A. thaliana is one of the leading m

A. thaliana is one of the leading model organisms for genetic and molecular biology studies. Proteomic analysis on this model plant has been performed on different organs, tissues, organelles, and under various developmental stages and environmental conditions (see other chapters in this volume). However, investigations focused on development of the male gametophyte are still scarce in A. thaliana due to difficulties with sample collection and purification. First, Mayfield et al. (2001) used cyclohexane to extract proteins from the pollen coat of A. thaliana and identified 12 proteins, mainly oleosins and lipases. Later, Holmes-Davis et al. (2005) applied multiple protein extraction techniques followed by 2-DE and ESI-MS/MS, leading to the identification of 135 distinct proteins from a total number of 179 protein spots. Of these 135 proteins, most were involved in metabolism (20%), energy production (17%), or cell structure (12%). The authors quantified the protein spots in these three latter categories and compared normalized protein volumes to their corresponding mRNA signals in the transcriptome. The data revealed the surprising result that highly represented mRNAs corresponded to low-abundant proteins while mRNAs that were less abundant encoded some of the more abundant proteins, thus indicating an inverse relationship between mRNA and protein levels. Overall, the Arabidopsis pollen proteome preferentially contained cell wall and cytoskeletal proteins. These results are similar to those obtained in transcriptomic studies, and support the idea that, in addition to mRNAs, the mature pollen grain contains ready-made proteins that are necessary for germination and rapid pollen tube growth. Additionally, Noir et al. (2005) established a reference map of the A. thaliana mature pollen proteome by characterizing 145 proteins using MALDITOF MS and LC-MS/MS. Subsequent comparison with pollen transcriptomic data proved these results to be in accordance with the previous study by Holmes-Davis et al. (2005). Thus, it was concluded that a low transcript abundance may be sufficient to ensure accumulation of a significant amount of protein in some instances, for example proteins with a low turnover rate. Alternatively, some polypeptides might have been translated at an earlier stage of pollen development (e.g., in the bicellular stage) and persist longer in the mature pollen. Recently, Sheoran et al. (2006) completed studies on mature Arabidopsis pollen using ecotype Landsberg erecta. They identified 110 distinct proteins from 150 analyzed spots. Among them, 66 new proteins were identified that had not been reported in two previous studies on Arabidopsis. This was explained by the different ecotype used, and by differences in the methods of protein extraction and spot selection. The most abundant proteins were classified into functional categories including energy regulation, defense-related mechanisms, calcium-binding and signaling, cytoskeletal regulation, pollen allergens, glycine-rich proteins and late embryogenesis abundant proteins. Interestingly, some of them were similar to proteins found in the seed.

Kết quả (Việt) 1:

