DNA sequencing analysisDNA sequenci

DNA sequencing analysis
DNA sequencing for the 15 strains was performed to identify the bla genes. The PCR products of the genes were further purified using PCR purification kits (Fermentas) and subjected to direct sequencing performed by Macrogen (Seoul, Korea) as described previously (Shacheraghi et al, 2010). The nucleotide sequences were analysed using the BLAST program (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST), the Lahey database, CromasPro-2 and Mega-4 softwareto determine the subvarients of the three variants of ESBL (SHV, PER, VEB). These were compared with blaSHV-11 gene from K. pneumonia (accession.no.X98101), blaSHV-5 gene from K. pneumonia (accession no. X55640), blaPER-1 gene from P.aeruginosa transposed on Tn2345 (accession no.AY866517.2) and blaVEB-1 gene from K. pneumonia (accession no. AF010416

Kết quả (Việt) 1:

Phân tích trình tự ADNTrình tự DNA cho chủng 15 được thực hiện để xác định các gen bla. Sản phẩm PCR gen tiếp tục được tinh chế bằng cách sử dụng bộ dụng cụ lọc PCR (Fermentas) và chịu trực tiếp trình tự thực hiện bởi Macrogen (Seoul, Hàn Quốc) như được mô tả trước đó (Shacheraghi và ctv., 2010). Trình tự nucleotide đã được phân tích bằng cách sử dụng chương trình BLAST (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST), cơ sở dữ liệu Lahey, CromasPro-2 và Mega-4 softwareto xác subvarients 3 biến thể của ESBL (SHV, PER, cơ). Những đã được so sánh với blaSHV-11 gen từ K. viêm phổi (accession.no.X98101), blaSHV-5 gen từ K. viêm phổi (không gia nhập. X55640), blaPER-1 gen từ P.aeruginosa transposed trên Tn2345 (gia nhập không. AY866517.2) và blaVEB-1 gen từ K. viêm phổi (không gia nhập. AF010416

Kết quả (Việt) 2:

Trình tự DNA phân tích
trình tự DNA trong 15 chủng đã được thực hiện để xác định những gen bla. Các sản phẩm PCR của gen đã được tinh sạch tiếp tục sử dụng bộ lọc PCR (Fermentas) và bị giải trình tự trực tiếp thực hiện bởi Macrogen (Seoul, Hàn Quốc) như mô tả trước đây (Shacheraghi et al, 2010). Các trình tự nucleotide được phân tích bằng cách sử dụng chương trình BLAST (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST), cơ sở dữ liệu Lahey, CromasPro-2 và Mega-4 softwareto xác định subvarients của ba biến thể của ESBL (SHV , PER, VEB). Những được so sánh với blaSHV-11 gen từ K. viêm phổi (accession.no.X98101), gen blaSHV-5 từ K. viêm phổi (nhập không. X55640), blaPER-1 gen từ P.aeruginosa hoán trên Tn2345 (nhập không. AY866517.2) và gen blaVEB-1 từ K. viêm phổi (nhập không. AF010416