3 Results3.1 Humanization of MA2077

3 Results
3.1 Humanization of MA2077
Using NCBI IgBLAST, the human germline V region from IGHV1-46*03 group showed the highest identity (60.2%)to MA2077 VH and IGKV6D-41*01 showed the highest identity (59.6%) to MA2077 VL. The identity was considered only with respect to the FR residues. The sequence alignment of the mouse and human templates showed that there were 21 non-identical residues in VH and 23 non-identical residues in VL in FR (Fig. 1 and 2). For the “J” region, an identical “J” region from the human consensus sequence was selected, which showed two mis- matched residues each for VH and VL (Fig. 1 and 2). Comparison of canonical structure class between the murine and human templates revealed, class matching for 4 CDRs as: H1:1, H2:2, L1:1, and L2:1. The mismatching canonical structure class for L3 was determined as similar to class 1 for MA2077 and was indeterminate for human template due to absence of canonical of the same loop length.
The vernier zone residues were identified and studied using a homology model of MA2077 (described in Section
3.2). Sequence comparison between the murine and human FR residues at vernier zone positions showed that 6 out of 12 such residues for VH and 7 out of 14 residues
for VL were nonidentical (Supporting information, Table S1).
Similarly, interchain packing residues were identified using the compiled information given in the website program, “Humanization by design” (http://people.cryst.bbk.

Kết quả (Việt) 1:

Kết quả 33.1 thích của MA2077Bằng cách sử dụng NCBI IgBLAST, vùng con người germline V từ IGHV1 - 46 * 03 nhóm cho thấy danh tính cao nhất (60.2%)to MA2077 VH và IGKV6D - 41 * 01 cho thấy danh tính cao nhất (59,6%) để MA2077 VL. Danh tính được coi là chỉ đối với dư lượng FR. Chỉnh trình tự của chuột và con người mẫu cho thấy rằng đã có 21 phòng không giống hệt nhau dư lượng trong VH và 23 phòng không giống hệt nhau dư lượng trong VL trong FR (hình 1 và 2). Đối với khu vực "J", một vùng giống hệt nhau "J" từ trình tự sự đồng thuận của con người đã được lựa chọn, mà cho thấy hai mis - kết hợp dư lượng mỗi cho VH và VL (hình 1 và 2). So sánh các kinh điển cấu trúc lớp giữa con người và các mẫu tiết lộ, lớp học phù hợp cho 4 CDRs như: H1:1, H2:2, L1:1, và L2:1. Các lớp học kinh điển cấu trúc mismatching cho L3 được xác định là tương tự như lớp 1 cho MA2077 và là không xác định cho con người mẫu do sự vắng mặt của kinh điển của vòng lặp cùng chiều dài.Dư lượng vernier khu vực đã được xác định và nghiên cứu bằng cách sử dụng một mô hình tính tương đồng của MA2077 (được mô tả trong phần3.2). trình tự so sánh giữa các dư lượng FR các và con người tại các vị trí vernier khu cho thấy rằng 6 ra 12 dư lượng như vậy cho VH và dư lượng 7 / 14cho VL là nonidentical (hỗ trợ thông tin, Bàn S1).Tương tự như vậy, dư lượng interchain đóng gói đã được xác định bằng cách sử dụng các thông tin biên dịch được đưa ra trong chương trình trang web, "Thích bởi thiết kế" (http://people.cryst.bbk.