High antigenic variability in the e

High antigenic variability in the envelope protein of Dengue virus (DENV) has been the major problem in designing vaccines that can effectively combat different virus strains. In this study, a computational approach was adopted to identify and analyze evolutionary highly conserved amino acid sequences of the DENV envelope protein, with a focus on sequences of 9 amino acids or more, and thus immune-relevant as T-cell determinants. Different bioinformatics tools were used for revealing conserved regions in the dengue virus envelope protein and constructing the phylogenetic tree from the sequence database. The tools also rendered the prediction of immunogenicity to the proposed “in silico” vaccine targets. 2 peptide regions of at least 9 amino acids were highly conserved and identical in more than 95% of all collected DENV sequences. Both of them was found to be immune-relevant by their correspondence to known or putative HLArestricted T cell determinants. The conservation of these sequences through the entire analysis of this study supports their potential as candidates for further wet laboratory experiments

Kết quả (Việt) 1:

Sự biến đổi kháng nguyên cao trong protein phong bì của Dengue virus (DENV) đã là các vấn đề lớn trong việc thiết kế các vắc xin có thể có hiệu quả chống lại các chủng virus khác nhau. Trong nghiên cứu này, một cách tiếp cận tính toán đã được phê chuẩn để xác định và phân tích tiến hóa các acid amin bảo tồn cao trình tự của các protein phong bì DENV, với một tập trung vào trình tự axit amin 9 hoặc nhiều hơn, và do đó miễn dịch có liên quan là yếu tố quyết định T-cell. Công cụ tin sinh học khác nhau đã được sử dụng cho tiết lộ các khu vực bảo tồn trong protein phong bì virus sốt xuất huyết và xây dựng các cây phát sinh loài từ cơ sở dữ liệu trình tự. Các công cụ cũng trả lại dự đoán của immunogenicity để đề xuất "trong silico" vắc xin tiêu. 2 khu vực peptide của ít nhất 9 axit amin là giống hệt nhau trong hơn 95% của tất cả các trình tự DENV thu thập và bảo tồn cao. Cả hai người trong số họ được tìm thấy là có liên quan miễn dịch bởi tương ứng của họ để biết hoặc giả định HLArestricted T tế bào yếu tố quyết định. Bảo tồn các trình tự thông qua việc phân tích toàn bộ của nghiên cứu này hỗ trợ khả năng của mình như ứng cử viên cho biết thêm ướt thí

Kết quả (Việt) 2:

biến đổi kháng nguyên cao trong protein vỏ của virus Dengue (DENV) đã được các vấn đề lớn trong việc thiết kế loại vắc-xin có hiệu quả có thể chống lại các chủng virus khác nhau. Trong nghiên cứu này, một phương pháp tính toán đã được áp dụng để xác định và phân tích trình tự axit amin được bảo tồn tiến hóa của vỏ protein DENV, với một tập trung vào trình tự của 9 axit amin hoặc nhiều hơn, và do đó miễn dịch có liên quan như yếu tố quyết định T-cell. công cụ tin sinh học khác nhau đã được sử dụng để tiết lộ các khu vực được bảo tồn trong phong bì protein virus dengue và xây dựng cây phát sinh loài từ các cơ sở dữ liệu chuỗi. Các công cụ này cũng khiến cho dự đoán của miễn dịch cho "trong silico" mục tiêu văcxin đề xuất. 2 vùng peptide của ít nhất 9 axit amin là cao được bảo tồn và giống hệt nhau trong hơn 95% của tất cả các trình tự DENV thu. Cả hai đã được tìm thấy là miễn dịch có liên quan bằng thư từ của họ để các yếu tố tế bào đã biết hoặc giả định HLArestricted T. Việc bảo tồn những trình tự thông qua toàn bộ phân tích của nghiên cứu này hỗ trợ tiềm năng của họ như là ứng cử viên cho các thí nghiệm trong phòng thí nghiệm ướt thêm