Taking these results together, our

Taking these results together, our data suggest that X-ray m-CT
had no or only very little effect on archaeal and bacterial pop-
ulations and may be compatible with soil microbiological experi-
ments. Nevertheless, one has to be aware that short-term shifts
may occur when activity-related parameters such as respiration
rates and enzyme activities are investigated. It was therefore sug-
gested that a time lag of 3 weeks between X-ray m-CT and micro-
biological analyses could be advisable (Bouckaert et al., 2013). For
the experimental setup used in our study, however, no significant
differences in microbial activity, abundance, and community
structure were found directly after scanning and two weeks later in
scanned and control soil samples which indicated that no time lag
was necessary. The opposing evaluation of the impact of X-ray m-CT
on soil microbial populations as reported by Fischer et al. (2013)
may have resulted from the use of different soil microcosms
(2 cm height  20 cmwidth), a lower number of replicates (n ¼ 3),
and potentially higher X-ray doses (Table 1). However, higher
irradiation doses were applied by Bouckaert et al. (2013; ca. 7.5 Gy),
Zappala et al. (2013; 23 Gy), and Kravchenko et al. (2014; 1 kGy)
whose results were in agreement with our study. The prolonged
incubation prior to scanning revealed that time was themain factor
that influenced and altered soil microbial populations in our study
(Fig. 6). This was probably related to changing physicoechemical
parameters within the microbial habitat (i.e. soil microcosm) such
as a rapid decrease of easily decomposable C during incubation
experiments (Sch€ adel et al., 2013).
Aside from prokaryotes, X-ray m-CT has no discernible influence
on the growth and biomass of roots in soil (Flavel et al., 2012;
Zappala et al., 2013), and thus makes it an interesting tool to
investigate interactive processes between active roots and sur-
rounding soil. Contact and air gaps between root and soil have been
visualized via X-ray scanning (Schmidt et al., 2012a; Carminati
et al., 2013) which may lead to a better understanding of flow
processes in the rhizosphere, the micro-habitat with the highest
level of microbial nutrient cycling in soil (Philippot et al., 2009).
Information on soil microbiota within their surrounding micro-
habitat would be extremely powerful to understand the impact of
physical properties onmicrobial functioning in soil and could give a
prime opportunity to explore their ecosystem services. The in situ
detection and visualization of fungi and prokaryotic cells within
soil via X-ray m-CT is hampered by the high electron density of soil
and the low contrast given by biological specimen (Helliwell et al.,
2013; Lilje et al., 2013). Moreover, a direct observation of archaea
and bacteria within undisturbed soil samples via non-invasive
techniques is not yet possible due to limited spatial resolution of
currently available systems (Hallett et al., 2013). Nevertheless, as
the feature recognition of X-ray instruments increases with tech-
nical advance itmay be possible to visualize singlemicrobial cells of
high contrast that have been labeled with heavy metals either by
self-accumulation (O'Donnell et al., 2007) or phylogeny-based
detection (Schmidt et al., 2012b). To investigate the prokaryotic
colonization of soil micro-habitats, their three-dimensional phys-
ical structure could be analyzed via X-ray m-CT followed by resin
impregnation and FISH-based detection of single cells in two-
dimensional soil sections (Eickhorst and Tippk€ otter, 2008). Such
approaches that integrate X-ray m-CT data could give important
information on the conceptions of interactive networks between

Kết quả (Việt) 1:

