How to: Download a large, custom se

How to: Download a large, custom set of records from NCBI

Starting with...

A TEXT QUERY (and I prefer to download them using a web browser)

Use the text query to retrieve the records from the appropriate Entrez database. For guidance on creating an Entrez text query, see the Entrez Help or help documents linked to the home page of the Entrez database that contains the data you want.
If desired, change the display format using the Display pulldown menu.
Choose File from the "Send to" menu, then select the desired format and click "Create File."
A TEXT QUERY (and I prefer to download them using a computer program or script)

Use the esearch and efetch Entrez Programming Utilities E-utilities.
See Application 3 in the E-utilities Practical Guide for instructions.
A SET OF UNIQUE IDENTIFIERS (and I prefer to download them using a web browser)

Create a plain text file containing each identifier on a separate line.
Upload this file using Batch Entrez. Click the Browse button to search for your file or enter the full path of the file name in the input box. Be sure to set the database pulldown menu to the correct database.
If desired, change the display format using the Display pulldown menu.
Choose File from the "Send to" menu, then select the desired format and click "Create File."
A SET OF UNIQUE IDENTIFIERS (and I prefer to download them using a computer program or script)

Use the epost and efetch Entrez Programming Utilities E-utilities.
See the "epost->esummary/efetch" example under "Basic Pipelines" in the E-utilities Practical Guide.
See Application 3 in the E-utilities Practical Guide for instructions on using efetch.

Kết quả (Việt) 2:

Làm thế nào để: Tải về một lớn, tùy chỉnh bộ hồ sơ từ NCBI Bắt đầu với ... A QUERY TEXT (và tôi muốn tải về chúng bằng trình duyệt web) Sử dụng các truy vấn văn bản để lấy các bản ghi từ cơ sở dữ liệu Entrez thích hợp. Để có hướng dẫn về việc tạo ra một truy vấn văn bản Entrez, hãy xem Trợ giúp hoặc giúp đỡ tài liệu Entrez liên kết đến trang chủ của các cơ sở dữ liệu Entrez có chứa dữ liệu mà bạn muốn. Nếu muốn, thay đổi định dạng hiển thị bằng cách sử dụng menu Display kéo xuống. Chọn File từ " Gửi đến "menu, sau đó chọn định dạng mong muốn và nhấp vào" Create File. "Một QUERY TEXT (và tôi thích để tải về chúng bằng một chương trình máy tính hoặc kịch bản) Sử dụng các esearch và efetch Entrez Programming Utilities E-tiện ích. Xem ứng dụng 3 trong E-tiện ích Hướng dẫn thực hành để được hướng dẫn. Một BỘ định danh duy nhất (và tôi muốn tải về chúng bằng trình duyệt web) Tạo một tập tin văn bản đơn giản có chứa mỗi định danh trên một dòng riêng biệt. Tải lên tập tin này bằng cách sử dụng hàng loạt Entrez. Nhấn nút Browse để tìm kiếm các tập tin của bạn hoặc nhập đường dẫn đầy đủ của tên tập tin trong hộp đầu vào. Hãy chắc chắn để thiết lập menu cơ sở dữ liệu kéo xuống để các cơ sở dữ liệu chính xác. Nếu muốn, thay đổi định dạng hiển thị bằng cách sử dụng menu Display kéo xuống. Chọn File từ "Send to" menu, sau đó chọn định dạng mong muốn và nhấp vào "Create File." Một SET CÁC định danh duy nhất (và tôi thích để tải về chúng bằng một chương trình máy tính hoặc kịch bản) Sử dụng các epost và efetch Entrez Programming Utilities E-tiện ích. Xem "epost-> esummary / efetch" dụ dưới "Basic Đường ống" trong E-tiện ích Hướng dẫn thực hành. Xem ứng dụng 3 trong E-tiện ích Hướng dẫn thực hành để được hướng dẫn về cách sử dụng efetch.