A molecular epidemiology study was

A molecular epidemiology study was conducted on
90 Edwardsiella ictaluri isolates recovered from
diseased farmed freshwater catfish, Pangasianodon
hypophthalmus, cultured in the Mekong Delta,
Vietnam. Thirteen isolates of E. ictaluri derived
from diseased channel catfish, Ictalurus punctatus,
cultured in the USA were included for comparison.
All the E. ictaluri isolates tested were found
to be biochemically indistinguishable. A repetitive
(rep)-PCR using the single (GTG)5 primer was
shown to possess limited discriminatory power,
yielding two similar DNA profiles categorized as
(GTG)5-PCR group 1 or 2 among the Vietnam
isolates and (GTG)5-PCR group 1 within the
USA isolates. Macrorestriction analysis identified
14 and 22 unique pulsotypes by XbaI and SpeI,
respectively, among a subset of 59 E. ictaluri isolates.
Numerical analysis of the combined macrorestriction
profiles revealed three main groups: a
distinct cluster formed exclusively of the USA
isolates, and a major and minor cluster with
outliers contained the Vietnam isolates. Antibiotic
susceptibility and plasmid profiling supported the
existence of the three groups. The results indicate
that macrorestriction analysis may be regarded as a
suitable typing method among the E. ictaluri
species of limited intraspecific diversity. Furthermore,
the findings suggest that E. ictaluri originating
from Vietnam may constitute a distinct
genetic group.

Kết quả (Việt) 1:

Một nghiên cứu dịch tễ học phân tử được tiến hành trên
90 Edwardsiella ictaluri chủng phục hồi từ
bệnh nuôi cá nước ngọt, Pangasianodon
hypophthalmus, nuôi cấy trong đồng bằng sông Cửu Long,
Việt Nam. Mười ba chủng E. ictaluri có nguồn gốc
từ bệnh kênh catfish, Ictalurus punctatus,
nuôi cấy tại Hoa Kỳ được đính kèm để so sánh.
tất cả E. ictaluri cô lập thử nghiệm đã được tìm thấy
là không thể phân biệt biochemically. Một lặp đi lặp lại
(đại diện)-Đảng Cộng sản Romania bằng cách sử dụng đơn (GTG) 5 mồi là
hiển thị để có quyền lực hạn chế của phân biệt đối xử,
yielding hai cấu hình DNA tương tự như loại như
(GTG) Đảng Cộng sản Romania 5 nhóm 1 hoặc 2 trong số Việt Nam
chủng và Đảng Cộng sản Romania-5 (GTG) Nhóm 1 trong các
Mỹ cô lập. Macrorestriction phân tích xác định
14 và 22 duy nhất pulsotypes bởi XbaI và SpeI,
tương ứng, trong một tập hợp con của chủng E. ictaluri 59.
phân tích số của macrorestriction kết hợp
hồ sơ cho thấy ba nhóm chính: một
cụm riêng biệt hình thành độc quyền của Hoa Kỳ
chủng, và một cụm lớn và nhỏ với
outliers chứa chủng Việt Nam. Kháng sinh
tính nhạy cảm và plasmid profiling hỗ trợ các
sự tồn tại của các nhóm ba. Các kết quả cho thấy
macrorestriction phân tích có thể được coi là một
phương pháp đánh máy thích hợp trong số E. ictaluri
loài đa dạng intraspecific hạn chế. Hơn nữa,
kết quả đề xuất đó có nguồn gốc E. ictaluri
từ Việt Nam có thể tạo thành một khác biệt
nhóm di truyền.