The increased awareness of the role

The increased awareness of the role of environmental matrices in enteric disease transmission has resulted in the need for rapid, field-based methods for fecal indicator bacteria and pathogen detection. Evidence of the specificity of β-glucuronidase-based assays for detection of Escherichia coli from environmental matrices relevant to enteric pathogen transmission in developing countries, such as hands, soils, and surfaces, is limited. In this study, we quantify the false-positive rate of a β-glucuronidase-based E. coli detection assay (Colilert) for two environmental reservoirs in Bangladeshi households (hands and soils) and three fecal composite sources (cattle, chicken, and humans). We investigate whether or not the isolation source of E. coli influences phenotypic and genotypic characteristics. Phenotypic characteristics include results of biochemical assays provided by the API-20E test; genotypic characteristics include the Clermont phylogroup and the presence of enteric and/or environmental indicator genes sfmH, rfaI, and fucK. Our findings demonstrate no statistically significant difference in the false-positive rate of Colilert for environmental compared to enteric samples. E. coli isolates from all source types are genetically diverse, representing six of the seven phylogroups, and there is no difference in relative frequency of phylogroups between enteric and environmental samples. We conclude that Colilert, and likely other β-glucuronidase-based assays, is appropriate for detection of E. coli on hands and in soils with low false-positive rates. Furthermore, E. coli isolated from hands and soils in Bangladeshi households are diverse and indistinguishable from cattle, chicken, and human fecal isolates, using traditional biochemical assays and phylogrouping.

Kết quả (Việt) 1:

Tăng nhận thức về vai trò của các ma trận môi trường trong ruột bệnh truyền tải đã dẫn đến sự cần thiết cho phương pháp nhanh chóng, dựa trên lĩnh vực cho chỉ số phân vi khuẩn và mầm bệnh phát hiện. Bằng chứng về các đặc trưng của β-glucuronidase dựa trên thử nghiệm để phát hiện Escherichia coli từ môi trường ma trận mầm bệnh liên quan đến ruột truyền trong nước đang phát triển, chẳng hạn như bàn tay, đất, và bề mặt, bị hạn chế. Trong nghiên cứu này, chúng tôi định lượng tỷ lệ sai dương tính của một khảo nghiệm phát hiện β-glucuronidase dựa trên E. coli (Colilert) cho hai môi trường hồ chứa ở Bangladesh hộ (bàn tay và đất) và ba phân hỗn hợp nguồn (trâu, bò, gà, và con người). Chúng tôi điều tra hay không nguồn gốc sự cô lập của E. coli ảnh hưởng đến kiểu hình và genotypic đặc điểm. Kiểu hình đặc trưng bao gồm các kết quả của thử nghiệm sinh hóa được cung cấp bởi các bài kiểm tra API-20E; đặc điểm genotypic bao gồm Clermont phylogroup và sự hiện diện của ruột và/hoặc môi trường chỉ số gen sfmH, rfaI, và fucK. Những phát hiện của chúng tôi chứng minh có ý nghĩa thống kê sự khác biệt trong tỷ lệ dương tính giả Colilert cho môi trường so với ruột mẫu. E. coli chủng từ tất cả các loại nguồn di truyền đa dạng, đại diện cho sáu trong số bảy phylogroups, và không có sự khác biệt trong các tần số tương đối của phylogroups giữa mẫu ruột và môi trường. Chúng tôi kết luận rằng Colilert, và có khả năng khác β-glucuronidase dựa trên thử nghiệm, là thích hợp cho các phát hiện của E. coli trên bàn tay và trong đất với tỷ lệ sai tích cực thấp. Hơn nữa, E. coli bị cô lập từ tay và đất ở Bangladesh hộ là đa dạng và không thể phân biệt từ trâu, bò, gà, và chủng phân của con người, bằng cách sử dụng truyền thống sinh hóa thử nghiệm và phylogrouping.

Kết quả (Việt) 2:

Việc nâng cao nhận thức về vai trò của các ma trận môi trường truyền bệnh đường ruột đã dẫn đến nhu cầu, phương pháp trên hiện trường nhanh chóng cho vi khuẩn chỉ thị phân và phát hiện tác nhân gây bệnh. Bằng chứng về tính đặc hiệu của xét nghiệm β-glucuronidase dựa trên phát hiện của Escherichia coli từ ma trận môi trường có liên quan đến truyền mầm bệnh đường ruột ở các nước đang phát triển, chẳng hạn như bàn tay, loại đất, và các bề mặt, bị hạn chế. Trong nghiên cứu này, chúng tôi xác định tốc độ dương tính giả của một β-glucuronidase dựa trên E. coli phát hiện khảo nghiệm (Colilert) cho hai hồ chứa môi trường ở các hộ gia đình Bangladesh (tay và đất) và ba nguồn hỗn hợp phân (bò, gà, và con người ). Chúng tôi điều tra hay không nguồn phân lập E. coli ảnh hưởng kiểu hình và kiểu gen đặc trưng. Đặc điểm kiểu hình bao gồm kết quả của những xét nghiệm sinh hóa được cung cấp bởi các thử nghiệm API-20E; đặc điểm gen bao gồm các phylogroup Clermont và sự hiện diện của đường ruột và / hoặc các gen chỉ thị môi trường sfmH, rfaI, và fuck. Phát hiện của chúng tôi cho thấy có sự khác biệt ý nghĩa thống kê về tỷ lệ dương tính giả của Colilert cho môi trường so với các mẫu ruột. E. coli phân lập được từ tất cả các loại nguồn rất đa dạng về mặt di truyền, đại diện cho sáu trong số bảy phylogroups, và không có sự khác biệt trong tần số tương đối của phylogroups giữa ruột và mẫu môi trường. Chúng tôi kết luận rằng Colilert, và có khả năng xét nghiệm β-glucuronidase dựa trên khác, là thích hợp nhất để phát hiện E. coli trên tay và trong đất với tỷ lệ dương tính giả thấp. Hơn nữa, E. coli phân lập từ tay và đất trong các hộ gia đình Bangladesh rất đa dạng và không thể phân biệt từ gia súc, thịt gà, và phân lập từ phân của con người, bằng cách sử dụng các xét nghiệm sinh hóa truyền thống và phylogrouping.