Tạp chí Châu Phi của vi sinh vật học nghiên cứu tập 6(20), pp. 4256-4260, 30 tháng năm, năm 2012 có sẵn trực tuyến tại http://www.academicjournals.org/AJMRDOI: 10.5897/AJMR11.651ISSN 1996-0808 © 2012 học tạp chíChiều dài đầy đủ nghiên cứu giấyTác dụng của bức xạ tia cực tím-C (UV-C) trên biểu hiện gen virulence ở Vibrio parahaemolyticus và Vibrio alginolyticusRihab Lagha1 #, Fethi Ben Abdallah1, 2 * #, Ali Ellafi1, Héla Kallel2 và Amina Bakhrouf11Laboratoire d'Analyse, Traitement et Valorisation des Polluants de l'Environnement et des Produits, Faculté de Pharmacie Rue Avicenne. Monastir 5000, Tunisie.2Unité de lên men et de Développement de Vaccins Virologiques, Institut Pasteur de Tunis.13 đặt Pasteur, 1002, Tunisie.Được chấp nhận ngày 27, 2011Trong nghiên cứu, Vibrio parahaemolyticus và Vibrio alginolyticus, biển thực phẩm tác nhân gây bệnh, đã được điều trị bằng bức xạ tia cực tím-C (UV-C) (240 J.m-2) để đánh giá các thay đổi trong mức độ biểu hiện gen virulence của họ. Trước hết, chúng tôi tìm kiếm sự hiện diện của tám Vibrio cholerae virulence gen, toxR,toxS, toxRS, ctxA, zot, ace, toxT, và virulence bài đảo (VPI), trong bộ gen của tra chủng. Sự biểu hiện của gen toxR và toxS trong vi khuẩn UVC chiếu xạ, nghiên cứu phản ứng chuỗi trùng hợp ngược, đã được tìm thấy được thay đổi. Những biến thể này được thể hiện bởi tăng hoặc giảm mức độ biểu hiện của gen thử nghiệm virulence. Hơn nữa, số lượng mRNA VPI và ace gen vẫn ổn định sau khi điều trị.Từ khóa: Vibrio, tia cực tím-C (UV-C), thay đổi, biểu hiện gen virulence, RT-Đảng Cộng sản Romania.GIỚI THIỆU Bức xạ tia cực tím-C (UV-C) đã được đề xuất là một trong những cách thức thành công khử trùng để xử lý nước. Vì vậy, UV-khử trùng đã trở thành một giải pháp thực tế cho an toàn khử trùng nước (Said và ctv., 2010). Hiệu quả của UV ánh sáng trong sinh học inacti-vation phát sinh chủ yếu từ thực tế rằng Deoxyribonucleic acid (DNA) phân tử hấp thụ tia UV photon giữa 200 và 300 nm, với đỉnh hấp thụ tại 254 nm (Jeffrey và ctv., 1990). Hấp thu này tạo ra thiệt hại trong DNA bằng cách thay đổi các nucleotide cơ sở ghép nối, do đó việc tạo ra mối liên kết mới giữa liền kề nucleotide trên chuỗi ADN cùng. Thiệt hại này xảy ra đặc biệt là giữa pyrimidine căn cứ. Hai loại mutagenic tổn thương trong DNA đã được xác định: cyclobutan pyrimidine dimer (CPD) hình thành giữa các vị trí C-4 và C-5 của liền kề * Tác giả tương ứng. E-mail: fetyben@yahoo.fr. Điện thoại: + 21 6 73 466 244. Số Fax: + 216 73 461 830.# Các tác giả đã đều góp phần vào công việc này thymidine hoặc cytosine dư lượng và pyrimidine (6-4) pyrimidone (6-4) photoproducts được thành lập giữa vị trí C6 và C4 của dư lượng liền kề pyrimidine, thường xuyên nhất giữa dư lượng T-C và C-C (Zimmer và Slawson, 2002). Tia cực tím trong khoảng 250 đến 260 nm là nguy hiểm để hầu hết vi sinh vật, bao gồm cả vi khuẩn, vi rút, động vật nguyên sinh, mycelial nấm, nấm men và tảo. Trong số các vi khuẩn, V. alginolyticus và V. parahaemolyticus, mầm bệnh thực phẩm biển, thường xuyên tham gia vào epizootic dịch trong văn hóa gilt đầu biển bream và biển bass, gây ra tỷ lệ tử vong cá ở trang trại nuôi trồng thủy sản Tunisia (Abdallah và ctv., 2009a). Trong môi trường biển, V. alginolyticus và V. parahaemolyticus được coi là một hồ chứa nước quan trọng của Vibrio