sản xuất bởi P. fluorescens Pf-5, ba cụm gen chuyển hóa sinh tổng hợp thứ tiểu thuyết cũng đã được xác định đó có thể đóng góp vào các tính chất kiểm soát sinh học của P. fluorescens Pf-5.

Kết quả (Việt) 3:

Pseudomonas fluorescens Pf-5 là thực vật cộng sinh vi khuẩn, inhabits điếu tế tạo ra một chất chuyển hóa thứ cấp, ức chế đất truyền mầm bệnh.Chắc chắn rồi. 7.1-mb Pf-5 chuỗi bộ gen đầy đủ.Chúng tôi đã phân tích xác định trình tự lặp đi lặp lại đảo genome, cùng với cách khác, đề nghị P. fluorescens Pf-5 gần nằm ngang mua bán và sáp nhập bao gồm 6 rút ra từ chất chuyển hóa của khu vực 7 cụm gen, vi khuẩn và một di chuyển bộ gen của hòn đảo.Chúng ta đã tìm thấy điểm khác nhau, có ích đối với thực vật cộng sinh sống, bao gồm cả khả năng sử dụng rộng rãi quá trình trao đổi chất và hợp chất của thực vật có nguồn gốc từ vận chuyển, sử dụng đa dạng của hãng sắt sắt Rõ ràng khả năng của hệ thống, giải độc để ngăn ứng kích ôxi hóa, và thiếu một hệ thống phân loại III và độc tố của mình liên quan đến tìm ra tác nhân gây bệnh.Ngoại trừ known six P. fluorescens Pf-5 tạo ra bắt nguồn từ chất chuyển hóa, ba loài bắt nguồn từ chất cụm gen đã thực hiện được xác định, có thể có ích P. fluorescens Pf-5 sinh Performance.