A. thaliana là một sinh vật mô hình hàng đầu của sinh học phân tử và di truyền học. Proteomic phân tích về mô hình nhà máy này đã là thực hiện trên các cơ quan khác nhau, các mô, bào quan, và trong giai đoạn phát triển khác nhau và môi trường điều kiện (xem chương khác trong khối này). Tuy nhiên, các cuộc điều tra tập trung vào sự phát triển của thể giao tử Nam được vẫn còn khan hiếm trong thaliana A. vì những khó khăn với bộ sưu tập mẫu và thanh lọc. Trước tiên, Mayfield et al. (2001) sử dụng cyclohexan chiết xuất protein từ áo phấn hoa của A. thaliana và xác định được 12 protein, chủ yếu là oleosins và lipaza. Sau đó, Holmes-Davis và ctv (2005) áp dụng nhiều kỹ thuật khai thác protein tiếp theo là 2-DE và ESI-MS/MS, dẫn đến việc xác định các protein khác biệt 135 từ tổng số 179 protein điểm. Các protein 135, hầu hết đã được tham gia trong sự trao đổi chất (20%), sản xuất năng lượng (17%), và cấu trúc tế bào (12%). Các tác giả định lượng protein điểm trong ba loại sau này và so sánh khối lượng protein bình thường để tín hiệu mRNA tương ứng của họ trong transcriptome. Dữ liệu cho thấy kết quả đáng ngạc nhiên cao đại diện mRNAs trao đổi thư từ với protein dồi dào thấp trong khi mRNAs là ít phổ biến hơn mã hóa một số protein phong phú hơn, do đó cho thấy một mối quan hệ nghịch đảo giữa cấp mRNA và protein. Nhìn chung, Arabidopsis phấn hoa proteome tích chứa tế bào và protein cytoskeletal. Những kết quả tương tự như trong các nghiên cứu của transcriptomic, và hỗ trợ ý tưởng rằng, ngoài các mRNAs, các hạt phấn hoa trưởng thành có chứa protein sẵn sàng làm đó là cần thiết để nảy mầm và tăng trưởng nhanh chóng phấn hoa ống. Ngoài ra, Noir et al. (2005) thành lập bản đồ tài liệu tham khảo của A. thaliana trưởng thành phấn proteome characterizing 145 protein bằng cách sử dụng MALDITOF MS và LC-MS/MS. sau đó so sánh với phấn hoa transcriptomic dữ liệu chứng minh các kết quả phải phù hợp với nghiên cứu trước đó của Holmes-Davis và ctv (2005). Vì vậy, nó đã được kết luận rằng một sự phong phú của bảng điểm thấp có thể đủ để đảm bảo tích lũy của một số lượng đáng kể các protein trong một số trường hợp, ví dụ như protein với tỷ lệ doanh thu thấp. Ngoài ra, một số polypeptid có thể đã được dịch ở giai đoạn sớm hơn của sự phát triển của phấn hoa (ví dụ, trong giai đoạn bicellular) và kiên trì còn trong phấn hoa trưởng thành. Gần đây, Sheoran et al. (2006) đã hoàn thành nghiên cứu về phấn hoa Arabidopsis trưởng thành bằng cách sử dụng ecotype Landsberg erecta. Họ xác định 110 protein khác biệt từ 150 điểm phân tích. Trong số đó, 66 protein mới được xác định đã không được báo cáo trong hai nghiên cứu trước đây trên Arabidopsis. Điều này được giải thích bởi ecotype khác nhau được sử dụng, và sự khác biệt trong các phương pháp khai thác protein và lựa chọn vị trí. Các protein phong phú nhất đã được phân loại thành các chức năng loại bao gồm năng lượng quy định, cơ chế liên quan đến quốc phòng, canxi-ràng buộc và tín hiệu, quy định cytoskeletal, chất gây dị ứng phấn hoa, glycine giàu protein và cuối embryogenesis phong phú protein. Điều thú vị, một số người trong số họ là tương tự như protein được tìm thấy trong hạt giống.

Kết quả (Việt) 2:

