X. oryzae pv. oryzae and X. oryzae

X. oryzae pv. oryzae and X. oryzae pv. oryzicola are
negative, rods (0.4–0.6 × 1.1–2.0 μm), frequently capsu
occurring singly, rarely in pairs, but not in chains, motil
a single polar flagellum. Colony morphology is examin
the third day or when growth has appeared on the selecte
medium. Colonies of X. oryzae pv. oryzae grow more s
on NA than those of X. oryzae pv. oryzicola. After 3–4
colonies of X. oryzae pv. oryzae on NA are circular, agar growth is faster, reaching 2 mm in 3–4 days, honey yellow,
and longer-lived. X. oryzae pv. oryzicola grows faster than X.
oryzae pv. oryzae on NA, producing smooth, opaque, glistening,
circular, convex and entire colonies; whitish at first, becoming
straw to pale yellow later; about 1 mm in diameter in three days.
Colonies of both pathogens on NBY are pale yellow, circular,
raised and mucoid; on PSA, colonies are pale yellow, mucoid
and shiny; on GF, colonies are very small, yellow and shiny. On
mXOS, colonies have a characteristic rose pink colour, mucoid,
raised and glistening after 3–5 days (Fig. 3).
Optimum temperature for growth is 25–30°C for X. oryzae
pv. oryzae and the growth range is 5–40°C while for X. oryzae
pv. oryzicola is 25–28°C and with a growth range from
8–38°C. For further details of the strains, see Vera Cruz et al.
(1984) and IMI Descriptions of Fungi and Bacteria No. 1457
and 1458 (Saddler, 2002a). Diagnosis is confirmed with
pathogenicity tests on 4–6 weeks-old rice plants. For pre-
liminary identification of isolates follow the tests recommended
in Table 1.
Fatty acid profiles
Fatty acid profiles allow identification at genus level only
(Swings et al., 1990) so it is not recommended as a diagnostic
method. This is given by the presence of 11:0 iso3OH, 13:0
iso3OH, 12:0 iso3OH. The fatty acid profiles of X. oryzae pv.
oryzae and X. oryzae pv. oryzicola are very similar, but with
differences in the relative amount of 12:0 iso3OH, 12:0 3OH,
and 15:0 anteiso fatty acids.
PCR
Presumptive X. oryzae colonies from agar platings are used to
prepare bacterial suspensions of approximately 108 CFU mL−1
in molecular grade sterile water. The PCR test allows
identification at species level. Appropriate PCR procedures
should be applied without DNA extraction. (see Appendix 2).
Bacterial suspensions of 25 μL are used in the PCR tests.
Pathovar-specific primers have been described in the literature
but they have not been tested in Europe. They are presented for
reference in Appendix 2.
ELISA
Presumptive X. oryzae colonies (yellow, raised, nitrate, oxidase,
gelatine and starch negative), are tested by an indirect-ELISA
procedure. A commercial Indirect ELISA kit based on X.
oryzae monoclonal antibodies (Agdia Inc.) is available and can
be used in the confirmatory identification of the isolates. For
conducting the tests follow guidelines and procedures described
by the supplier of the kit.
Pathogenicity tests
Isolates are tested on susceptible rice cultivars. For X. oryzae
pv. oryzae use 30–45 days old IR24 or IR8 (International Rice

smooth, convex, opaque, and pale yellow at first, straw y
colour later. Colonies reach 1–2 mm after 5–7 days
oryzae pv. oryzae, and their survival on solid media is
Colony formation from a single cell is poor and frequentl
to grow in many media, but can be improved by the addi
beef extract, methionine, or glutamic acid. On potato, s
Research Institute, Manila, Philippines) or TN1 (Taichung
native 1) rice plants; for X. oryzae pv. oryzicola IR24 or IR50
are recommended. Local popular rice varieties from the
European region with known susceptibility to the disease are
recommended to be included in the tests (Mew & Mistra, 1994).
