3 Results3.1 Humanization of MA2077

3 Results
3.1 Humanization of MA2077
Using NCBI IgBLAST, the human germline V region from
IGHV1-46*03 group showed the highest identity (60.2%)
to MA2077 VH and IGKV6D-41*01 showed the highest
identity (59.6%) to MA2077 VL. The identity was consid-
ered only with respect to the FR residues. The sequence
alignment of the mouse and human templates showed
that there were 21 non-identical residues in VH and
23 non-identical residues in VL in FR (Fig. 1 and 2). For the
“J” region, an identical “J” region from the human con-
sensus sequence was selected, which showed two mis-
matched residues each for VH and VL (Fig. 1 and 2). Com-
parison of canonical structure class between the murine
and human templates revealed, class matching for 4 CDRs
as: H1:1, H2:2, L1:1, and L2:1. The mismatching canoni-
cal structure class for L3 was determined as similar to
class 1 for MA2077 and was indeterminate for human
template due to absence of canonical of the same loop
length.
The vernier zone residues were identified and studied
using a homology model of MA2077 (described in Section
3.2). Sequence comparison between the murine and hu-
man FR residues at vernier zone positions showed that
6 out of 12 such residues for VH and 7 out of 14 residues
for VL were non-identical (Supporting information,
Table S1).
Similarly, interchain packing residues were identified
using the compiled information given in the website pro-
gram, “Humanization by design” (http://people.cryst.bbk.

Kết quả (Việt) 2:

3 Kết quả
3.1 nhân bản của MA2077
dùng NCBI IgBLAST, các dòng mầm V khu vực của con người từ
IGHV1-46 * 03 nhóm cho thấy bản sắc cao nhất (60,2%)
để MA2077 VH và IGKV6D-41 * 01 cho thấy mức cao nhất
tính (59,6%) để MA2077 VL . Bản sắc là xem xét việc
chỉ đến khía cạnh liên quan đến các dư lượng FR với. Chuỗi
liên kết của các con chuột và mẫu con người cho thấy
rằng, có tới 21 dư lượng không giống nhau trong VH và
23 dư lượng không đồng nhất tại VL trong FR (Fig. 1 và 2). Đối với các
"J" khu vực, một "J" khu vực giống hệt nhau từ các con- con người
tự sensus đã được lựa chọn, trong đó cho thấy hai mệnh
dư lượng cho phù hợp với mỗi VH và VL (Fig. 1 và 2). Com-
sự so kinh điển của lớp cấu trúc giữa chuột
và mẫu con người tiết lộ, phù hợp cho lớp 4 CDR
như: H1: 1, H2: 2, L1: 1, và L2: 1. Sự không phối hợp canoni-
cal lớp cấu trúc cho L3 đã được xác định là tương tự như
lớp 1 cho MA2077 và là bất định cho người
mẫu do sự vắng mặt của kinh điển của vòng lặp cùng
chiều dài.
Các dư lượng khu vernier đã được xác định và được nghiên cứu
sử dụng một mô hình tương đồng của MA2077 ( mô tả trong Phần
3.2). So sánh trình tự giữa chuột và hu-
man FR tồn dư tại các vị trí khu vernier cho thấy
6 trong tổng số 12 tồn dư như vậy cho VH và 7 trong số 14 dư lượng
cho VL đều không phải là giống hệt nhau (thông tin hỗ trợ,
Bảng S1).
Tương tự như vậy, buộc xây xích đóng gói dư lượng được xác định
bằng cách sử dụng các thông tin biên soạn đưa ra trong các trang web trình
gram, "nhân tính bởi thiết kế" (http: //people.cryst.bbk.