cholerae virulence gen (Abdallah và ctv., 2009b). Theo Boyd et al. (2000) những gen có thể được theo chiều ngang chuyển sang V. alginolyticus trong một môi trường thuỷ sản. Thật vậy, tính di động của virulence gen có thể gây ra sự chuyển đổi của gây bệnh không căng thẳng đến căng thẳng gây bệnh. Xie et al. (2005) báo cáo rằngV. alginolyticus thường có lớn của V. parahaemolyticus và V. cholerae virulence gen như vậy Abdallah et al. 4257 như toxR, tlh và VPI, gợi ý rằng V. alginolyticus có thể là một hồ chứa nước quan trọng của nhiều được biết đến virulence gen của loài Vibrio khác trong môi trường thuỷ sản. Nó có lẽ là môi trường thuỷ sản cảng khác nhau liên quan đến virulence gen rải rác giữa các môi trường Vibrios.Trong công việc này chúng tôi tìm kiếm, bằng phản ứng chuỗi polymerase (PCR), sự hiện diện của tám V. cholerae virulence gen, toxR, toxS, toxRS, ctxA, zot, ace, toxT, và virulence bài đảo (VPI), trong bộ gen của V. alginolyticus và V. parahaemolyticus chủng. Mức độ biểu hiện của virulence chuyển gen dưới chiếu xạ UVC đạt được bằng phản ứng chuỗi trùng hợp ngược (RT-Đảng Cộng sản Romania).VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁPCác chủng vi khuẩnSáu Vibrio chủng đã được sử dụng trong nghiên cứu này bao gồm ba tham khảo chủng: V. alginolyticus ATCC 33787 (S1), V. alginolyticus ATCC 17749 (S2) và V. parahaemolyticus ATCC 17802 (S5). Ngoài ra, V. parahaemolyticus căng thẳng (S6), bị cô lập từ cửa sông Calich (Alghero, ý), và hai V. alginolyticus chủng (S3 và S4) bị cô lập, tương ứng từ các cơ quan nội tạng của cá vền biển aquacultured bệnh gilthead (Sparus aurata) và biển bass (Dicentrarchus labrax), tại trang trại nuôi trồng thủy sản Tunisia (Abdallah et al., 2009a), đã được bao gồm trong công việc này.Điều trị UVCV. alginolyticus và V. parahaemolyticus được trồng ở 30° C trong Tryptic đậu nành canh 1% NaCl (TSB 1%) với lắc (150 vòng/phút). Các nền văn hóa của Vibrio chủng phát triển đến cuối đăng nhập giai đoạn (OD600 = 0,6) đã được pha loãng và lây lan trên Tryptic đậu nành 1% NaCl (TSA 1%, Pronadisa, Tây Ban Nha) agar tấm kính Petri món ăn. Sau khi 18 h ấp ở 30° C, vi khuẩn thuộc địa xuất hiện trên các tấm đã tiếp xúc, trong triplicate, để UV ánh sáng theo phương pháp mô tả trước đó (Wang et al, 2004). Tấm với thậm chí vi khuẩn phát triển đã được bảo hiểm với một mảnh thủy tinh cho điều trị UV. Tấm (được bảo hiểm và không được bảo hiểm) đã tiếp xúc với một đèn UV 4-W với bước sóng của 254 nm. Ứng dụng liều là 240Joules m-2. Sau khi tiếp xúc, 250 ml Erlenmeyer bình chứa 100 ml TSB 1% đã được tiêm chủng với một loopful thuộc địa từkiểm soát và UV điều trị vi khuẩn. Tất cả bình bị giữ ở lúc-30° C cho 18 h với lắc một.Đảng Cộng sản Romania phát hiện của Vibrio cholerae virulence gen trong V. alginolyticus và V. parahaemolyticus chủngVi khuẩn được nuôi cấy trên TSA 1% cho 24 h 30° C. Một thuộc địa được nuôi cấy trong TSB 1% cho 24 h 30° C, và 1.5 mL là cen-trifuged. DNA được chiết xuất bằng cách sử dụng một gen làm sạch kit Wizard (Promega, Madison, WI) theo hướng dẫn của nhà sản xuất. Lớp lót của V. cholerae virulence gen được sử dụng trong nghiên cứu này (Sechi và ctv., 2000) được liệt kê trong bảng 1. Phản ứng chuỗi polymerase (PCR) đã được thực hiện trong 25 ML có chứa 50 của chiết xuất DNA, 5 ml xanh đi Taq đệm (5 ×), 