Pathogenicity grouping of isolates is based in several countries
on the reaction of specific differential cultivars. For additional
information consult Ou (1985). The leaf clipping method is
widely used for the inoculation tests with X. oryzae pv. oryzae
strains and spray inoculations for X. oryzae pv. oryzicola. For
all inoculations grow the plants in potting mixture with a
weekly fertilization of 1–2 g urea L−1. Keep inoculated plants
under high moisture conditions with 12 h light/dark cycle at an
optimum temperature of 28–32°C/22°C. Include a negative
control (e.g. plants inoculated with sterile saline solution alone)
and a positive control to monitor false negative reactions caused
(e.g. by technical failure).
The clip-method. The test developed by Kauffman et al.
(1973) for X. oryzae pv. oryzae with slight modifications is
conducted: Cutting 2–3 cm of the tips of 30–40 leaves of rice
plants with a pair of scissors while still immersed in the bacterial
suspension (108
CFU mL−1) prepared in sterile saline solution.
Alternatively spray the clipped leaves with the bacterial
suspension (particularly useful for X. oryzae pv. oryzicola). The
inoculated plants are covered for 24 h with a polythene bag, and
incubated at 30°C with 12 h light cycle, with care taken that the
plants are not in direct contact with the bag. Plants are observed
for symptoms after 48–72 h up to 14 days. Plants are checked
for water-soaked areas in the inoculated leaves, usually
beginning from the inoculated ends as water-soaked stripes, an
indication of X. oryzae pv. oryzae symptoms. Lesions enlarge
and may turn yellow within a few days (Fig. 5). Milky drops of
exudates can be observed. Make sure that the symptoms are not
localized, but extend downwards. Appearance of reddish stripes
from the point of inoculation of clipped leaves may be an
indication of X. oryzae pv. oryzicola (Dr. M. Machmud, Bogor
Research Institute, Indonesia, personal communication). These
symptoms usually appear after ten days. Lesion margins caused
by X. oryzae pv. oryzicola pathogen remain linear rather
than wavy as in the case of X. oryzae pv. oryzae. Some non-
pathogenic yellow bacteria may induce formation of localized
yellow lesions at the inoculation point (1 cm), but do not spread
along the lamina with time.
Fig. 5 Rice leaves showing symptoms after inoculation with Xanthomonas
oryzae pv. oryzae by the lead ‘clipping’ method.

Kết quả (Việt) 1:

X. oryzae pv. oryzae và X. oryzae pv. oryzicola
tiêu cực, que (0,4-0,6 × 1.1-2.0 μm), thường xuyên capsu
xảy ra đơn lẻ, hiếm khi trong cặp, nhưng không phải trong dây chuyền, motil
flagellum cực duy nhất. Thuộc địa hình Thái là examin
ngày thứ ba hoặc khi tốc độ tăng trưởng đã xuất hiện trên selecte
trung bình. Thuộc địa của X. oryzae pv. oryzae phát triển thêm s
ngày NA so với những người X. oryzae pv. oryzicola. Sau 3-4
thuộc địa của X. oryzae pv. oryzae ngày NA là tròn, agar tăng trưởng là nhanh hơn, để đạt 2 mm trong 3-4 ngày, mật ong màu vàng,
và longer-lived. X. oryzae pv. oryzicola phát triển nhanh hơn X.
oryzae pv. oryzae trên đục mịn, NA, sản xuất, gleaming,
tròn, lồi và toàn bộ thuộc địa; màu trắng tại vòng, trở thành
rơm màu vàng sau đó; khoảng 1 mm đường kính trong ba ngày.
Thuộc địa của cả hai tác nhân gây bệnh trên NBY là màu vàng, tròn,
lớn lên và mucoid; trên PSA, thuộc địa rất nhạt màu vàng, mucoid
và sáng bóng; trên GF, thuộc địa là rất nhỏ, màu vàng và sáng bóng. Trên
mXOS, thuộc địa có một màu sắc hoa hồng màu hồng đặc trưng, mucoid,
lớn lên và glistening sau 3-5 ngày (hình 3).
nhiệt độ tối ưu cho sự tăng trưởng là 25-30° C cho X. oryzae
pv. oryzae và phạm vi tăng trưởng là 5-40° C trong khi đối với X. oryzae
pv. oryzicola là 25-28° C và với một tốc độ tăng trưởng nằm trong khoảng từ
8-38° C. Để biết thêm chi tiết của các chủng, hãy xem Vera Cruz et al.