A. thaliana là một trong những sinh vật mẫu hàng đầu cho các nghiên cứu sinh học và di truyền phân tử. phân tích proteomic trên cây mô hình này đã được thực hiện trên cơ quan khác nhau, các mô, cơ quan này, và theo nhiều giai đoạn phát triển và điều kiện môi trường (xem chương khác trong số này). Tuy nhiên, cuộc điều tra tập trung vào sự phát triển của giao tử đực vẫn còn khan hiếm ở A. thaliana do những khó khăn với bộ sưu tập mẫu và thanh lọc. Đầu tiên, Mayfield et al. (2001) được sử dụng để trích xuất cyclohexane protein từ áo phấn hoa của A. thaliana và xác định 12 loại protein, chủ yếu là oleosins và lipase. Sau đó, Holmes-Davis et al. (2005) áp dụng nhiều kỹ thuật chiết xuất protein sau đó là 2-DE và ESI-MS / MS, dẫn đến việc xác định 135 protein khác biệt với tổng số 179 điểm protein. Trong số này 135 protein, hầu hết đã được tham gia vào quá trình chuyển hóa (20%), sản xuất năng lượng (17%), hoặc cấu trúc tế bào (12%). Các tác giả xác định số lượng các điểm protein trong ba loại sau và so sánh khối lượng protein bình thường với tín hiệu mRNA tương ứng của họ trong transcriptome. Các dữ liệu cho thấy kết quả đáng ngạc nhiên rằng mRNA đại diện cao tương ứng với protein thấp dồi dào trong khi mRNA mà ít nhiều được mã hóa một số protein dồi dào hơn, do đó chỉ ra một mối quan hệ nghịch đảo giữa mRNA và mức độ protein. Nhìn chung, hệ protein Arabidopsis phấn hoa ưu tiên chứa protein thành tế bào và cytoskeletal. Những kết quả này cũng tương tự như những người thu được trong các nghiên cứu transcriptomic, và hỗ trợ các ý tưởng rằng, ngoài các mRNA, phấn hoa hạt trưởng thành có chứa các protein làm sẵn đó là cần thiết cho sự nảy mầm và tăng trưởng ống phấn nhanh chóng. Ngoài ra, Noir et al. (2005) thành lập bản đồ tham khảo của A. thaliana phấn hoa trưởng thành protein bằng cách mô tả 145 protein sử dụng MALDITOF MS và LC-MS / MS. so sánh tiếp theo với phấn hoa dữ liệu transcriptomic chứng minh những kết quả này phải phù hợp với các nghiên cứu trước đây của Holmes-Davis et al. (2005). Như vậy, có thể kết luận rằng một bảng điểm đa dạng thấp có thể là đủ để đảm bảo tích lũy một lượng lớn protein trong một số trường hợp, ví dụ như protein với một tỷ lệ doanh thu thấp. Ngoài ra, một số polypeptide có thể đã được dịch ở giai đoạn đầu của sự phát triển phấn hoa (ví dụ, trong giai đoạn bicellular) và tồn tại lâu hơn trong phấn hoa trưởng thành. Gần đây, Sheoran et al. (2006) hoàn thành nghiên cứu về phấn hoa Arabidopsis trưởng thành sử dụng Kiểu sinh thái Landsberg erecta. Họ đã xác định 110 protein khác biệt với 150 điểm phân tích. Trong số đó, 66 protein mới được xác định đã không được báo cáo trong hai nghiên cứu trước đây về Arabidopsis. Điều này được giải thích bởi các Kiểu sinh thái khác nhau được sử dụng, và bởi sự khác biệt trong phương pháp chiết xuất protein và lựa chọn ngay tại chỗ. Các protein phong phú nhất được phân loại thành các loại chức năng bao gồm quy định năng lượng, cơ chế phòng vệ liên quan đến canxi ràng buộc và tín hiệu, quy định cytoskeletal, chất gây dị ứng phấn hoa, protein glycine phong phú và dồi dào protein muộn phôi. Điều thú vị, một số trong số họ là tương tự như protein được tìm thấy trong hạt. 66 protein mới được xác định đã không được báo cáo trong hai nghiên cứu trước đây về Arabidopsis. Điều này được giải thích bởi các Kiểu sinh thái khác nhau được sử dụng, và bởi sự khác biệt trong phương pháp chiết xuất protein và lựa chọn ngay tại chỗ. Các protein phong phú nhất được phân loại thành các loại chức năng bao gồm quy định năng lượng, cơ chế phòng vệ liên quan đến canxi ràng buộc và tín hiệu, quy định cytoskeletal, chất gây dị ứng phấn hoa, protein glycine phong phú và dồi dào protein muộn phôi. Điều thú vị, một số trong số họ là tương tự như protein được tìm thấy trong hạt. 66 protein mới được xác định đã không được báo cáo trong hai nghiên cứu trước đây về Arabidopsis. Điều này được giải thích bởi các Kiểu sinh thái khác nhau được sử dụng, và bởi sự khác biệt trong phương pháp chiết xuất protein và lựa chọn ngay tại chỗ. Các protein phong phú nhất được phân loại thành các loại chức năng bao gồm quy định năng lượng, cơ chế phòng vệ liên quan đến canxi ràng buộc và tín hiệu, quy định cytoskeletal, chất gây dị ứng phấn hoa, protein glycine phong phú và dồi dào protein muộn phôi. Điều thú vị, một số trong số họ là tương tự như protein được tìm thấy trong hạt. Các protein phong phú nhất được phân loại thành các loại chức năng bao gồm quy định năng lượng, cơ chế phòng vệ liên quan đến canxi ràng buộc và tín hiệu, quy định cytoskeletal, chất gây dị ứng phấn hoa, protein glycine phong phú và dồi dào protein muộn phôi. Điều thú vị, một số trong số họ là tương tự như protein được tìm thấy trong hạt. Các protein phong phú nhất được phân loại thành các loại chức năng bao gồm quy định năng lượng, cơ chế phòng vệ liên quan đến canxi ràng buộc và tín hiệu, quy định cytoskeletal, chất gây dị ứng phấn hoa, protein glycine phong phú và dồi dào protein muộn phôi. Điều thú vị, một số trong số họ là tương tự như protein được tìm thấy trong hạt.

