2. ResultsThe primary analysis of t

2. Results

The primary analysis of the reads through base calling directly on the

MiSeq sequencing reporter (MSR), revealed raw reads statistics and sequence quality assessment as in Table 1. The fastq reads obtained per sam-
ple were in paired-end reads labelled as (L001_R1_001.fastq and

L001_R2_001.fastq). The project (PRJNA288893) was registered with the

GenBank, with BioSample accession numbers SAMN03839381 (root),

SAMN03975610 (stem), and SAMN03975611 (leaf). The highest reads

were obtained from the root tissues (2,528,030 reads) followed by the

leaf (1,372,180 reads) and stem tissues (1,298,892 reads). The GC content

followed the same order (52.01, 50.86 and 50.01), respectively. This trend

may not be unusual since the root is closer to the soil microbial communi-
ties than other tissues. The higher reads in leaf tissues compared to the

stem, may probably be the result of the relatively larger size of leaf tissues

than the stem tissues, which might harbour more microbial communities.

Kết quả (Việt) 2:

2. Kết quả

phân tích chính của lần đọc thông qua cơ sở gọi trực tiếp trên

MiSeq trình tự phóng (MSR), tiết lộ liệu đọc thống kê và đánh giá chất lượng trình tự như trong Bảng 1. fastq lần đọc được mỗi sam-
ple là trong cặp-end lần đọc nhãn như (L001_R1_001.fastq và

L001_R2_001.fastq). Dự án (PRJNA288893) đã được đăng ký với

GenBank, với số BioSample nhập SAMN03839381 (root),

SAMN03975610 (thân), và SAMN03975611 (lá). Các cao nhất lần đọc

được lấy từ các mô rễ (2.528.030 lần đọc) theo sau

lá (1.372.180 lần đọc) và mô thân (1.298.892 lần đọc). Các nội dung GC

theo thứ tự (52.01, 50,86 và 50,01), tương ứng. Xu hướng này

có thể không được bình thường kể từ gốc là gần gũi hơn với đất communi- vi
quan hệ hơn so với các mô khác. Các cao hơn lần đọc trong mô lá so với

gốc, có lẽ có thể là kết quả của kích thước tương đối lớn hơn của mô lá

hơn so với mô thân, mà có thể chứa các cộng đồng vi khuẩn hơn.