mặt đất trong một lượng bằng nhau của bộ đệm PCR (Tris -
HCL 200 TXM, pH 7,5; NaC1, 250 ixM; EDTA, 25
IZM; và SDS, 0,5%); các mảnh vỡ loại bỏ bằng cách ngắn gọn
ly tâm (1 phút, 14 000 xg) và DNA kết tủa
bằng cách thêm một lượng bằng nhau của isopropanol
ở nhiệt độ phòng cho 5 mưa. DNA
được ăn viên bằng cách ly tâm (10 mưa, 14 x 000
g) và lơ lửng trong 100 ~ 1 của 10 mM Tris. HCI
và 1 giải pháp mM EDTA, pH 8.
3.4. Khuếch đại với cặp mồi PCR mục tiêu
mồi CgInt (GGCCTCCCGCCTCCGGGCGG)
và ITS4 (TCCTCCGCTTATTGATATGC)
[9] đã được cung cấp bởi operon Technologies
Inc., California. Hỗn hợp phản ứng PCR (100
/ xl) chứa 10 TXL DNA nấm (approx. 50 ng),
10 / xl 10 X Taq đệm, 0,5 #I (2,5 U) Taq DNA
polymerase (Promega), 200 #p mỗi dATP,
dCTP , dGTP và dTTP (16 tzl), 1 / xM mỗi (5 / xl
mỗi nhóm) Cglnt và ITS4 và 53,5 p ~ l của vô trùng
nước cất. Hỗn hợp đã phải chịu 30
chu kỳ là 1,5 phút ở 94 ° C, 2 phút ở 45 ° C và 3 phút
ở 72 ° C, trong một chu trình nhiệt lập trình (Hybald). 3.5. Amph'fication PCR với mồi ngẫu nhiên oligonucleotide tổng hợp (10-Mers, bộ dụng cụ A và B) được cung cấp bởi operon được sử dụng cho RAPD phân tích. Một điển hình 100- # 1 phản ứng chứa 10 TXL của mồi duy nhất (15 / xg ml i cổ phiếu) và tất cả các thành phần khác như mô tả ở trên. Một ủ nhiệt độ 30 ° C và 45 khuếch đại chu kỳ đã được thông qua, trước bởi 7 mưa biến tính ở 94 ° C và theo sau 7 phút mở rộng tại 72 ° C. Sáu mồi sau đây được sử dụng: A3 (AGTCAGCCAC); Tất cả (CAATCGCCGT); A18 (AGGTGACCGT); B6 (TGCTCTGCCC); B8 (GTCCACACGG); và B10 (CTGCTGGGAC). sản phẩm PCR (10-15 TXL) được phân tích sau đây etectrophoresis trong 1,4% (w / v) gel agarose có chứa ethidium bromide (0,4 txg ml 1) bằng cách xem trên transilluminator. 3.6. Blotting miền Nam, chuẩn bị đầu dò, lai giống và autoradiography sản phẩm PCR đã được chuyển giao, sau điện, với màng nylon, (Hybond N, Amersham) bằng chuyển mao [8]. Một PCR
đang được dịch, vui lòng đợi..
