Coalescent theory is a retrospectiv

Coalescent theory is a retrospective stochastic model of population genetics that relates genetic diversity in a sample to demographic history of the population from which it was taken. That is, it is a model of the effect of genetic drift, viewed backwards in time, on the genealogy of antecedents.[1] It comprises a probabilistic assessment of variation in time to common ancestry of alleles in a relatively small sample of individuals, from a much larger population. This includes consideration of all pathways of inheritance through which sampled copies of a homologous DNA element are traced back to a single ancestral copy, known as the most recent common ancestor (MRCA; sometimes also termed the coancestor to emphasize the coalescent relationship). The inheritance relationships among alleles are typically represented as a gene genealogy, or gene tree, similar in form to a phylogenetic tree. The probabilistic expectation of this gene genealogy is also known as the coalescent. Understanding the statistical properties of the coalescent under different assumptions forms the basis of coalescent theory. Because of recombination, different gene loci follow different pathways of ancestry, resulting in different gene genealogies. The coalescent is also relevant to phylogenetics, as incomplete lineage sorting between speciation events results in conflict among gene-loci in phylogenetic relationships inferred among species.

Kết quả (Việt) 2:

Lý thuyết Coalescent là một mô hình ngẫu nhiên hồi cứu di truyền quần thể có liên quan đa dạng di truyền trong một mẫu cho lịch sử nhân khẩu học của dân số mà từ đó nó đã được chụp. Nghĩa là, nó là một mô hình về tác động của trôi dạt di truyền, xem trở về quá khứ, về gia phả của tổ tiên. [1] Nó bao gồm một đánh giá xác suất của biến động trong thời gian tới tổ tiên chung của các alen trong một mẫu tương đối nhỏ của các cá nhân, từ một dân số lớn hơn nhiều. Điều này bao gồm việc xem xét tất cả các con đường của thừa kế thông qua đó bản mẫu của một phần tử DNA tương đồng được bắt nguồn từ một bản sao của tổ tiên duy nhất, được gọi là tổ tiên chung gần nhất (MRCA; đôi khi còn được gọi là các coancestor để nhấn mạnh mối quan hệ coalescent). Các mối quan hệ thừa kế giữa các alen thường được biểu diễn như một phả hệ gene, hoặc cây gen, dạng tương tự như một cái cây phát sinh loài. Sự kỳ vọng xác suất của phả hệ gene này cũng được biết đến như là coalescent. Hiểu biết về các tính chất thống kê của coalescent giả định khác nhau tạo nên cơ sở của lý thuyết coalescent. Bởi vì tái tổ hợp, locus gen khác nhau theo con đường khác nhau của tổ tiên, kết quả trong phả hệ gen khác nhau. Các coalescent cũng liên quan tới phylogenetics, như dòng dõi không đầy đủ phân loại giữa các sự kiện biệt hóa kết quả trong cuộc xung đột giữa các gen loci trong mối quan hệ phát sinh loài suy ra giữa các loài.