3. Results3.1. Optimization of reac

3. Results

3.1. Optimization of reaction temperature for TSV detection

The RT-LAMP was carried out using RNA as template in order to determine the optimal temperature and reaction time.


Table 1
Primers used for RT-LAMP of structural gene of TSV
Primer name Genome position Sequences 5r-3r

TSV-F3 9117-9141 CAATTGAAATTCTGAGATTAGAGTC
TSV-B3 9345-9327 GGTACATATCGAGCCACTC
TSV-FIP 9207-9184/TTTT/9144-9163 CTAGCTTCAGTGACCACGGTATAGTTTTATTTTGAGTCCAAAGCTCCA TSV-BIP 9259-9278/TTTT/9320-9303 GCGAACCCATGCGGGTATAGTTTTCAATGCGACCAATGACTG

W. Kiatpathomchai et al. / Journal of Virological Methods 146 (2007) 125–128

Kết quả (Việt) 1:

3. kết quả3.1. tối ưu hóa các phản ứng nhiệt độ để phát hiện TSVRT-đèn được thực hiện bằng cách sử dụng RNA là mẫu để xác định nhiệt độ tối ưu và thời gian phản ứng. Bảng 1Chất nền, mồi được sử dụng cho RT-đèn của cấu trúc gen của TSVVị trí mồi tên Genome Sequences 5r-3r TSV-F3 9117 NGƯỜI-9141 CAATTGAAATTCTGAGATTAGAGTCTSV-B3 9345 9327 NGƯỜI GGTACATATCGAGCCACTCTSV-FIP 9207-9184/TTTT/9144-9163 CTAGCTTCAGTGACCACGGTATAGTTTTATTTTGAGTCCAAAGCTCCA TSV-BIP 9259-9278/TTTT/9320-9303 NGƯỜI GCGAACCCATGCGGGTATAGTTTTCAATGCGACCAATGACTG W. Kiatpathomchai et al. / tạp chí Virological phương pháp 146 (2007) 125 – 128

Kết quả (Việt) 2:

3. Kết quả

3.1. Tối ưu hóa của nhiệt độ phản ứng để phát hiện TSV

Các RT-LAMP được thực hiện sử dụng RNA như mẫu để xác định nhiệt độ và thời gian phản ứng tối ưu. Bảng 1 mồi dùng cho RT-LAMP của gen cấu trúc của TSV Primer Sequences vị trí tên Genome 5R-3r TSV-F3 9117-9141 CAATTGAAATTCTGAGATTAGAGTC TSV-B3 9345-9327 GGTACATATCGAGCCACTC TSV-FIP 9207-9184 / TTTT / 9144-9163 CTAGCTTCAGTGACCACGGTATAGTTTTATTTTGAGTCCAAAGCTCCA TSV-BIP 9259-9278 / TTTT / 9320-9303 GCGAACCCATGCGGGTATAGTTTTCAATGCGACCAATGACTG W. Kiatpathomchai et al. / Tạp chí Khoa virus học Phương pháp 146 (2007) 125-128