Next, altered Fig. 1. Expression pr

Next, altered Fig. 1. Expression profile of cDNA fragments revealed by cDNA-AFLP with the primer set TaqI + AT and AseI + CG. Rice caryopses were sampled from both XN0437T and
XN0437S after 3, 6, 9, 24, 48, and 72 h of high-temperature stress. cDNA-AFLP was used to obtain the differential expression profiles. “M” indicates DNA marker (unit: bp).


expression patterns were further compared between XN0437T and XN0437S, and the TDFs that were present in XN0437T but com- pletely absent from XN0437S (qualitative variants) and those that showed differential expression patterns for two or more points in time (quantitative variants) were selected for further analysis. Eight genes with differential expression profiles in XN0437T and XN0437S are given as an example in Fig. 2. A total of 71 TDFs were chosen. Of these, 57 were eluted from gels, re-amplified, and cloned, and then 54 were successfully sequenced. All of the 54 sequenced TDFs were renamed and submitted to the ESTs database (GenBank IDs: HS586554–HS586607).


3.3. Function classification and expression profile analysis

Twenty-eight of the 54 TDFs showed significant homology with genes of known function (Table 1). Based on the functions of their homologous genes, the 28 genes were classified into eight groups: seven (13.0%, a total of 54 genes) genes were found likely to be involved in metabolism and another seven (13.0%) in biosynthesis, five (9.2%) in transport, six (11.1%) in transcriptional regulation, two (3.7%) in oxidation, and one (1.9%) in signal transduction. Of the 28 genes, 16 genes were up-regulated and 10 down-regulated at two or more time points in both XN0437T and XN0437S. Two

genes were up-regulated only in XN0437T. They were involved in energy metabolism (OsRH12) and transport (OsRH42).

Kết quả (Việt) 2:

Tiếp theo, thay đổi hình. 1. Biểu hiện pro fi le của mảnh cDNA tiết lộ bởi cDNA-AFLP với bộ mồi TaqI + AT và ASEI + CG. Caryopses Rice đã được lấy mẫu từ cả XN0437T và
XN0437S sau 3, 6, 9, 24, 48, và 72 h của stress nhiệt độ cao. cDNA-AFLP đã được sử dụng để có được những biểu hiện khác biệt pro fi les. "M" chỉ đánh dấu DNA (đơn vị: bp). các mẫu biểu được tiếp tục so sánh giữa XN0437T và XN0437S, và TDFs đã có mặt trong XN0437T nhưng đồng pletely vắng mặt XN0437S (biến tính) và những biểu hiện cho thấy mô hình khác biệt cho hai hoặc nhiều điểm hơn trong thời gian (biến thể định lượng) đã được lựa chọn để phân tích thêm. Tám gen có biểu hiện khác biệt pro fi les trong XN0437T và XN0437S được đưa ra như một ví dụ trong hình. 2. Tổng cộng có 71 TDFs đã được lựa chọn. Trong số này, 57 được tách rửa từ gel, re-ampli fi ed, và nhân bản vô tính, và sau đó 54 đã được lập trình tự thành công. Tất cả 54 TDFs trình tự đã được đổi tên và nộp cho cơ sở dữ liệu ESTs (GenBank ID: HS586554-HS586607). 3.3. Chức năng phân loại fi cation và biểu pro fi le phân tích Hai mươi tám của 54 TDFs cho thấy trong yếu fi không thể tương đồng với gen chức năng được biết đến (Bảng 1). Căn cứ chức năng của các gen tương đồng của họ, 28 gen này đã phân loại fi ed thành tám nhóm: bảy (13.0%, tổng cộng 54 gen) gen đã được tìm thấy có khả năng được tham gia vào quá trình chuyển hóa và một bảy (13.0%) trong quá trình tổng hợp, fi ve ( 9,2%) trong giao thông vận tải, sáu (11,1%) trong quy chế phiên mã, hai (3,7%) trong quá trình oxy hóa, và một (1,9%) trong truyền tín hiệu. Trong 28 gen, 16 gene được up-quy và 10 down-regulated tại hai hoặc nhiều hơn các thời điểm trong cả XN0437T và XN0437S. Hai gen này đã up-quy chỉ trong XN0437T. Họ đã tham gia vào quá trình chuyển hóa năng lượng (OsRH12) và giao thông vận tải (OsRH42).