0,25 ml mỗi deoxynucleoside triphosphate (10 mM), cách 0.5 ml MgCl2 (50 mM), 1Ml của mỗi mồi (25 pM), và 1U đi Taq DNA polymerase(Promega). Phản ứng hỗn hợp đã được ủ trong 5 phút tại 94° C; tiếp nối bởi 35 chu kỳ tại 94° C cho 45 s; làm cho deo tại 52° C cho 45 s cho toxS, toxR, và virulence bài đảo (VPI); 72° C cho 1 phút; và một phần mở rộng cuối cùng tại 72° C trong 10 phút. Nhiệt độ tôi để phát hiện các gen toxRS và toxT là 58° C, trong khi đối với ctxA, ace, và zot nhiệt độ là 60° C. Đảng Cộng sản Romania sản phẩm (5 ml) được phân tích trên 1% agarose gel nhuộm màu với ethidium bromua (0,5 mg/mL) tại 90 V cho 1 h và xem dưới tia cực tím transillumination. Tất cả các chủng PCR-tích cực, chỉ ra sự hiện diện của các gen virulence, đã được xác nhận bằng cách lặp lại Đảng Cộng sản Romania ba lần.RT-PCR Addon biểu hiện gen virulenceĐể nghiên cứu mức độ biểu hiện của V. alginolyticus và V. parahaemolyticus virulence gen trước và sau khi bức xạ UV, bán định lượng RT-PCR phương pháp được sử dụng. RNA từ kiểm soát và chiếu xạ tế bào được chiết xuất bởi SV tất cả RNA cô lập hệ thống (Promega) theo hướng dẫn của nhà sản xuất. RNA được định lượng bởi Ultraspec phối (Ultraspec 2100 chuyên nghiệp; Amersham Biosciences Europe GmbH, Pháp). RT-PCR làthực hiện trong triplicate bằng cách sử dụng SuperScriptTM One-Bước RT-PCR vớiBạch kim ® Taq bộ theo các nhà sản xuất recom-mendations (Invitrogen, Carlsbad, CA). Cho tổng hợp cDNA, 100 của RNA làm mẫu. Đảng Cộng sản Romania RT (khối lượng phản ứng 25 ml) làthực hiện như sau: 50° C trong 30 phút; 94° C cho 2 phút; 35 chu kỳ tại 94° C cho 45 s; làm cho deo tại 52° C cho 45 s cho toxS, toxR, và VPI; 72° C cho 1 phút; và một phần mở rộng cuối cùng tại 72° C trong 10 phút. Nhiệt độ tôi cho ace gen là 60° C. Đảng Cộng sản Romania RT sản phẩm (5Ml) được phân tích trên 1% agarose gel nhuộm màu với ethidium bromua (0,5 mg/mL) tại 90 V cho 1 h và xem dưới tia cực tím transillumination. Các sản phẩm khuếch đại được chụp ảnh và kích thước xác định với 100 bp kích thước phân tử đánh dấu (Promega). Phân tích định lượng của DNA ban nhạc được thực hiện bằng cách sử dụng phần mềm hình ảnh (gen công cụ, Sygene, Vương Quốc Anh).KẾT QUẢVirulence gen biểu hiệnĐảng Cộng sản Romania các khuếch đại của tám V. cholerae virulence gen trong tra Vibrio chủng cho thấy rằng chỉ V. alginolyticus (S1 và S3) và V. parahaemolyticus (S5 và S6) đã tích cực cho toxR và toxS gen. Ngoài ra, V. alginolyticus S3, và S4 là tích cực cho VPI và ace gen, tương ứng.Mức độ biểu hiện của gen được phát hiện trước khi và sau khi điều trị với UVC chiếu xạ đã được phân tích bán định lượng RT-Đảng Cộng sản Romania (hình 1). Sau khi điều trị, chúng tôi quan sát thấy một sự giảm xuống trong mức độ biểu hiện của toxS gen trong V. parahaemolyticus (S6) bị cô lập từ cửa sông Calich. Ngoài ra, mức độ biểu hiện của gen toxR được giảm trong V. parahaemolyticus S6 nhưng nó đã được tăng lên trong V. alginolyticus S3. Hơn nữa, số lượng mRNA VPI và ace gen vẫn ổn định ở V. alginolyticus chủng S3, và S4, tương ứng.THẢO LUẬNKết quả phát triển trong công việc này cho thấy nhiều phổ biến trong số V. alginolyticus và V. parahaemolyticus khác nhau V. cholerae virulence gen 4258 Afr. J. Microbiol. Res.Bảng 1. Đảng Cộng sản Romania chất nền, mồi sele
đang được dịch, vui lòng đợi..
