Multivariate Analysis Tools Allow V

Multivariate Analysis Tools Allow Visualization of Coregulated Genes and Hormones, and Reveal Contrasts between Treatments and Genotypes
Many individual changes in transcript and hormone levels are reported here, with significance initially assessed by univariate procedures based on ANOVA (Supplemental Tables S2 and S3). To aid visualization and interpretation of the complex relationships, we subjected all data sets to multivariate analysis. Similar approaches were reported in relation to hormonal regulation of dormancy (Chope et al., 2012) and responses to abiotic stresses (Albacete et al., 2010; Pinheiro et al., 2011). Such analyses facilitate detection of groupings of variables and discrimination of differences between genotypes and treatments. We used the shifts between clusters of genotypes and treatments from the transcript and hormone scores plots (Figs. 3B and 7, B and E) to infer the principal effects associated with decapitation, root removal, auxin response, and SL deficiency. The overall trends are depicted in Figures 3C and 7, C and F, as arrows derived from geometric means of means for each of these factors. Directions of the arrows enable deduction of the main transcripts and hormones affected, by comparing with directions on the loadings plots (Figs. 3A and 7, A and D). Some trends matched predictions, such as the opposite responses to auxin and decapitation for auxin transporter and IPT expression in stems, with the latter positively correlated with levels of stem CKs.

Kết quả (Việt) 2:

Phân tích đa biến cụ Cho phép Hình ảnh của gen Coregulated và nội tiết tố, và tiết lộ Phản giữa điều trị và Kiểu gen
nhiều thay đổi ở mức độ cá nhân và bảng điểm hormone được báo cáo ở đây, với ý nghĩa ban đầu được đánh giá bởi các thủ tục đơn biến dựa trên ANOVA (Bảng bổ sung S2 và S3). Để hỗ trợ trực quan và giải thích các mối quan hệ phức tạp, chúng tôi phải chịu tất cả các bộ dữ liệu để phân tích đa biến. Cách tiếp cận tương tự đã được báo cáo liên quan đến các quy định của nội tiết tố ngủ phản ứng với stress phi sinh học và (Chope et al, 2012.) (Albacete và cộng sự, 2010;. Pinheiro et al, 2011.). Phân tích như vậy tạo điều kiện cho phát hiện của nhóm các biến số và phân biệt đối xử khác nhau giữa kiểu gen và các phương pháp điều trị. Chúng tôi sử dụng những thay đổi giữa các cụm kiểu gen và các phương pháp điều trị từ bảng điểm và hormone lô (Hình. 3B và 7, B và E) để suy ra những tác động chủ yếu liên quan đến chém đầu, loại bỏ gốc, đáp ứng auxin, và thiếu SL. Các xu hướng tổng thể được mô tả trong hình 3C và 7, C và F, như mũi tên có nguồn gốc từ phương tiện hình học của phương tiện cho mỗi yếu tố. Hướng của mũi tên cho phép khấu trừ các bảng điểm chính và kích thích tố ảnh hưởng, bằng cách so sánh với các chỉ dẫn trên tải trọng lô (Hình. 3A và 7, A và D). Một số xu hướng phù hợp với dự đoán, chẳng hạn như phản ứng ngược lại với auxin và chém đầu cho auxin vận chuyển và biểu hiện IPT trong thân cây, với thứ hai tương quan thuận với mức độ CKS gốc.