In case of MA2077 VL, seven residue

In case of MA2077 VL, seven residues pertaining to the vernier zone (L2:I, L4:L, L46:R, L47:Y, L49:Y, L64:A, and L71:Y) and one belonging to the interchain packing residues (L87:F), which mismatched with the human template were analyzed. All the eight residues interacted with the residues influencing CDR conformation. Representative analysis of interaction of L49:Y (Y48) and L87:F (F86) with other residues within 5 ´distance has been shown (Supporting information, Fig. S1C and S1D). The tyrosine at L49 (Y48) interacted with seven residues, three of which N49, T50, and E52 were part of CDR2. Two of the residues M32 and H33 belonged to CDR1 whereas the remaining two residues R45 and I47 were predicted to be in the vernier zone (Supporting information, Fig. S1C).Phenylalanine at L87 (F86) also showed interaction with seven other residues, two of which were vernier zone residues (W34 and Y35), one residue (Q88) belonged to
CDR3 and another (H33), belonged to CDR1 (Supporting information, Fig. S1D). Hence, we decided to retain six murine FR residues in VH and eight murine FR residues in VL of 2077Hu2, in addition to grafting of CDRs (Fig. 1and 2). The back-mutations were subsequently evaluated
in a model of 2077Hu2. None of these mutations result to unfavorable interactions in 2077Hu2 (data not shown)

Kết quả (Việt) 1:

Trong trường hợp MA2077 VL, bảy dư lượng liên quan đến vùng vernier (L2: tôi, L4:L, L46:R, L47:Y, L49:Y, L64:A, và L71:Y) và một thuộc interchain đóng gói dư lượng (L87:F), mismatched với các mẫu của con người được phân tích. Tất cả các dư lượng tám tương tác với các dư lượng ảnh hưởng đến CDR conformation. Đại diện phân tích của sự tương tác của L49:Y (Y48) và L87:F (F86) với các dư lượng trong vòng 5 ´distance đã được hiển thị (thông tin hỗ trợ, hình. S1C và S1D). Tyrosine tại L49 (Y48) tương tác với bảy dư lượng, ba trong đó N49, T50, và E52 là một phần của CDR2. Hai trong số dư lượng M32 và H33 thuộc CDR1 trong khi còn lại dư lượng hai R45 và I47 đã được dự đoán là ở vùng vernier (hỗ trợ thông tin, hình. S1C). Nmol tại L87 (F86) cũng cho thấy tương tác với bảy các dư lượng khác, hai trong số đó đã là dư lượng vernier khu (W34 và Y35), một dư lượng (Q88) thuộc vềCDR3 và khác (H33), thuộc về CDR1 (thông tin, hình hỗ trợ. S1D). Do đó, chúng tôi quyết định giữ lại sáu các dư lượng FR trong VH và tám các dư lượng FR trong VL 2077Hu2, ngoài ra để ghép của CDRs (hình 1and 2). Đột biến trở lại sau đó đã được đánh giátrong một mô hình 2077Hu2. Không ai trong số những đột biến dẫn đến các tương tác không thuận lợi trong 2077Hu2 (dữ liệu không hiển thị)

Kết quả (Việt) 2:

Trong trường hợp MA2077 VL, bảy dư lượng liên quan đến các khu du xích (L2: I, L4: L, L46: R, L47: Y, L49: Y, L64: A, và L71: Y) và một thuộc về đóng gói buộc xây xích cặn bã (L87: F), mà không khớp với các mẫu con người được phân tích. Tất cả tám dư lượng tương tác với các chất thải ảnh hưởng CDR cấu. Phân tích đại diện tương tác của L49: Y (Y48) và L87: F (F86) có dư lượng khác trong vòng 5'distance đã được chứng minh (Hỗ trợ thông tin, hình S1C và S1D.). Các tyrosine tại L49 (Y48) tương tác với bảy dư, ba trong số đó N49, T50, và E52 là một phần của CDR2. Hai trong số các dư lượng M32 và H33 áp đảo thuộc về CDR1 trong khi hai dư lượng còn lại R45 và I47 được dự đoán là trong vùng vernier (thông tin hỗ trợ, hình. S1C) .Phenylalanine tại L87 (F86) cũng cho thấy sự tương tác với bảy phế liệu khác, hai trong số đó là dư lượng khu vernier (W34 và Y35), một dư lượng (Q88) thuộc
CDR3 và khác (H33), áp đảo thuộc về CDR1 (thông tin hỗ trợ, hình. S1D). Do đó, chúng tôi quyết định giữ lại sáu dư FR chuột trong VH và tám dư FR chuột tại VL của 2077Hu2, ngoài ghép CDR (Fig. 1and 2). The back-đột biến sau đó đã được đánh giá
trong một mô hình của 2077Hu2. Không ai trong số các đột biến dẫn tới sự tương tác không thuận lợi trong 2077Hu2 (dữ liệu không hiển thị)