Dùng những kết quả với nhau, dữ liệu của chúng tôi đề nghị rằng tia x m-CTkhông có hoặc chỉ rất ít tác dụng trên vi khuẩn cổ và vi khuẩn pop -ulations và có thể tương thích với đất vi sinh experi -ments. Tuy nhiên, người ta phải nhận thức được rằng thay đổi ngắn hạncó thể xảy ra khi hoạt động liên quan đến các thông số như hô hấptỷ giá và các hoạt động của enzyme được điều tra. Đó là do đó sug-gested một thời gian lag là 3 tuần giữa tia x m-CT và micro-sinh học phân tích có thể là khuyến khích (Bouckaert et al., năm 2013). ChoCác thiết lập thử nghiệm sử dụng trong nghiên cứu của chúng tôi, Tuy nhiên, không có significantsự khác biệt trong hoạt động của vi khuẩn, phong phú và cộng đồngcấu trúc đã được tìm thấy trực tiếp sau khi quét và hai tuần sau đó trongquét và kiểm soát đất mẫu chỉ định mà không tụt hậu thời gianlà cần thiết. Đối lập đánh giá tác động của tia x m-CTtrên các quần thể vi sinh vật đất theo báo cáo của Fischer et al. (2013)có thể có kết quả từ việc sử dụng đất khác nhau microcosms(2 cm chiều cao 20 cmwidth), một số thấp hơn sao chép (n ¼ 3),và có khả năng cao tia x liều (bảng 1). Tuy nhiên, caoliều chiếu xạ đã được áp dụng bởi Bouckaert et al. (2013; ca. 7,5 Gy),Zappala et al. (2013; 23 Gy) và Kravchenko et al. (2014; 1 kGy)mà kết quả là trong thỏa thuận với nghiên cứu của chúng tôi. Việc kéo dàiấp trứng trước khi quét tiết lộ rằng thời gian là yếu tố themainmà tác và quần thể vi sinh vật đất thay đổi trong nghiên cứu của chúng tôi(Hình 6). Điều này có lẽ liên quan đến thay đổi physicoechemicalCác tham số trong vi sinh vật môi trường sống (tức là đất mô hình thu nhỏ) như vậynhư một sự giảm xuống nhanh chóng dễ dàng decomposable c trong thời gian ủ bệnhthí nghiệm (Sch€ adel et al., năm 2013).Bên cạnh sơ, tia x m-CT đã không nhận thấy influencetốc độ tăng trưởng và nhiên liệu sinh học của rễ trong đất (Flavel et al., năm 2012;Zappala et al., 2013), và do đó làm cho nó một công cụ thú vị đểđiều tra các quá trình tương tác giữa các hoạt động rễ và sur-đất làm tròn. Số liên lạc và không khí khoảng cách giữa các rễ và đất đai đãhình dung thông qua tia x quét (Schmidt et al., 2012a; Carminatiet al., 2013) mà có thể dẫn đến một sự hiểu biết tốt hơn về flowCác quy trình trong rhizosphere, micro-môi trường sống với điểm cao nhấtcấp vi chất dinh dưỡng đi xe đạp trong đất (Philippot et al., 2009).Thông tin về đất microbiota trong vòng của họ xung quanh micrositemôi trường sống sẽ là cực kỳ mạnh mẽ để hiểu tác động củatính chất vật lý onmicrobial hoạt động trong đất và có thể cung cấp cho mộtnguyên tố cơ hội để khám phá các dịch vụ hệ sinh thái của họ. Tại chỗphát hiện và hình dung của nấm và các tế bào định trong vòngđất qua tia x m-CT bị cản trở bởi mật độ cao điện tử của đấtvà độ tương phản thấp được đưa ra bởi các mẫu vật sinh học (Helliwell et al.,năm 2013; Lilje et al., năm 2013). Hơn nữa, một sự quan sát trực tiếp của vi khuẩn cổvà vi khuẩn bên trong các mẫu đất không bị ảnh hưởng thông qua không xâm lấnkỹ thuật là không được có thể do phân giải không gian giới hạnHệ thống hiện có sẵn (Hallett và ctv., năm 2013). Tuy nhiên, như làcông nhận tính năng của thiết bị x-quang tăng với công nghệ cao-nical advance itmay có thể hình dung singlemicrobial tế bào củađộ tương phản cao đã được gắn nhãn với nặng kim loại hoặc bằngtự tích lũy (O'Donnell và ctv., 2007) hoặc dựa trên phát sinh loàiphát hiện (Schmidt và ctv., 2012b). Để điều tra các địnhthực dân hoá đất micro-môi trường sống, của phys ba chiều-iCal cấu trúc có thể được phân tích qua tia x m-CT sau bằng nhựangâm, tẩm và CÁ dựa trên các phát hiện của các tế bào duy nhất trong hai-chiều đất phần (Eickhorst và Tippk€ otter, 2008). Như vậyphương pháp tiếp cận tích hợp dữ liệu m-CT dùng x-quang có thể cung cấp cho quan trọngthông tin về quan niệm của các mạng lưới tương tác giữa

Kết quả (Việt) 2:

Lấy các kết quả với nhau, dữ liệu của chúng tôi cho thấy rằng X-ray m-CT
không có hoặc chỉ có rất ít ảnh hưởng pop- archaea và vi khuẩn
ulations và có thể tương thích với các thí nghiệm vi sinh vật đất
ments. Tuy nhiên, người ta phải nhận thức được rằng sự biến đổi ngắn hạn
có thể xảy ra khi các thông số hoạt động liên quan như hô hấp
giá và các hoạt động enzyme được điều tra. Do đó, nó là sug-
gested đó một khoảng thời gian 3 tuần giữa X-ray m-CT và vi
phân tích sinh học có thể được khuyến khích (BOUCKAERT et al., 2013). Đối với
các thiết lập thí nghiệm được sử dụng trong nghiên cứu của chúng tôi, tuy nhiên, không có trọng yếu
sự khác biệt trong hoạt động của vi sinh vật, sự phong phú, và cộng đồng
cấu trúc được tìm thấy trực tiếp sau khi quét và hai tuần sau đó trong
mẫu quét và kiểm soát đất trong đó chỉ ra rằng không có độ trễ thời gian
là cần thiết. Việc đánh giá đối về tác động của tia X m-CT
về quần thể vi sinh đất theo báo cáo của Fischer et al. (2013)
có thể là kết quả của việc sử dụng các microcosms khác nhau đất
(2 cm chiều cao? 20 cmwidth), một số lượng thấp của lần lặp lại (n ¼ 3),
và liều X-ray có khả năng cao hơn (Bảng 1). Tuy nhiên, cao hơn
liều chiếu xạ đã được áp dụng bởi BOUCKAERT et al. (2013; ca. 7,5 Gy),
Zappala et al. (2013; 23 Gy), và Kravchenko et al. (2014; 1 kGy)
mà kết quả là trong thỏa thuận với nghiên cứu của chúng tôi. Việc kéo dài
ủ trước khi quét tiết lộ thời điểm đó là yếu tố themain
rằng trong chịu ảnh hưởng và các quần thể vi sinh vật đất bị thay đổi trong nghiên cứu của chúng tôi
(Hình. 6). Điều này có lẽ là liên quan đến việc thay đổi physicoechemical
thông số trong môi trường sống của vi sinh vật (tức là mô hình thu nhỏ của đất) như vậy
là giảm nhanh chóng của cách dễ dàng phân huỷ trong C trong ủ
thí nghiệm (Sch € adel et al., 2013).
Ngoài prokaryote, X-ray m-CT không có thể nhận thấy rõ trong fl ảnh hướng
đến sự phát triển và sinh khối rễ trong đất (Flavel et al, 2012;.
. Zappala et al, 2013), và do đó làm cho nó trở thành một công cụ thú vị để
điều tra các quá trình tương tác giữa rễ tích cực và bề
tròn đất. Liên hệ và không khí khoảng cách giữa rễ và đất đã được
hình dung qua quét X-ray (Schmidt et al, 2012a;. Carminati
et al, 2013). Mà có thể dẫn đến một sự hiểu biết tốt hơn về ow fl
quy trình trong vùng rễ, các vi-môi trường sống với cao nhất
mức độ chu kỳ dinh dưỡng của vi sinh vật trong đất (Philippot et al., 2009).
Thông tin về hệ vi sinh vật đất trong vi xung quanh họ
môi trường sống sẽ là vô cùng mạnh mẽ để hiểu tác động của
tính chất vật lý onmicrobial hoạt động trong đất và có thể cung cấp một
cơ hội để thủ khám phá các dịch vụ hệ sinh thái của họ. Các tại chỗ
phát hiện và trực quan của nấm và các tế bào prokaryote trong
đất thông qua X-ray m-CT bị cản trở bởi mật độ electron cao của đất
và độ tương phản thấp do mẫu vật sinh học (Helliwell et al,.
2013;. Lilje et al, năm 2013). Hơn nữa, một quan sát trực tiếp của vi khuẩn cổ
và vi khuẩn trong mẫu đất nguyên qua không xâm lấn
kỹ thuật chưa thể do độ phân giải không gian hạn chế của
hệ thống hiện đang có sẵn (Hallett et al., 2013). Tuy nhiên, như
việc công nhận tính năng của các công cụ X-ray tăng với kỹ
trước nical itmay có thể hình dung các tế bào singlemicrobial của
tương phản cao đã được dán nhãn với các kim loại nặng hoặc bằng cách
tự tích lũy (O'Donnell et al., 2007) hoặc phát sinh loài dựa trên
phát hiện (Schmidt et al., 2012b). Để điều tra các prokaryote
thực dân của đất vi môi trường sống, phys- ba chiều của
cấu trúc ical có thể được phân tích thông qua X-ray m-CT tiếp theo nhựa
tẩm và phát hiện FISH dựa trên các tế bào đơn lẻ trong hai
phần đất chiều (Eickhorst và Tippk € rái cá, 2008). Như
phương pháp tiếp cận tích hợp dữ liệu tia X m-CT có thể cho quan trọng
thông tin về các khái niệm về mạng lưới tương tác giữa