(1984) và IMI mô tả của nấm và vi khuẩn số 1457
và 1458 (Saddler, 2002a). Chẩn đoán là confirmed với
bài kiểm tra ngày 4-6 tuần-nhà máy gạo cũ. Cho trước
liminary identification của chủng theo các cuộc thử nghiệm được đề nghị
trong bảng 1.
acid béo profiles
acid béo profiles cho phép identification ở cấp chi chỉ
(Swings và ctv., 1990) do đó, nó không được khuyến cáo như là một chẩn đoán
phương pháp. Điều này được đưa ra bởi sự hiện diện của 11:0 iso3OH, 13:0
iso3OH, 12:0 iso3OH. Profiles acid béo của X. oryzae pv.
oryzae và X. oryzae pv. oryzicola là rất tương tự như, nhưng với
khác biệt về số lượng tương đối của 12:0 iso3OH, 12:0 3OH,
và 15:0 anteiso axit béo.
PCR
ngai vàng X. oryzae thuộc địa từ lớp mạ thạch được sử dụng để
chuẩn bị đình chỉ do vi khuẩn của khoảng 108 CFU mL−1
trong lớp phân tử vô trùng nước. Cho phép thử nghiệm PCR
identification lúc cấp loài. Thích hợp PCR thủ tục
nên được áp dụng mà không cần khai thác DNA. (xem phụ lục 2).
bị đình chỉ do vi khuẩn của 25 μL được sử dụng trong thử nghiệm PCR.
Pathovar-specific lớp lót đã được mô tả trong các tài liệu
nhưng họ đã không được thử nghiệm ở châu Âu. Chúng được trình bày cho
tham khảo trong phụ lục 2.
ELISA
ngai vàng X. oryzae thuộc địa (màu vàng, lớn lên, nitrat, oxidase,
gelatin và tinh bột tiêu cực), được kiểm tra bởi một gián tiếp-ELISA
thủ tục. Một bộ dụng cụ gián tiếp ELISA thương mại dựa trên X.
oryzae monoclonal kháng thể (Agdia Inc) là có sẵn và có thể
được sử dụng trong identification confirmatory của các chủng. Cho
tiến hành các xét nghiệm thực hiện theo hướng dẫn và thủ tục được mô tả
bởi các nhà cung cấp của kit.
bài kiểm tra
chủng được thử nghiệm trên dễ bị gạo giống cây trồng. Cho X. oryzae
pv. oryzae dùng 30-45 ngày cũ IR24 hoặc IR8 (International gạo

mịn, lồi, đục và nhạt màu vàng tại vòng, rơm y
màu sau đó. Thuộc địa đạt được 1-2 mm sau 5-7 ngày
oryzae pv. oryzae, và sự sống còn của họ trên phương tiện truyền thông rắn là
thuộc địa hình thành từ một tế bào duy nhất là người nghèo và frequentl
để phát triển trong nhiều phương tiện truyền thông, nhưng có thể được cải thiện bằng g
thịt bò chiết xuất, Methionin hoặc axít glutamic. Trên khoai tây, s
Nghiên cứu viện, Manila, Philippines) hoặc TN1 (Taichung
bản xứ 1) gạo thực vật; cho X. oryzae pv. oryzicola IR24 hoặc IR50
được đề nghị. Địa phương phổ biến giống lúa từ các
các khu vực châu Âu với tính nhạy cảm được biết đến với bệnh đang
được khuyến khích để được bao gồm trong các bài kiểm tra (Mew & Mistra, 1994).
