The blaVEB-1 was identified first i

The blaVEB-1 was identified first in an Escherichia coli isolate recovered in France from a Vietnamese child [20]. This was the first identification of an ESBL-encoding gene in the form of a gene cassette in a class 1 integron structure. An integron is a genetic unit capable of capturing, mobilising and expressing genes that are contained in mobile elements called gene cassettes [21]. Its essential components are an int1 gene, encoding a site-specific recombinase belonging to the integr- ase family, an attI adjacent site recognised by the integrase and acting as a receptor site for gene cassettes, and a promoter for gene cassette expres- sion (Fig. 1). The cassettes are mobile elements that include a gene (often encoding antibiotic resistance), and an integrase-specific recombina- tion site known as the 59-be element [21]. The blaVEB-1 ESBL gene was identified inside a gene cassette structure possessing perfect core and inverse core sites, together with a 133-bp 59-be recombination site [20]. The blaVEB-1 gene cassette was located inside the In53 class 1 integron, which carries an unusual array of eight functional gene cassettes encoding other antibiotic resistance determinants [22]. In53 was identified as plas- mid-borne and as part of a composite transposon structure, named Tn2000. It was flanked on both of its extremities by an IS26 element. On both extremities of Tn2000, an 8-bp duplication of the target site was the signature of the trans- position process. Thus, In53, instead of being located in a defective Tn402-based transposon, as is mostly the case for class 1 integrons, may have acquired mobility by the insertion of two IS26 elements.
By analysing the genetic environments of
blaVEB-1 genes identified in enterobacterial and
P. aeruginosa isolates recovered worldwide and in an A. baumannii epidemic clone from France [23], it was shown that this ESBL-encoding gene was present in a variety of class 1 integron structures. However, the features underlying the genetic mobility of those integrons have not been studied, except in the A. baumannii strain. In that latter organism, the blaVEB-1-containing integron was associated, at its 3¢-extremity, with a sul1-type integron structure containing an ISCR1 element at the origin of acquisition of a dfrX trimethoprim resistance gene [24]. Notably, that overall struc- ture was not part of a Tn402-like or Tn2000-like transposon, but had integrated into the chromo- some of the A. baumannii strain, together with other transposons or operons encoding antiseptic resistance as parts of a resistance island, named AbaR1 [24]. This island was 86 kb long and had been integrated through a transposition process, as revealed by the 5-bp target site duplication identified on its extremities [24].
Besides these class 1 integron-borne blaVEB-1
genes, other interesting structures have been found at the origin of the acquisition of this gene.

Kết quả (Việt) 1:

BlaVEB-1 đã được xác định lần đầu tiên một Escherichia coli isolate phục hồi tại Pháp từ một đứa trẻ Việt Nam [20]. Điều này đã là nhận dạng đầu tiên của một gen mã hóa ESBL dưới hình thức một băng gene trong một cấu trúc lớp 1 integron. Integron một là một đơn vị di truyền có khả năng chụp, huy và thể hiện gen được chứa trong điện thoại di động các yếu tố được gọi là gene cassette [21]. Thành phần thiết yếu của nó là một gen int1, mã hóa một recombinase trang, thuộc integr-ase, một trang web liền kề attI hành động như là một trang web thụ cho gene cassette, và một promoter cho các gen cassette expres-sion (hình 1) được công nhận bởi integrase. Các băng cát-sét là điện thoại di động các yếu tố bao gồm một gen (thường mã hóa kháng kháng sinh), và một trang web cụ thể integrase recombina-tion được gọi là cho 59-là phần tử [21]. BlaVEB-1 ESBL gen đã được xác định trong một cấu trúc gen cassette có lõi hoàn hảo và lõi nghịch đảo các trang web, cùng với 59 133-bp-gen trang web [20]. Băng blaVEB-1 gen nằm bên trong lớp 1 integron In53, mang một mảng không bình thường của tám cassette gen chức năng mã hóa các yếu tố quyết định kháng kháng sinh [22]. In53 đã được xác định như plas-giữa-borne và là một phần của một cấu trúc hỗn hợp transposon, đặt tên là Tn2000. Cả hai chi dưới của nó bao quanh bởi một yếu tố IS26. Cả hai chi Tn2000, một nhân bản 8-bp của các trang web mục tiêu vào chữ ký của trình vị trí trans. Vì vậy, In53, thay vì được ở một khiếm khuyết Tn402 dựa trên transposon, là chủ yếu là các trường hợp cho lớp 1 integrons, có thể đã mua lại tính di động bằng cách chèn hai IS26 yếu tố.Bằng cách phân tích môi trường di truyềnblaVEB-1 gen được xác định trong enterobacterial vàP. aeruginosa chủng bị thu hồi trên toàn thế giới và trong một A. baumannii dịch nhân bản từ nước Pháp [23], nó đã được hiển thị rằng gen mã hóa ESBL này đã có mặt trong một loạt các lớp 1 integron cấu trúc. Tuy nhiên, các tính năng cơ bản di động di truyền của những người integrons đã không được nghiên cứu, ngoại trừ trong sự căng thẳng A. baumannii. Trong đó sinh vật sau, blaVEB-1 có chứa integron được liên kết, ở 3¢ của nó cực, với một cấu trúc integron sul1-loại có chứa một phần tử ISCR1 tại nguồn gốc của việc mua lại của một dfrX trimethoprim kháng gen [24]. Đáng chú ý, struc-ture tổng thể mà không phải là một phần của một giống như Tn402 hoặc Tn2000 như transposon, nhưng đã tích hợp vào chromo – một số chủng A. baumannii, cùng với các transposon hoặc operons mã hóa chất khử trùng kháng chiến như một phần của một hòn đảo sức đề kháng, đặt tên là AbaR1 [24]. Hòn đảo này là dài 86 kb và đã được tích hợp thông qua một quá trình transposition, như tiết lộ của nhân bản trang web 5-bp mục tiêu được xác định trên các chi [24].Bên cạnh đó, những lớp 1 integron mọc blaVEB-1gen, kiến trúc thú vị khác đã được tìm thấy tại nguồn gốc của việc mua lại các gen này.

