Development of Tools to Enhance Mol

Development of Tools to Enhance Molecular Breeding in Peanut
Genomic research can provide new tools and resources to revolutionize crop genetic improvement
and production [1]. However, genomic research in peanut (Arachis hypogaea L.) is far behind that in
other crops such as maize, soybean, wheat, sorghum, and potato due to the shortage of essential
genome infrastructure, tools, and resources [2]. As a consequence, peanut has lagged behind other
crops on the use of molecular genetic technology for cultivar development. The early technologies
(isozyme, RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism), AFLP (Amplified Fragment Length
Polymorphism), RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), and SCAR (Sequence Characterized
Amplified Region)) showed extremely low levels of polymorphism in A. hypogaea [3-11]. Those early
struggles have been documented in several excellent reviews [2,12-14]. Recent advances in molecular
genetic technology have allowed researchers to detect more frequent genetic polymorphism. These
efforts have resulted in the construction of moderate density genetic maps for A. hypogaea [15-19]
populated primarily with SSR (simple sequence repeat or microsatellite) markers that contrast with
other PCR-based markers in their largely co-dominant vs. dominant (AFLP, RAPD, and SCAR)
nature. Many of these SSR markers were developed from peanut ESTs (expressed sequence tags).
Because of genome size and complexity, many plant EST libraries have been sequenced as an
alternative to whole genome sequences, including peanut. EST data sets were foundational for
functional genomics during the period when only a few plant genomes were sequenced and before the
development of the second generation of high throughput sequencing technology. ESTs have been
especially important resources for major crops or economically significant plants with large genomes
(such as peanut) to enable gene discovery, gene expression analysis and molecular marker development

Kết quả (Việt) 2:

Phát triển các công cụ để tăng cường nhân giống phân tử trong đậu phộng
nghiên cứu bộ gen có thể cung cấp các công cụ và nguồn lực mới cho cách mạng cải tiến di truyền cây trồng
và sản xuất [1]. Tuy nhiên, nghiên cứu di truyền trong đậu phộng (Arachis hypogaea L.) là xa phía sau rằng trong
cây trồng khác như ngô, đậu tương, lúa mì, lúa miến, khoai tây và do sự thiếu cần thiết
cơ sở hạ tầng hệ gen, công cụ và nguồn lực [2]. Như một hệ quả, đậu phộng đã tụt lại phía sau khác
cây trồng về việc sử dụng công nghệ di truyền phân tử để phát triển cây trồng. Các công nghệ đầu
(isozyme, RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism), AFLP (Amplified Fragment Length
Polymorphism), RAPD (Random Amplified đa hình DNA), và SCAR (Sequence Đặc trưng
Amplified Region)) cho thấy mức độ cực kỳ thấp của đa hình trong A. hypogaea [ 3-11]. Những đầu
cuộc đấu tranh đã được ghi nhận ở một số đánh giá xuất sắc [2,12-14]. Tiến bộ mới trong phân tử
công nghệ di truyền đã cho phép các nhà nghiên cứu để phát hiện tính đa hình di truyền thường xuyên hơn. Những
nỗ lực này đã dẫn đến việc xây dựng bản đồ di truyền mật độ vừa phải cho A. hypogaea [15-19]
dân cư chủ yếu với SSR (lặp lại trình tự đơn giản hoặc microsatellite) đánh dấu tương phản với
các dấu hiệu khác PCR-trụ sở tại của họ phần lớn là đồng trội so với ưu thế (AFLP, RAPD, và SCAR)
thiên nhiên. Nhiều người trong số các điểm đánh dấu SSR được phát triển từ ESTs đậu phộng (tags tự trình bày).
Do kích thước bộ gen và phức tạp, các thư viện EST nhiều nhà máy đã được sắp xếp như một
sự thay thế cho các trình tự bộ gen toàn bộ, bao gồm cả đậu phộng. Bộ dữ liệu EST là nền tảng cho
gen chức năng trong thời gian khi chỉ có một vài bộ gen thực vật đã được giải trình tự và trước khi
phát triển của thế hệ thứ hai của công nghệ giải trình tự thông lượng cao. ESTs đã được
các nguồn lực đặc biệt quan trọng đối với cây trồng chính, cây kinh tế đáng kể với bộ gen lớn
(chẳng hạn như đậu phộng) để cho phép phát hiện gen, phân tích biểu hiện gen và phát triển marker phân tử