bài nhóm các chủng có trụ sở tại một số quốc gia
Ngày phản ứng của giống cây trồng khác biệt specific. Cho thêm
thông tin tham khảo ý kiến Ou (1985). Phương pháp cắt lá là
sử dụng rộng rãi cho các bài kiểm tra tiêm phòng với X. oryzae pv. oryzae
chủng và phun inoculations cho X. oryzae pv. oryzicola. Cho
tất cả inoculations phát triển các nhà máy ở potting hỗn hợp với một
lượt thụ tinh của 1-2 g urê L−1. Giữ cho nhà máy tiêm chủng
dưới điều kiện độ ẩm cao với 12 h ánh sáng/tối chu kỳ tại một
nhiệt độ tối ưu của 28-32° C / 22° C. Bao gồm một tiêu cực
kiểm soát (ví dụ như cây tiêm chủng với giải pháp mặn vô trùng một mình)
và một điều khiển tích cực để giám sát giả phản ứng tiêu cực gây ra
(e.g. by technical failure).
clip-phương pháp. Các thử nghiệm phát triển bởi Kauffman et al.
(1973) cho X. oryzae pv. oryzae với nhẹ modifications là
thực hiện: cắt 2-3 cm của đỉnh của 30-40 lá của gạo
cây với một cây kéo trong khi vẫn còn đắm mình trong vi khuẩn
đình chỉ (108
CFU mL−1) chuẩn bị sẵn sàng trong giải pháp mặn vô trùng.
hoặc phun cắt bớt lá với vi khuẩn
hệ thống treo (đặc biệt hữu ích cho X. oryzae pv. oryzicola). Các
tiêm chủng cây được bảo hiểm cho 24 h với một túi polythene, và
ủ tại 30° C với 12 h ánh sáng chu kỳ, cẩn thận thực hiện mà các
nhà máy đang không ở trong tiếp xúc trực tiếp với túi. Nhà máy được quan sát thấy
cho các triệu chứng sau 48-72 h tối đa 14 ngày. Nhà máy được kiểm tra
cho ngâm nước khu vực trong inoculated lá, thường
bắt đầu từ đầu inoculated là ngâm nước sọc, một
dấu hiệu của X. oryzae pv. triệu chứng oryzae. Tổn thương phóng to
và có thể chuyển sang màu vàng trong vòng một vài ngày (hình 5). Sữa giọt
dịch tiết có thể được quan sát thấy. Đảm bảo rằng các triệu chứng không phải
bản địa hoá, nhưng mở rộng xuống dưới. Xuất hiện của sọc đỏ
từ điểm tiêm phòng của cắt bớt lá có thể một
dấu hiệu của X. oryzae pv. oryzicola (tiến sĩ M. Machmud, Bogor
viện nghiên cứu, Indonesia, thông tin cá nhân). Những
triệu chứng thường xuất hiện sau mười ngày. Lợi nhuận tổn thương gây ra
bởi X. oryzae pv. mầm bệnh oryzicola vẫn còn tuyến tính thay vì
hơn gợn sóng như trong trường hợp của X. oryzae pv. oryzae. Một số phòng không-
vi khuẩn gây bệnh vàng có thể gây ra sự hình thành của bản địa hoá
vàng các tổn thương tại thời điểm tiêm phòng (1 cm), nhưng không lây lan
dọc theo phiến với thời gian.
hình. 5 gạo lá đang hiện triệu chứng sau khi tiêm phòng với Xanthomonas
oryzae pv. oryzae bằng phương pháp 'cắt' chì.

Kết quả (Việt) 2:

X. oryzae pv. oryzae và X. oryzae pv. oryzicola là
tiêu cực, thanh (0,4-0,6 x 1,1-2,0 mm), thường xuyên capsu
xảy ra đơn lẻ, ít khi theo cặp, nhưng không phải trong dây chuyền, motil
một fl cực agellum duy nhất. Colony hình thái được examin
ngày thứ ba hoặc khi tăng trưởng đã xuất hiện trên được Chọn
trung bình. Thuộc địa của X. oryzae pv. oryzae phát triển hơn nữa của
ngày hội hơn so với X. oryzae pv. oryzicola. Sau 3-4
thuộc địa của X. oryzae pv. oryzae vào Quốc hội là hình tròn, tăng trưởng thạch là nhanh hơn, đạt 2 mm trong 3-4 ngày, mật ong màu vàng,
và sống lâu hơn. X. oryzae pv. oryzicola phát triển nhanh hơn so với X.
