Một method4 RT-PCR được mô tả trước đây đã được sửa đổi để
khuếch đại một đoạn 716 bp của ORF 5 và một phần của ORF 4 và
6 (716-bp RT-PCR). Các hỗn hợp PCR là 50 l khối lượng và
chứa chất thử trong cùng nồng độ như trên, với
ngoại lệ là 1.5 mM MgCl 2, 0,2 M của mồi,
và 4 lít của mẫu đã được sử dụng. Bắt đầu nóng đã đạt được sử dụng
một beadi sáp để tách các polymerase Taq DNA từ
phần còn lại của thuốc thử. Các thông số chu trình RT-PCR là tương tự như
ở trên ngoại trừ thời gian gia hạn mồi được kéo dài
đến 30 giây. Nếu không có amplicon được tạo ra bởi các RTPCR 716-bp,
một phương pháp thứ hai được sử dụng để khuếch đại một vùng 933-bp,
bao gồm 47 bp thượng nguồn đến 170 bp hạ lưu
trên đoạn 716 bp (933-bp RT-PCR).
Các RTPCR 933-bp giống hệt như 716-bp RT-PCR trừ các
chuỗi mồi được sử dụng, ví dụ, về phía trước mồi 5? -GAC ACC
TGA GAC CAT GAG và đảo ngược mồi 5? -TCT ATG GCT
GAG TAC ACC. Sau 716-bp RT-PCR hoặc 933-bp RT-PCR,
10 l của sản phẩm đã được tiêu hóa với MluI, HincII, và SacII
riêng ở 37 C trong 2 giờ như mô tả của manufacturer.j
Các mẫu được electrophoresed qua 2% highstrength
agarosek gel và hình dung bằng cách nhuộm với ethidium
bromide. Kích thước mảnh được xác định đối với một 100-
thang DNA bp mong mồi 5? -GAC ACC TGA GAC CAT GAG và đảo ngược mồi 5? -TCT ATG GCT GAG TAC ACC. Sau 716-bp RT-PCR hoặc 933-bp RT-PCR, 10 l của sản phẩm đã được tiêu hóa với MluI, HincII, và SacII riêng ở 37 C trong 2 giờ như mô tả của manufacturer.j Các mẫu được electrophoresed qua 2% highstrength agarosek gel và hình dung bằng cách nhuộm với ethidium bromide. Kích thước mảnh được xác định đối với một 100- thang DNA bp mong mồi 5? -GAC ACC TGA GAC CAT GAG và đảo ngược mồi 5? -TCT ATG GCT GAG TAC ACC. Sau 716-bp RT-PCR hoặc 933-bp RT-PCR, 10 l của sản phẩm đã được tiêu hóa với MluI, HincII, và SacII riêng ở 37 C trong 2 giờ như mô tả của manufacturer.j Các mẫu được electrophoresed qua 2% highstrength agarosek gel và hình dung bằng cách nhuộm với ethidium bromide. Kích thước mảnh được xác định đối với một 100- thang DNA bp
đang được dịch, vui lòng đợi..