Kết quả (Việt) 2:

Các blaVEB-1 được xác định đầu tiên trong Escherichia coli phân lập thu hồi ở Pháp từ một đứa trẻ Việt [20]. Đây là việc xác định đầu tiên của một gen ESBL mã hóa trong các hình thức của một gene cassette trong một cấu trúc integron lớp 1. Một integron là một đơn vị di truyền có khả năng chụp, huy động và thể hiện những gen mà được chứa trong các yếu tố di động được gọi là băng cassette gen [21]. Các thành phần thiết yếu của nó là một gen int1, mã hóa một recombinase trang web cụ thể thuộc các gia đình ase integr-, một trang web liền kề ATTI công nhận bởi integrase và hoạt động như một trang web thụ cho cassette gen, và một promoter cho băng cassette gen biểu hiện sion ( Hình. 1). Các băng cassette là những yếu tố di động bao gồm một gen (thường mã hóa kháng kháng sinh), và một trang web sự recombina- integrase cụ thể được gọi là 59-có yếu tố [21]. Gen blaVEB-1 ESBL được xác định bên trong một cấu trúc gen băng hữu lõi hoàn hảo và các trang web lõi nghịch đảo, cùng với một 133-bp 59 được tái tổ hợp trang web [20]. Các blaVEB-1 gen băng được đặt bên trong In53 lớp 1 integron, có thể mang theo một mảng bất thường trong tám cassette gen chức năng mã hóa yếu tố quyết định kháng kháng sinh khác [22]. In53 được xác định là plas- giữa sinh và là một phần của một cấu trúc transposon composite, tên Tn2000. Nó đã được hai bên trên cả tứ chi của nó bởi một yếu tố IS26. Trên cả hai chi của Tn2000, một sự trùng lặp 8-bp của các trang web mục tiêu là chữ ký của quá trình vị trí giao thông. Như vậy, In53, thay vì được nằm trong một transposon Tn402 dựa trên bị lỗi, như là hầu hết các trường hợp cho lớp 1 integrons, có thể đã có được tính di động bằng cách chèn hai IS26 yếu tố.
Bằng cách phân tích môi trường di truyền của
blaVEB-1 gen được xác định trong enterobacterial và
P. aeruginosa phân lập hồi phục trên toàn thế giới và trong một A. baumannii dịch clone từ Pháp [23], nó đã chỉ ra rằng gen mã hóa ESBL này đã có mặt trong một loạt các cấu trúc lớp 1 integron. Tuy nhiên, các tính năng cơ bản di động di truyền của những integrons chưa được nghiên cứu, ngoại trừ trong các chủng A. baumannii. Trong đó vật thứ hai, integron blaVEB-1 có chứa liên quan, tại 3 ¢ -extremity của nó, với một cấu trúc integron sul1-loại có chứa một yếu tố ISCR1 ở nguồn gốc của việc mua lại của một gen kháng trimethoprim dfrX [24]. Đáng chú ý, rằng ture trúc tổng thể không phải là một phần của một transposon Tn402 giống hoặc Tn2000-như thế, nhưng đã tích hợp vào nhiễm sắc thể số các chủng A. baumannii, cùng với transposon khác hoặc operon mã hóa kháng thuốc sát trùng như các bộ phận của một kháng đảo, tên AbaR1 [24]. Hòn đảo này dài 86 kb và đã được tích hợp thông qua một quá trình chuyển vị, như tiết lộ của 5-bp trang web mục tiêu nhân bản được xác định trên tứ chi của nó [24].
Bên cạnh các lớp 1 blaVEB-1 integron truyền qua
gen, cấu trúc thú vị khác đã được tìm thấy nguồn gốc của việc mua lại của gen này.