oryzae pv. oryzae trên NA, sản xuất mịn, mờ đục, sáng lấp lánh,
tròn, lồi và toàn bộ thuộc địa; màu trắng ở gốc đầu tiên, trở thành
rơm để màu vàng nhạt sau; . khoảng 1 mm trong ba ngày
thuộc địa của cả hai tác nhân gây bệnh trên nBằng là màu vàng nhạt, tròn,
lớn lên và nhầy; trên PSA, thuộc địa là màu vàng nhạt, nhầy
và sáng bóng; trên GF, thuộc địa là rất nhỏ, màu vàng và sáng bóng. Trên
mXOS, thuộc địa có một đặc điểm màu hồng hồng, chất nhầy,
lớn lên và sáng lấp lánh sau 3-5 ngày (Hình. 3).
Nhiệt độ tối ưu cho sự phát triển là 25-30 ° C trong X. oryzae
pv. oryzae và phạm vi tăng trưởng 5-40 ° C trong khi đối với X. oryzae
pv. oryzicola là 25-28 ° C và với một phạm vi tăng trưởng từ
8-38 ° C. Để biết thêm chi tiết về các chủng, xem Vera Cruz et al.
(1984) và IMI mô tả của nấm và vi khuẩn số 1457
và 1458 (Saddler, 2002a). Chẩn đoán là con fi rmed với
các bài kiểm tra khả năng gây bệnh trên cây lúa từ 4-6 tuần tuổi. Đối với tiền
liminary identi fi cation của phân lập theo các bài kiểm tra đề nghị
trong Bảng 1.
acid béo pro fi les
acid béo pro fi les phép identi cation fi ở mức chi chỉ
(Swings et al., 1990) vì vậy nó không được khuyến cáo như là một chẩn đoán
phương pháp. Điều này được đưa ra bởi sự hiện diện của 11: 0 iso3OH, 13: 0
iso3OH, 12: 0 iso3OH. Các acid béo pro fi les của X. oryzae pv.
oryzae và X. oryzae pv. oryzicola rất giống nhau, nhưng với
sự khác biệt về số lượng tương đối của 12: 0 iso3OH, 12: 0 3OH,
và 15: 0 axit béo anteiso.
PCR
khoán X. thuộc địa oryzae từ thạch mạ được sử dụng để
chuẩn bị huyền phù vi khuẩn khoảng 108 CFU mL-1
trong nước vô trùng lớp phân tử. Các xét nghiệm PCR cho phép
identi cation fi ở mức loài. Thủ tục PCR phù hợp
nên được áp dụng mà không cần tách chiết DNA. (Xem phụ lục 2).
bị đình chỉ do vi khuẩn là 25 ml được sử dụng trong xét nghiệm PCR.
Pathovar mồi đặc hiệu fi c đã được mô tả trong các tài liệu
nhưng chưa được thử nghiệm ở châu Âu. Họ được trình bày cho
tài liệu tham khảo tại Phụ lục 2.
ELISA
khoán X. thuộc địa oryzae (màu vàng, lớn lên, nitrat, oxidase,
gelatin và tinh bột tiêu cực), được kiểm tra bởi một gián tiếp-ELISA
thủ tục. Một gián tiếp ELISA kit thương mại dựa trên X.
kháng thể đơn dòng oryzae (Agdia Inc) có sẵn và có thể
được sử dụng trong các con fi rmatory identi fi cation của phân lập. Để
tiến hành các bài kiểm tra theo hướng dẫn và thủ tục được mô tả
bởi các nhà cung cấp của các bộ.
