DNA transposons move by a “cut and

DNA transposons move by a “cut and paste” mechanism
When active, DNA transposons are excised from one genomic site and integrated into another by a “cut and
paste” mechanism (Fig. 12.12A). Many of the DNA transposons, such as the bacterial insertion sequences
and the Tc1/mariner family elements, have a quite simple design. These elements consist of a transposase
gene flanked by inverted terminal repeats that bind transposase and thereby mediate transposition. The
transposase enzyme has a number of functional domains, including a catalytic domain and a DNA-binding
domain. The Tc1transposase, for example has two DNA-binding domains, one related to the fruitfly paired
DNA-binding domain (two helix-turn-helix motifs and a β-hairpin turn structure) and the other related
to the homeodomain DNA-binding motif (see Section 11.5). The enzyme can catalyze the whole set of
reactions necessary for DNA transposition. The transposase binds at or near the inverted repeats and to the
target DNA. Three critical amino acids (two aspartic acid and one glutamic acid) fold together to form a
three-dimensional structure called the “DDE” motif that binds two metal atoms (Mg
2+
or Mn
2+
) which
are central to the chemistry of DNA breaking and joining. The transposase then catalyzes hydrolysis of
phosphodiester bonds between the transposon and flanking DNA to remove the transposon from its old site
(Fig. 12.12A). The free 3′-OH residues generated in the DNA breakage reaction carry out the attack at the
new site and a joining reaction inserts the transposon into its new site. Sequence specificity of integration is
limited to a small number of nucleotides, thus insertions can occur at a large number of genomic sites. The
Tc1/mariner-type transposons have specificity for TA dinucleotides. Because the two strands of the new

Kết quả (Việt) 1:

DNA transposon di chuyển bằng một cơ chế "cắt và dán"
khi hoạt động, DNA transposon excised từ một trang web gen và tích hợp vào nhau bởi một "cắt và
dán" cơ chế (hình 12.12A). Nhiều của các transposon DNA, chẳng hạn như các vi khuẩn chèn chuỗi
và các yếu tố gia đình Tc1/mariner, có một thiết kế khá đơn giản. Những yếu tố này bao gồm một transposase
gen hai bên ngược lặp đi lặp lại thiết bị đầu cuối, ràng buộc transposase và do đó trung gian transposition. Các
transposase enzym có một số tên miền chức năng, trong đó có một tên miền xúc tác và một ràng buộc DNA
tên miền. Tc1transposase, ví dụ: có hai tên miền DNA-ràng buộc, một liên quan đến fruitfly danh sách theo cặp
DNA-ràng buộc miền (hai lần lượt-xoắn ốc xoắn ốc motif và β-mũ biến cấu trúc) và khác liên quan đến
để các motif DNA-ràng buộc homeodomain (xem phần 11.5). Enzyme có thể xúc tác các thiết lập toàn bộ của
phản ứng cần thiết cho DNA transposition. Transposase liên kết tại hoặc gần đảo ngược lặp đi lặp lại và để các
nhắm mục tiêu DNA. Amino axit ba quan trọng (hai aspartic axit và một axít glutamic) gấp với nhau để tạo thành một
chiều ba cấu trúc được gọi là các motif "DDE" liên kết với 2 nguyên tử kim loại (Mg
2
hoặc Mn
2
) mà
là trung tâm của hóa học của DNA phá vỡ và tham gia. Transposase sau đó catalyzes thủy phân
phosphodiester trái phiếu giữa transposon và sườn ADN để loại bỏ transposon từ trang web cũ
(Fig. 12.12A). Các dư lượng miễn phí 3 '-OH được tạo ra trong phản ứng vỡ DNA thực hiện cuộc tấn công tại các
trang web mới và một phản ứng tham gia chèn transposon vào trang web mới. Trình tự đặc trưng của hội nhập là
giới hạn đối với một số nhỏ các nucleotide, do đó, thêm vào có thể xảy ra tại một số lớn các gen trang web. Các
Tc1/mariner-loại transposon có đặc trưng cho TA dinucleotides. Bởi vì hai sợi của các mới

Kết quả (Việt) 2:

Transposon DNA di chuyển bởi một cơ chế "cắt và dán"
Khi hoạt động, transposon DNA được cắt ra từ một trang web di truyền và tích hợp vào nhau bằng một "cắt và
dán cơ chế "(Hình 12.12A). Nhiều người trong số các transposon DNA, chẳng hạn như trình tự chèn vi khuẩn
và các yếu tố Tc1/mariner gia đình, có một thiết kế khá đơn giản. Những yếu tố này bao gồm một transposase
gen hai bên thiết bị đầu cuối ngược lặp đi lặp lại rằng ràng buộc transposase và do đó làm trung gian chuyển vị. Các
enzyme transposase có một số lĩnh vực chức năng, bao gồm cả một miền xúc tác và một DNA
miền. Các Tc1transposase, ví dụ có hai lĩnh vực DNA, một liên quan đến cặp ruồi giấm
miền DNA (hai hoa văn xoắn quay xoắn và một cấu trúc lần lượt β-kẹp tóc) và liên quan khác
đến homeodomain DNA motif ( xem Phần 11.5). Các enzyme có thể xúc tác cho toàn bộ các
phản ứng cần thiết cho chuyển vị DNA. Các transposase liên kết tại hoặc gần lặp đi lặp lại đảo ngược và đến
DNA mục tiêu. Ba axit amin quan trọng (hai acid aspartic và một axit glutamic) gấp lại với nhau để tạo thành một
cấu trúc ba chiều gọi là "DDE" motif mà liên kết với hai nguyên tử kim loại (Mg
2 +
hoặc Mn
2 +
) mà
là trung tâm của hóa học của DNA phá vỡ và tham gia. Các transposase sau đó xúc tác thủy phân
cầu nối phosphodiester giữa các transposon và chầu DNA để loại bỏ các transposon từ trang web cũ của nó
(Hình 12.12A). Miễn phí dư lượng 3'-OH được tạo ra trong phản ứng vỡ DNA thực hiện các cuộc tấn công vào
trang web mới và một phản ứng tham gia chèn transposon vào trang web mới của nó. Trình tự đặc trưng của hội nhập được
giới hạn trong một số lượng nhỏ các nucleotide, do đó chèn có thể xảy ra ở một số lượng lớn các trang web của bộ gen. Các
transposon Tc1/mariner-type có đặc cho dinucleotide hỗ trợ kỹ thuật. Bởi vì hai sợi mới