Bacteriocins are antimicrobial pept

Bacteriocins are antimicrobial peptides which are ribosomally synthesized by mainly all bacterial species. LABs (lactic acid bacteria) are a diverse group of bacteria that include around 20 genera of various species. Though LABs have a tremendous potential for production of anti-microbial peptides, this group of bacteria is still underexplored for bacteriocins. To study the diversity among bacteriocin encoding clusters and the putative bacteriocin precursors, genome mining was performed on 20 different species of LAB not reported to be bacteriocin producers. The phylogenetic tree of gyrB, rpoB, and 16S rRNA were constructed using MEGA6 software to analyze the diversity among strains. Putative bacteriocins operons identified were found to be diverse and were further characterized on the basis of physiochemical properties and the secondary structure. The presence of at least two cysteine residues in most of the observed putative bacteriocins leads to disulphide bond formation and provide stability. Our data suggests that LABs are prolific source of low molecular weight non modified peptides.

Kết quả (Việt) 1:

Bacteriocins là peptide kháng khuẩn mà ribosomally được tổng hợp bởi chủ yếu là tất cả các loài vi khuẩn. Phòng thí nghiệm (vi khuẩn axit lactic) là một nhóm đa dạng của vi khuẩn bao gồm khoảng 20 chi của các loài khác nhau. Mặc dù phòng thí nghiệm có một tiềm năng to lớn cho sản xuất các peptide chống vi khuẩn, nhóm vi khuẩn này vẫn được underexplored cho bacteriocins. Để nghiên cứu sự đa dạng trong số bacteriocin mã hóa cụm và tiền giả định bacteriocin, khai thác bộ gen được thực hiện trên 20 loài khác nhau của các phòng thí nghiệm không được báo cáo là bacteriocin nhà sản xuất. Cây phát sinh loài của gyrB, rpoB và 16S rRNA đã được xây dựng bằng cách sử dụng phần mềm MEGA6 để phân tích sự đa dạng trong chủng. Giả định bacteriocins operons được xác định đã được tìm thấy là đa dạng và thêm đặc trưng trên cơ sở các thuộc tính hóa lý và cấu trúc bậc hai. Sự hiện diện của ít nhất hai cysteine dư lượng trong hầu hết các giả định bacteriocins quan sát dẫn đến hình thành liên kết disulphide và cung cấp sự ổn định. Dữ liệu của chúng tôi cho thấy rằng phòng thí nghiệm nguồn sung mãn của trọng lượng phân tử thấp không lần peptide.

Kết quả (Việt) 2:

Bacteriocins là peptide kháng khuẩn được ribosomally tổng hợp bởi chủ yếu là các loài vi khuẩn. LABs (vi khuẩn axit lactic) là một nhóm đa dạng của vi khuẩn bao gồm khoảng 20 chi của các loài khác nhau. Mặc dù LABs có một tiềm năng to lớn cho sản xuất của các peptide chống vi khuẩn, nhóm vi khuẩn này vẫn underexplored cho bacteriocins. Để nghiên cứu sự đa dạng giữa các cụm mã hóa bacteriocin và các tiền chất bacteriocin giả định, khai thác gen được thực hiện trên 20 loài khác nhau của LAB không được báo cáo là bacteriocin sản xuất. Cây phát sinh loài của gyrB, rpoB, và 16S rRNA đã được xây dựng bằng phần mềm MEGA6 để phân tích sự đa dạng giữa các dòng. bacteriocins giả định operon xác định đã được tìm thấy là đa dạng và được tiếp tục đặc trưng trên cơ sở tính chất hóa lý và cấu trúc thứ cấp. Sự hiện diện của ít nhất hai dư lượng cysteine ​​trong hầu hết các bacteriocins giả định quan sát dẫn đến disulphide hình thành liên kết và cung cấp ổn định. dữ liệu của chúng tôi cho thấy rằng LABs là nguồn phong phú của trọng lượng phân tử peptide đổi không thấp.