ResultsThe identification of cyMDH

Results

The identification of cyMDH genes and their expression in different tissues and under cold and salt treatments in apple

In our previous study (Yao et al., 2008), the MdcyMDH (DQ221207) ORF was shown to encode a 332-aa polypeptide which shared over 90% similarity with cyMDHs from other species, but we failed to locate this gene in the present apple genome database. In contrast, the other four cyMDH isoforms were identified from the entire apple genome, and their deduced proteins possessed the highly conserved domains of cytosolic malate dehydrogenase (Figure S1). Highly similar protein tertiary structures were observed between MdcyMDH and MDP0000174740, as well as between MDP0000197620 and MDP0000926135 (Figure 1a). Transcripts of the five cyMDH genes could be detected in all tissues, but they exhibited varying expression levels in different tissues; MdcyMDH, MDP0000174740 and MDP0000197620 were expressed primarily in the stems and roots (Figure 1b,c). MdcyMDH, MDP0000174740 and MDP0000170418 expression were induced by 50 mm NaCl and temperature of 8 °C (Figure 1c). Therefore, MdcyMDH and MDP0000174740 most likely possessed similar functions in the light of their highly similar tertiary structures, spatial expressions and expression responses to salt and cold in apple.

Kết quả (Việt) 1:

Kết quảViệc xác định các cyMDH gen và biểu hiện của họ trong các mô khác nhau và theo liệu pháp lạnh và muối trong quả táoChúng tôi nghiên cứu trước đó (Yao et al., 2008), MdcyMDH (DQ221207) ORF được hiển thị để mã hóa một polypeptide 332-aa chia sẻ hơn 90% sự tương đồng với cyMDHs từ các loài khác, nhưng chúng tôi không thể xác định vị trí các gen này trong cơ sở dữ liệu hiện nay bộ gen apple. Ngược lại, các isoforms cyMDH bốn khác được xác định từ apple toàn bộ gen, và của protein deduced sở hữu tên miền cao bảo tồn của cytosolic malate dehydrogenase (hình S1). Protein cao tương tự như cấu trúc bậc đã được quan sát thấy giữa MdcyMDH và MDP0000174740, cũng như giữa MDP0000197620 và MDP0000926135 (hình 1a). Bảng điểm của các gen cyMDH năm có thể được phát hiện trong tất cả các mô, nhưng họ trưng bày mức độ biểu hiện khác nhau trong các mô khác nhau; MdcyMDH, MDP0000174740 và MDP0000197620 đã được thể hiện chủ yếu trong thân cây và rễ (hình 1b, c). Biểu hiện MdcyMDH, MDP0000174740 và MDP0000170418 đã được gây ra bởi 50 mm NaCl và nhiệt độ 8 ° C (hình 1 c). Vì vậy, MdcyMDH và MDP0000174740 có nhiều khả năng sở hữu các chức năng tương tự trong ánh sáng của của cao tương tự như cấu trúc bậc, không gian biểu thức và biểu hiện phản ứng với muối và lạnh tại apple.

Kết quả (Việt) 2:

Kết quả

Việc xác định các gen cyMDH và biểu hiện của chúng trong các mô khác nhau và trong điều trị cảm lạnh và muối trong táo

Trong nghiên cứu trước đây của chúng tôi (Yao et al., 2008), MdcyMDH (DQ221207) ORF đã được hiển thị để mã hóa một polypeptide 332-aa mà chia sẻ hơn 90% tương tự với cyMDHs từ các loài khác, nhưng chúng tôi không thể xác định vị trí gen này trong cơ sở dữ liệu gen của táo hiện nay. Ngược lại, bốn đồng dạng cyMDH khác đã được xác định từ toàn bộ hệ gen của táo, và protein suy luận của họ sở hữu những lĩnh vực có tính bảo tồn của dehydrogenase malat cytosolic (Hình S1). Cấu trúc đại học protein tương tự cao đã được quan sát giữa MdcyMDH và MDP0000174740, cũng như giữa MDP0000197620 và MDP0000926135 (Hình 1a). Bảng điểm của năm gen cyMDH có thể được phát hiện trong tất cả các mô, nhưng họ trưng bày mức độ biểu hiện ở các mô khác nhau khác nhau; MdcyMDH, MDP0000174740 và MDP0000197620 được thể hiện chủ yếu trong thân và rễ (Hình 1b, c). MdcyMDH, MDP0000174740 và MDP0000170418 biểu đã được gây ra bởi 50 mm NaCl và nhiệt độ 8 ° C (Hình 1c). Do đó, MdcyMDH và MDP0000174740 rất có thể sở hữu các chức năng tương tự như trong ánh sáng của các cấu trúc của họ rất giống đại học, các biểu thức không gian và phản ứng biểu hiện cho muối và lạnh trong táo.