lây bệnh nhân
chủng được thử nghiệm trên các giống lúa dễ nhiễm. Đối với X. oryzae
pv. oryzae sử dụng 30-45 ngày tuổi IR24 hoặc IR8 (lúa gạo quốc tế mịn, lồi, mờ đục, và màu vàng nhạt ở gốc đầu tiên, rơm y màu sau. thuộc địa đạt 1-2 mm sau 5-7 ngày oryzae pv oryzae., và sự sống còn của họ trên phương tiện truyền thông vững chắc là thuộc địa hình thành từ một tế bào duy nhất là người nghèo và frequentl phát triển trong nhiều phương tiện truyền thông, nhưng có thể được cải thiện bằng các Addi chiết xuất từ thịt bò, methionine, hoặc axit glutamic. Trên khoai tây, của Viện nghiên cứu, Manila, Philippines) hoặc TN1 (Taichung nguồn gốc 1) cây lúa; cho X. oryzae pv. oryzicola IR24 hoặc IR50 được khuyến khích. Giống lúa phổ biến tại địa phương từ khu vực châu Âu với tính nhạy cảm được biết đến căn bệnh này được đề nghị để được bao gồm trong các bài kiểm tra (Mew & Mistra, 1994). Lây bệnh nhân nhóm các phân lập có trụ sở tại một số quốc gia về phản ứng của fi Speci giống c khác biệt. Để biết thêm thông tin tham khảo ý kiến Ou (1985). Phương pháp cắt lá được sử dụng rộng rãi cho các cuộc thử nghiệm tiêm chủng với X. oryzae pv. oryzae chủng và tiêm chủng phun cho X. oryzae pv. oryzicola. Đối với tất cả tiêm chủng trồng cây trong hỗn hợp bầu với một thụ hàng tuần 1-2 g urê L-1. Giữ cây cấy trong điều kiện độ ẩm cao với 12 h sáng / chu kỳ tối ở một nhiệt độ tối ưu 28-32 ° C / 22 ° C. Bao gồm một tiêu cực kiểm soát (ví dụ như các nhà máy tiêm nước muối sinh lý vô trùng một mình) và một điều khiển tích cực để theo dõi phản ứng âm tính giả gây ra (ví dụ như thất bại kỹ thuật). Clip-phương pháp. Các thử nghiệm được phát triển bởi Kauffman et al. (1973) cho X. oryzae pv. oryzae với Modi nhẹ cation fi được thực hiện: cắt 2-3 cm trong những lời khuyên từ 30-40 lá lúa cây có một cây kéo trong khi vẫn đắm mình trong vi khuẩn bị đình chỉ (108 . CFU ml-1) chuẩn bị dung dịch muối vô trùng Ngoài ra phun lá cắt với các vi khuẩn bị đình chỉ (đặc biệt hữu ích cho X. oryzae pv oryzicola.). Các cây được lây bệnh được bảo hiểm trong 24 giờ với một túi nilon và ủ ở 30 ° C với 12 h chu kỳ ánh sáng, với sự quan tâm thực hiện các nhà máy không tiếp xúc trực tiếp với túi. Thực vật được quan sát thấy các triệu chứng sau 48-72 h lên đến 14 ngày. Nhà máy được kiểm tra cho các khu vực nước ngâm lá tiêm, thường bắt đầu từ kết thúc tiêm phòng như các đường sọc nước ngâm, một dấu hiệu của X. oryzae pv. oryzae triệu chứng. Tổn thương lớn và có thể chuyển sang màu vàng trong vòng vài ngày (Hình. 5). Dải Ngân hà của giọt dịch tiết có thể được quan sát thấy. Hãy chắc chắn rằng các triệu chứng này không phải địa phương, nhưng mở rộng xuống dưới. Dáng vẻ bên ngoài của các sọc đỏ từ quan điểm tiêm chủng của lá cắt có thể là một dấu hiệu của X. oryzae pv. oryzicola (Tiến sĩ M. Machmud, Bogor Viện nghiên cứu, Indonesia, thông tin cá nhân). Các triệu chứng thường xuất hiện sau mười ngày. Lợi nhuận tổn thương gây ra bởi X. oryzae pv. oryzicola tác nhân gây bệnh vẫn còn tuyến tính thay vì lượn sóng như trong trường hợp của X. oryzae pv. oryzae. Một số không vi khuẩn gây bệnh vàng có thể gây ra sự hình thành của địa phương tổn thương màu vàng ở điểm tiêm chủng (1 cm), nhưng không lây lan dọc theo phiến theo thời gian. Hình. 5 lá lúa có triệu chứng sau khi tiêm với Xanthomonas oryzae pv. oryzae do dẫn 'cắt' phương pháp.