Captive breeding of groupers is the

Captive breeding of groupers is the practice of choice for a majority of commercial
aquaculture farms in South East Asia. This ensures sustainability of wild stocks which are an
important source of wild germplasm. Currently adopted practices involve the procurement of
cryopreserved sperm [1] from commercial suppliers followed by in vitro fertilization of eggs
collected from females at the hatchery. Validation of sperm received from diverse sources is
not possible using conventional methods for identification including microscopy or
biochemical tests. Molecular markers are ideal for applications in aquaculture [2] and have
been developed for a wide range of groupers including the Giant grouper, E. lanceolatus [3],
the Hump-backed grouper, Cromileptes altivelis [4] and the orange spotted grouper E.
coioides [5,6]. Validation of grouper germplasm using DNA barcoding protocols [7] is a
technically challenging process which involves DNA sequencing of PCR amplicons, followed
by similarity searches using bioinformatic tools and these resources may not be available at
breeding stations. A majority of the molecular markers available for groupers [8,9] have been
developed based on microsatellite DNA loci for application in population genetic studies [10].
Microsatellites have the ability to cross-amplify DNA within a genus [11] and this
characteristic hinders their application as a marker to distinguish germplasm derived from
closely related species. Genotyping of sperm necessitates the development of markers
which demonstrate the ability to amplify specific DNA loci within a single species [12]. This
study focused on the development of single copy number DNA markers for application in
genotyping of germplasm derived from two species of grouper, the Giant grouper E.
lanceolatus and the Tiger grouper (E. fuscoguttatus). Genomic DNA loci were isolated from
a small insert shotgun genomic library for each of the two species followed by the design of
single locus DNA markers for validation. The markers were tested for species specificity in
the closely related Orange spotted grouper (E. coioides) and the Coral grouper (E.
corallicola).

Kết quả (Việt) 1:

Captive giống cá mú là thực hành của sự lựa chọn cho một phần lớn của thương mại
trang trại nuôi trồng thủy sản ở đông nam á. Điều này đảm bảo tính bền vững của cổ phiếu hoang dã có một
nguồn quan trọng của hoang dã germplasm. Hiện đang nuôi thực tiễn liên quan đến mua sắm của
cryopreserved tinh trùng [1] từ nhà cung cấp thương mại theo sau bằng cách thụ tinh trong ống nghiệm của trứng
thu thập từ các phụ nữ tại trại giống. Xác nhận của tinh trùng nhận được từ các nguồn khác nhau là
không thể sử dụng phương pháp thông thường để xác định bao gồm cả kính hiển vi hoặc
xét nghiệm sinh hóa. Phân tử đánh dấu là lý tưởng cho các ứng dụng trong nuôi trồng thủy sản [2] và có
phát triển cho một loạt các cá mú bao gồm cá mú khổng lồ, E. lanceolatus [3],
cá mú Hump-backed, Cromileptes altivelis [4] và màu cam phát hiện cá mú E.
coioides [5,6]. Xác nhận của cá mú germplasm sử dụng ADN barcoding giao thức [7] là một
về mặt kỹ thuật thách thức quá trình đó bao gồm việc trình tự DNA của Đảng Cộng sản Romania amplicons, theo sau
bởi tương tự tìm kiếm bằng cách sử dụng công cụ bioinformatic và các nguồn tài nguyên có thể không có sẵn tại
chăn nuôi trạm. Đa số các dấu hiệu phân tử có sẵn cho cá mú [8,9] đã
phát triển dựa trên microsatellite DNA loci cho các ứng dụng trong các nghiên cứu di truyền dân [10].
Microsatellites có khả năng cross-khuyếch đại DNA trong vòng một chi [11] và điều này
đặc tính gây cản trở các ứng dụng như một điểm đánh dấu để phân biệt germplasm bắt nguồn từ
chặt chẽ liên quan đến loài. Gen của tinh trùng đòi hỏi sự phát triển của các dấu hiệu
mà chứng minh khả năng khuếch đại cụ thể DNA loci trong vòng một loài [12]. Điều này
nghiên cứu tập trung vào sự phát triển của bản duy nhất số DNA đánh dấu cho các ứng dụng trong
gen của germplasm bắt nguồn từ hai loài cá mú, cá mú khổng lồ E.
lanceolatus và cá mú Tiger (E. fuscoguttatus). Gen DNA loci bị cô lập từ
gen shotgun nhỏ chèn một thư viện cho mỗi hai loài theo thiết kế của
đơn locus DNA đánh dấu để xác nhận. Các dấu hiệu đã được thử nghiệm cho loài đặc trưng trong
Orange liên quan chặt chẽ phát hiện cá mú (E. coioides) và cá mú san hô (E.
corallicola).

Kết quả (Việt) 2:

Nuôi nhốt sinh sản của cá mú là thực hành và lựa chọn một phần lớn của thương mại
trang trại nuôi trồng thủy sản ở Đông Nam Á. Điều này đảm bảo tính bền vững của cổ phiếu hoang dã mà là một
nguồn quan trọng của nguồn gen hoang dã. Thực hành hiện đang áp dụng liên quan đến việc mua sắm của
tinh trùng trữ lạnh [1] từ các nhà cung cấp thương mại tiếp theo trong thụ tinh ống nghiệm trứng
thu được từ phụ nữ ở trại giống. Xác nhận của tinh trùng nhận được từ các nguồn khác nhau là
không thể sử dụng phương pháp thông thường để xác định bao gồm cả kính hiển vi hoặc
xét nghiệm sinh hóa. Marker phân tử là lý tưởng cho các ứng dụng trong nuôi trồng thủy sản [2] và đã
được phát triển cho một loạt các cá mú bao gồm cá mú khổng lồ, E. lanceolatus [3],
các cá mú Hump hậu thuẫn, Cromileptes altivelis [4] và màu da cam phát hiện cá mú E .
coioides [5,6]. Xác nhận của cá mú giống cây sử dụng giao thức mã vạch DNA [7] là một
quy trình kỹ thuật đầy thách thức liên quan đến việc xác định trình tự DNA của amplicon PCR, tiếp theo
bằng cách tìm kiếm tương tự sử dụng công cụ tin sinh học và các nguồn lực có thể không có sẵn tại
các trạm chăn nuôi. Đa số các marker phân tử cho cá mú [8,9] đã được
phát triển dựa trên microsatellite loci DNA để ứng dụng trong nghiên cứu di truyền quần thể [10].
vi vệ có khả năng xuyên khuếch đại DNA trong một chi [11] và điều này
đặc trưng gây cản trở cho ứng dụng của họ như là một dấu hiệu để phân biệt giống cây có nguồn gốc từ
các loài liên quan chặt chẽ. Kiểu gen của tinh trùng đòi hỏi sự phát triển của các dấu hiệu
đó chứng tỏ khả năng khuếch đại DNA locus cụ thể trong một loài duy nhất [12]. Này
nghiên cứu tập trung vào sự phát triển của các dấu hiệu DNA số lượng bản sao duy nhất cho ứng dụng trong
kiểu gen của giống cây có nguồn gốc từ hai loài cá mú, cá mú khổng lồ E.
lanceolatus và cá mú Tiger (E. fuscoguttatus). Locus gen DNA được phân lập từ
nhỏ chèn shotgun thư viện di truyền cho mỗi hai loài tiếp theo là thiết kế các
mẫu ADN locus đơn để xác nhận. Các dấu hiệu được kiểm tra tính đặc hiệu loài trong
Orange liên quan chặt chẽ phát hiện cá mú (E. coioides) và cá mú Coral (E.
corallicola).