VMD (Visual Molecular Dynamics) is

VMD (Visual Molecular Dynamics) is a molecular visualization and analysis program designed for biological systems such as proteins, nucleic acids, lipid bilayer assemblies, etc. This unit will serve as an introductory VMD tutorial. We will present several step-by-step examples of some of VMD’s most popular features, including visualizing molecules in three dimensions with different drawing and coloring methods, rendering publication-quality figures, animate and analyze the trajectory of a molecular dynamics simulation, scripting in the text-based Tcl/Tk interface, and analyzing both sequence and structure data for proteins.

Keywords: molecular modeling, molecular dynamics visualization, interactive visualization, animation

Kết quả (Việt) 1:

VMD (hình ảnh phân tử, động lực học) là một phân tử trực quan và phân tích chương trình được thiết kế cho các hệ thống sinh học như các protein, axit nucleic, lipid bilayer hội đồng, vv. Đơn vị này sẽ phục vụ như một hướng dẫn VMD giới thiệu. Chúng tôi sẽ trình bày một số ví dụ từng bước một số tính năng phổ biến nhất của VMD, bao gồm cả hình dung các phân tử trong không gian ba chiều với bản vẽ khác nhau và phương pháp màu, làm cho con số ấn phẩm chất lượng, animate và phân tích các quỹ đạo của một mô phỏng động lực học phân tử, kịch bản trong giao diện Tcl/Tk dựa trên văn bản, và phân tích trình tự và cấu trúc dữ liệu cho protein.Từ khoá: mô hình phân tử, động lực học phân tử trực quan, tương tác trực quan, hoạt hình

Kết quả (Việt) 2:

VMD (Visual Molecular Dynamics) là một hình dung và phân tích chương trình phân tử được thiết kế cho các hệ thống sinh học như protein, axit nucleic, cụm lớp kép lipid, vv Đơn vị này sẽ phục vụ như là một VMD hướng dẫn giới thiệu. Chúng tôi sẽ trình bày một số bước-by-step ví dụ về một số tính năng phổ biến nhất VMD nhân, bao gồm cả hình dung các phân tử trong không gian ba chiều với các bản vẽ và tô màu các phương pháp khác nhau, khiến con số công bố chất lượng, sinh động và phân tích quỹ đạo của một mô phỏng động lực phân tử, kịch bản trong Tcl / Tk giao diện dựa trên văn bản, và phân tích cả dữ liệu trình tự và cấu trúc protein. Từ khóa: mô hình phân tử, phân tử động trực quan, trực quan tương tác, hoạt hình