Mango (Mangifera indica L.) is cons

Mango (Mangifera indica L.) is considered as one of the most
popular fruits grown throughout the tropics and subtropics worldwide
[1]. India is the world`s largest producers, shares around 56% of total
global production [2]. Production of mango is affected by a large
number of fungal pathogens. The genus Colletotrichum contains many
morphologically similar taxa comprising endophytic, saprobic and
plant pathogenic fungi [3]. Of which, C. gloeosporioides an incitant of
mango anthracnose is the most important biological constraint which
restricts mango production in Southeast Asia [4]. C. gloeosporioides
affects mango production both in the pre and post harvest stages
particularly when attempting to extend storage life resulting in huge
economic losses about 5-20% in the form of damage on the stems,
leaves, fruit decay and damage [1,5]. Anthracnose disease is clearly
identified by morphological symptoms but sometimes the symptoms
are masked as this disease survived in the form of latent infection in
absence of congenial environment. Symptom based identification and
characterization is not accurate and reliable due to incipient infection.
The diagnostic techniques, thus will assist in the monitoring the
spread and distribution of pathogens. PCR technology can provide
very accurate quantitative data required for control and quarantine
decisions. The ability to design PCR primers to target specific regions
of DNA has led to rapid, accurate, and sensitive detection which is a
greater understanding for managing Colletotrichum diseases.
The development of species-specific primers has provided a
powerful tool for the detection of plant pathogens. The identification
of fungal pathogens based on polymerase chain reaction (PCR) using
species-specific primers is now widely used, especially for economically
important plant pathogens such as quarantine listed fungi or those
that are difficult to isolate or cause symptomless [6,7]. The internal
transcribed spacer regions (ITS1 and ITS4) within the nuclear
ribosomal gene clusters are particularly attractive loci for the design
of PCR-based detection assays since they are readily accessible using
universal primers [8] typically present in high copy number increasing
PCR sensitivity and often exhibiting sufficient inter-specific sequence
divergence for the designing of species-specific primers [9]. In recent
years, molecular tools have been employed to infer the evolutionary
relationships of Colletotrichum species. Based on nu-rDNA ITS
sequence data and morphological characteristics, some species have
been segregated from the Colletotrichum gloeosporioides complex.
Although ITS sequence data may help in Colletotrichum species
identification, it cannot alone be used to adequately address species
delimitation for closely related species [10]. Researchers have recently
tried to examine multiple genes sequence data to distinguish species in
Colletotrichum [10,11-16].
These regions can be further exploited for diagnostic purpose
and the primers can be designed against species specific regions from
rDNA. Therefore, a more contemporary approach aimed to develop
a molecular diagnostic assay for rapid and accurate diagnosis against
mango anthracnose pathogen for species-specific identification.

Kết quả (Việt) 2:

Mango (Mangifera indica L.) được coi là một trong những hầu hết
các loại trái cây phổ biến trồng khắp các vùng nhiệt đới và cận nhiệt đới trên toàn thế giới
[1]. Ấn Độ là nước sản xuất lớn nhất thế giới `s, cổ phiếu khoảng 56% tổng
sản lượng toàn cầu [2]. Sản xuất xoài bị ảnh hưởng bởi một lượng lớn
số nấm gây bệnh. Các chi Colletotrichum chứa nhiều
loài gồm endophytic, hoại sinh và hình thái tương tự như
cây nấm gây bệnh [3]. Trong đó, C. gloeosporioides một incitant của
xoài thán thư là hạn chế sinh học quan trọng nhất mà
hạn chế sản xuất xoài ở Đông Nam [4] Asia. C. gloeosporioides
ảnh hưởng đến sản xuất xoài ở cả trước và sau giai đoạn thu hoạch
đặc biệt là khi cố gắng để kéo dài tuổi thọ lưu trữ kết quả là rất lớn
thiệt hại kinh tế khoảng 5-20% trong các dạng tổn thương trên thân,
lá, sâu ăn quả và thiệt hại [1,5 ]. Bệnh thán thư rõ ràng là
xác định bởi các triệu chứng hình thái nhưng đôi khi các triệu chứng
được đeo mặt nạ như bệnh này tồn tại ở dạng nhiễm trùng tiềm ẩn trong
sự vắng mặt của môi trường hòa hợp. Triệu chứng dựa trên việc xác định và
mô tả đặc điểm là không chính xác và đáng tin cậy do nhiễm trùng phôi thai.
Các kỹ thuật chẩn đoán, do đó sẽ hỗ trợ trong việc theo dõi
sự lây lan và phân phối các tác nhân gây bệnh. Công nghệ PCR có thể cung cấp
dữ liệu định lượng rất chính xác cần thiết để kiểm soát và kiểm dịch
quyết định. Khả năng để thiết kế mồi PCR để nhắm mục tiêu các khu vực cụ thể
của DNA đã dẫn đến nhanh chóng, chính xác và nhạy cảm phát hiện đó là một
sự hiểu biết lớn hơn cho việc quản lý bệnh Colletotrichum.
Sự phát triển của các đoạn mồi đặc hiệu loài đã cung cấp một
công cụ mạnh mẽ cho việc phát hiện tác nhân gây bệnh thực vật . Việc xác định
tác nhân gây bệnh nấm dựa trên phản ứng chuỗi polymerase (PCR) sử dụng
cặp mồi đặc hiệu loài hiện nay được sử dụng rộng rãi, đặc biệt là kinh tế cho các
tác nhân gây bệnh quan trọng như kiểm dịch được liệt kê nấm hoặc những người
mà khó có thể cô lập hoặc không có triệu chứng gây ra [6,7]. Các nội
vùng spacer phiên âm (ITS1 và ITS4) trong hạt nhân
tập hợp gen ribosome là locus đặc biệt hấp dẫn cho các thiết kế
của các thử nghiệm phát hiện PCR dựa trên kể từ khi họ được tiếp cận dễ dàng sử dụng
mồi phổ quát [8] thường xuất hiện ở số lượng bản sao cao tăng
độ nhạy PCR và thường trưng bày đầy đủ trình tự liên cụ
phân kỳ cho các thiết kế của các loài cụ thể [9] mồi. Trong gần đây
nhiều năm, các công cụ phân tử đã được sử dụng để suy ra sự tiến hóa
các mối quan hệ của các loài nấm Colletotrichum. Dựa trên nu-rDNA ITS
dữ liệu trình tự và đặc điểm hình thái, một số loài đã
được tách biệt khỏi các gloeosporioides phức tạp Colletotrichum.
Mặc dù dữ liệu trình tự ITS có thể giúp đỡ trong loài nấm Colletotrichum
xác định, nó có thể không phải một mình được sử dụng để giải quyết thỏa đáng các loài
phân định cho các loài liên quan chặt chẽ [10 ]. Các nhà nghiên cứu gần đây đã
cố gắng để kiểm tra dữ liệu nhiều gen tự để phân biệt các loài trong
Colletotrichum [10,11-16].
Các khu vực này có thể được khai thác hơn nữa cho mục đích chẩn đoán
và mồi có thể được thiết kế chống lại loài vùng cụ thể từ
rDNA. Vì vậy, một cách tiếp cận hiện đại hơn nhằm phát triển
một xét nghiệm chẩn đoán phân tử để chẩn đoán nhanh chóng và chính xác đối với
xoài bệnh thán thư gây bệnh để xác định các loài cụ thể.