III. RecA Filament StructureCatalys

III. RecA Filament Structure

Catalysis of homologous recombination by RecA begins with the formation of a filament composed of RecA monomers around ssDNA. The RecA filament wraps around the DNA helically, with 6 monomers per revolution. The RecA helix is approximately 120 Å wide, with a central diameter of 25 Å. The carboxy termini of each monomer, which are believed to be important in interfilament interactions, project outward from the RecA helix. ATP is bound near the center of the helix. The amino domain of each RecA monomer is involved in maintaining the RecA polymer bonds. As described in the structural overview section, this region of the monomer contains a protruding a/ b unit .

The polymerization of RecA monomers into filaments involves extensive association of the amino domain of one monomer and the central domain of the next monomer in the filament (with a loss of 2,890 Å 2 of solvent-accessible surface area/monomer). This association can be visualized in a RecA dimer. Part of the subunit interface involves the packing of the amino a helix of one monomer between a complementary a helix and b sheet in the central domain of a neighboring monomer. Thus, the RecA filament has an amino domain-to-central domain polarity. The monomers are held together by a combination of hydrophobic and electrostatic interactions.

Experimental evidence supports the crystallographic data. Filament formation, for example, is severely inhibited among RecA monomers in which the amino terminal has been enzymatically removed. Similarly, proteins consisting only of the amino portion of RecA prevent polymerization via competitive inhibition of the central domain binding region. Mutation analyses have been used to identify residues at the subunit interface critical for RecA polymerization. Monomers in which lysine, phenylalanineor arginineare replaced by other amino acids are unable to polymerize.

Kết quả (Việt) 1:

III. RecA Filament cấu trúcXúc tác tương đồng gen bởi RecA bắt đầu với sự hình thành của một sợi bao gồm RecA monome xung quanh thành phố ssDNA. Dây tóc RecA kết thúc tốt đẹp xung quanh thành phố DNA helically, với 6 monome cho một cuộc cách mạng. RecA xoắn là khoảng 120 Å rộng, với một trung tâm đường kính của 25 Å. Termini carboxy của mỗi monomer, mà được cho là quan trọng trong tương tác interfilament, dự án ra nước ngoài từ RecA xoắn. ATP là ràng buộc gần trung tâm của xoắn. Miền mỗi monomer RecA, amino là có liên quan trong việc duy trì trái phiếu polymer RecA. Như được mô tả trong phần tổng quan về cấu trúc, khu vực này của monomer chứa một nhô ra một / b đơn vị. Trùng hợp RecA monome vào sợi liên quan đến các Hiệp hội rộng lớn của vùng amino một monomer và miền trung của monomer tiếp theo trong dây tóc (với một mất mát của 2.890 2 Å của dung môi có thể truy cập khu vực bề mặt/monomer). Hiệp hội này có thể được hình dung trong một dimer RecA. Một phần của giao diện tiểu đơn vị liên quan đến việc đóng gói amino một xoắn ốc của một monomer giữa một bổ sung một tờ xoắn và b thuộc phạm vi trung tâm của một monomer giáp ranh Vì vậy, dây tóc RecA có một phân cực amino miền trung ương tên miền. Các monome được tổ chức với nhau bởi một sự kết hợp của tương tác kỵ nước và điện. Bằng chứng thực nghiệm hỗ trợ dữ liệu crystallographic. Hình thành sợi, ví dụ, là bị ức chế trong số RecA monome trong đó nhà ga amino đã bị loại bỏ enzymatically. Tương tự, bao gồm chỉ của phần RecA, amino protein ngăn chặn trùng hợp thông qua sự ức chế cạnh tranh của vùng Trung tâm miền ràng buộc. Phân tích đột biến đã được sử dụng để xác định các dư lượng tiểu đơn vị giao diện rất quan trọng cho RecA trùng hợp. Monome trong đó lysine, phenylalanineor arginineare thay thế axit amin khác là không thể polymerize.

Kết quả (Việt) 2:

III. RecA Filament cấu Xúc tác tái tổ hợp tương đồng bằng RecA bắt đầu với sự hình thành của một sợi gồm RecA monome quanh ssDNA. Các sợi RecA kết thúc tốt đẹp xung quanh helically DNA, với 6 monome mỗi cuộc cách mạng. Các RecA xoắn là khoảng 120 Å rộng, với đường kính trung ương của 25 Å. Các trạm cuối carboxy của mỗi monomer, được cho là quan trọng trong tương tác interfilament, dự án ra nước ngoài từ các chuỗi xoắn RecA. ATP là ràng buộc gần trung tâm của đường xoắn ốc. Các tên miền của mỗi amino monomer RecA được tham gia trong việc duy trì trái phiếu polymer RecA. Như đã mô tả trong phần tổng quan về cấu trúc, khu vực này của các monomer chứa một nhô ra một đơn vị / b. Các phản ứng trùng hợp của RecA monome thành các sợi liên quan đến hiệp hội rộng lớn của miền amin của một monomer và miền trung của các monomer tiếp theo trong dây tóc ( với mức lỗ 2,890 Å 2 diện tích bề mặt dung môi có thể truy cập / monomer). Hiệp hội này có thể được hình dung trong một dimer RecA. Một phần của giao diện tiểu đơn vị liên quan đến việc đóng gói của các amino một chuỗi xoắn của một monomer giữa một bổ sung một chuỗi xoắn và b tờ trong lĩnh vực trung tâm của một monomer lân cận. Như vậy, các sợi RecA có một amino miền-to-trung tâm cực miền. Các đơn phân liên kết với nhau bởi một sự kết hợp của các tương tác kỵ nước và điện. Bằng chứng thực nghiệm hỗ trợ các dữ liệu tinh thể. Hình thành sợi, ví dụ, là ức chế nghiêm trọng trong RecA monome trong đó các thiết bị đầu cuối amin đã được gỡ bỏ enzym. Tương tự như vậy, các protein chỉ có duy nhất phần amino của RecA ngăn chặn trùng thông qua ức chế cạnh tranh của khu vực miền trung ràng buộc. Phân tích đột biến đã được sử dụng để xác định dư lượng tại giao diện tiểu đơn vị quan trọng cho RecA trùng hợp. Monome trong đó lysine, phenylalanineor arginineare thay thế bởi các axit amin khác không thể polymerize.