Kết quả (Việt) 3:

A. thaliana là di truyền học và sinh học phân tử, một trong những chế độ chính của nghiên cứu sinh.Proteomic chế độ này đã tiến hành phân tích thực vật khác của cơ quan, tổ chức, bào quan, và tùy thuộc vào giai đoạn phát triển và điều kiện môi trường (xem quyển chương chương khác).Tuy nhiên, cuộc điều tra tập trung vào Nam giao tử Cơ quan phát triển vẫn do mẫu thu thập ở Arabidopsis thaliana, lọc khó khan hiếm.Đầu tiên, et al.(2001) dùng cyclohexane từ vỏ của phấn hoa Arabidopsis thaliana chiết xuất protein và xác định các protein protein và 12 người, chủ yếu.Sau đó, Holmes Davis et al.(2005) áp dụng nhiều công nghệ chiết xuất protein, và thứ hai là điện di hai chiều và mass spectrometry, dẫn đến 135 loài khác từ tổng số 179 protein cho một điểm xác định của protein.Ở đây 135 loài trong quá trình trao đổi chất protein, hầu hết liên quan (OH), năng lượng (, là 17 phần trăm.), hoặc tạo ra một cấu trúc tế bào (vậy nó).Tác giả định lượng protein ít, sau đó ba loại tiêu chuẩn so sánh hóa lượng protein tương ứng của RNA phiên mã.Số liệu cho thấy, có ý nghĩa tương ứng với mRNA thấp phong phú protein mRNA, và ít hơn giàu protein mã hóa ít giàu có hơn, thật ngạc nhiên là kết quả của mối quan hệ giữa, từ đó cho thấy mức độ của protein mRNA và ngược lại.Nhìn chung, phấn hoa Arabidopsis thaliana protein chứa nhóm ưu tiên vách tế bào và bộ xương tế bào protein.Những kết quả này là tương tự như nhóm học nghiên cứu được phiên mã, và ủng hộ ý tưởng của gen, ngoại trừ thành phấn hạt chứa một protein, nảy mầm và phát triển nhanh chóng là cần thiết.Bên cạnh đó, et al.(2005) đã xây dựng phấn hoa Arabidopsis thaliana chín nhóm protein tham khảo Đồ dùng MALDI TOF khối phổ LC-MS/MS phấn hoa sao chép dữ liệu so sánh nhóm đã chứng minh những kết quả này, sau đó sẽ Theo Holmes Davis et al nghiên cứu protein 145.(2005).Vì vậy, có thể rút ra kết luận là thấp. Phiên mã phong phú có thể là đủ để đảm bảo một notable tích lũy lượng protein trong một số trường hợp, ví dụ, có tỷ lệ thấp các protein.Hơn nữa, một số có thể đã ở giai đoạn polypeptide phấn phát triển dịch (ví dụ, trong giai đoạn thứ hai kéo dài lâu hơn), sự trưởng thành của phấn hoa.Gần đây, sheoran et al.(2006) đã hoàn thành Landsberg, Saale vạn thọ cúc trưởng thành hoa Arabidopsis thaliana nghiên cứu ứng dụng.Họ chắc chắn là 110, một protein khác nhau phân tích từ 150 người.Một trong số đó, 66 một protein mới được xác nhận, trong hai người từng nghiên cứu Arabidopsis thaliana không được báo cáo.Đây là bởi khác với cách giải thích khác nhau, bằng cách chiết xuất protein và ít lựa chọn.Người giàu có nhất cho chức năng protein phân loại, bao gồm điều chỉnh năng lượng, phòng thủ liên quan đến cơ chế ràng buộc, canxi và báo hiệu, bộ xương tế bào gốc Hoa điều tiết, dị ứng, glycine protein và late phôi thai phát triển giàu protein.Điều thú vị là một số được tìm thấy trong protein tương tự với hạt giống.