Library characterization and RFLP a

Library characterization and RFLP analyses
Sixty-eight percent of single-copy sequences were detected in the EcoRI library. By contrast, the PstI library was more highly enriched in low-copy sequences since only 10~o of the probes revealed a signal corresponding to multiple-copy sequences. These findings were further
substantiated by the RFLP patterns revealed by these probes in the parental accessions. In effect, these RFLP patterns could be classified into two groups: a single fragment per homozygous profile (Fig. la) was revealed by 49~o of the probes, while 51~ o hybridized to two or more fragments per homozygous profile (Fig. lb). These fragments were always revealed together by a single probe and always cosegregated. It is highly likely that they may be due to the presence of at least one EcoRV (or DraI) restriction site inside the
probe sequence. In all cases but one, each pattern revealed by any of the selected probes on each of the parental accessions seemed therefore to correspond to
a single genetic locus.
Across both libraries taken together, polymorphism between SF265 and Banksii was revealed by
42~ of the probes with at least one enzyme. Both EcoRV and DraI revealed similar levels of RFLPs
between the parental accessions (respectively 31~ and 28~o). However, some 50~o of the probes detecting polymorphism revealed it with only one of the two enzymes. Among the heterologous probes, only the histone gene probe H4C14 revealed polymorphism between SF265 and Banksii.
The RFLP patterns of SF265, Banksii, and their hybrid, SFB5, suggested that Banksii was mostly
Fig. la, b. RFLP patterns for probes hybridized to DNAs from SF265 (S), Banksii (B), SFB5 (F1) and segregating F 2 progeny of the cross SF265 x Banksii (F2). a Probe pMaCIR214 showing one single fragment per homozygous profile (e.g., lanes 1 and 2)using EcoRV-digested DNA. b Probe pMaCIR1108 showing two fragments per homozygous profile (e.g., lanes 1, 5, 6), using DraI-digested DNA. This probe revealed SF265 heterozygosity (lane 2). Bands 1 and 3 (respectively 2 and 4) always cosegregated homozygous, but that SF265 was heterozygous at many loci polymorphic between both accessions (Fig. lb). SF265 and Banksii shared a common band for most probes for which SF265 was heterozygous.
Consequently, about half of the loci revealed by such probes did not segregate in the F 2 population, and thus only 21~o of all probes could be used to construct a linkage map from the cross SF265 x Banksii.

Kết quả (Việt) 1:

Đặc tính của thư viện và phân tích RFLPSáu mươi tám phần trăm các trình tự sao chép đĩa đơn đã được phát hiện trong thư viện EcoRI. Ngược lại, các thư viện PstI hơn rất phong phú trong các chuỗi thấp-bản sao kể từ khi chỉ có 10 ~ o các tiết lộ một tín hiệu tương ứng với trình tự sao chép nhiều. Những phát hiện này đã thêmCác chứng minh bởi các mô hình RFLP tiết lộ bởi các thăm dò trong accessions của cha mẹ. Trong thực tế, những mẫu RFLP có thể được phân thành hai nhóm: một mảnh duy nhất một màu hồ sơ (Fig. La) đã được tiết lộ bởi 49 ~ o đầu dò, trong khi 51 ~ o cặp để hai hoặc nhiều mảnh một màu hồ sơ (Fig. lb). Những mảnh vỡ đã luôn luôn tiết lộ với nhau bởi một thăm dò đơn và luôn luôn cosegregated. Nó là rất có khả năng họ có thể là do sự hiện diện của ít nhất một EcoRV (hoặc DraI) hạn chế các trang web bên trong cácđầu dò dãy. Trong mọi trường hợp, nhưng một trong những, mỗi mẫu tiết lộ bởi bất kỳ đầu dò được lựa chọn trên mỗi người trong số các parental accessions dường như do đó tương ứng vớimột quỹ tích di truyền đơn.Trên cả hai thư viện lấy nhau, đa hình giữa SF265 và Banksii đã được tiết lộ bởi42 ~ của đầu dò với ít nhất một loại enzyme. Cả hai EcoRV và DraI tiết lộ mức độ tương tự của RFLPsgiữa các parental accessions (tương ứng 31 ~ và 28 ~ o). Tuy nhiên, một số 50 ~ o đầu dò phát hiện đa hình tiết lộ nó với chỉ là một trong hai enzyme. Trong số các đầu dò heterologous, chỉ histone gen thăm dò H4C14 tiết lộ đa hình giữa SF265 và Banksii.RFLP mẫu SF265, Banksii, và của hybrid, SFB5, gợi ý rằng Banksii là chủ yếuHình. La, b. RFLP mẫu cho đầu dò cặp để DNAs từ SF265 (S), Banksii (B), SFB5 (F1) và ly F 2 con cháu của chéo SF265 x Banksii (F2). một thăm dò pMaCIR214 đang hiện một đơn mảnh một màu hồ sơ (ví dụ như, làn 1 và 2) bằng cách sử dụng EcoRV tiêu hóa DNA. b thăm dò pMaCIR1108 Hiển thị hai mảnh một màu hồ sơ (ví dụ, đường 1, 5, 6), bằng cách sử dụng tiêu hoá DraI DNA. Thăm dò này tiết lộ SF265 heterozygosity (lane 2). Ban nhạc 1 và 3 (tương ứng 2 và 4) luôn luôn cosegregated màu, nhưng mà SF265 là hổ lúc nhiều loci bướu giữa cả hai accessions (Fig. lb). SF265 và Banksii đã chia sẻ một ban nhạc phổ biến cho hầu hết các đầu dò mà SF265 được hổ. Do đó, khoảng một nửa số loci tiết lộ của đầu dò như vậy không tách trong dân số F 2, và do đó duy nhất 21 ~ o tất cả đầu dò có thể được sử dụng để xây dựng bản đồ liên kết từ x Banksii SF265 chéo.

Kết quả (Việt) 2:

Thư viện mô tả và phân tích RFLP
Sáu mươi tám phần trăm của các chuỗi đơn bản sao đã được phát hiện trong thư viện EcoRI. Ngược lại, các thư viện PstI được đánh giá cao hơn làm giàu trong các trình tự sao chép thấp vì chỉ có 10 ~ o của các đầu dò cho thấy một tín hiệu tương ứng với chuỗi nhiều bản sao. Những phát hiện này đã tiếp tục
chứng minh bằng các mô hình RFLP tiết lộ bởi những đầu dò trong đan có cha mẹ. Trong thực tế, các mô hình RFLP có thể được phân loại thành hai nhóm: một mảnh duy nhất cho mỗi hồ sơ đồng hợp tử (. Hình la) đã được tiết lộ bởi 49 ~ o của các tàu thăm dò, trong khi 51 ~ o lai với hai hay nhiều mảnh cho mỗi cấu hình đồng hợp tử (Hình. lb). Những mảnh vỡ đã được luôn luôn tiết lộ với nhau bằng một đầu dò đơn và luôn cosegregated. Nó là rất có thể họ có thể là do sự hiện diện của ít nhất một EcoRV (hoặc Drai) trang web hạn chế bên trong
dãy đầu dò. Trong mọi trường hợp, nhưng một, mỗi mẫu tiết lộ bởi bất kỳ của các tàu thăm dò lựa chọn trên mỗi đan có cha mẹ do đó dường như tương ứng với
một locus gen duy nhất.
Trên khắp cả thư viện lấy nhau, đa hình giữa SF265 và Banksii đã được tiết lộ bởi
42 ~ của các đầu dò có ít nhất một enzyme. Cả hai EcoRV và Drai tiết lộ mức độ tương tự của RFLPs
giữa đan có cha mẹ (tương ứng 31 ~ 28 ~ o). Tuy nhiên, khoảng 50 ~ o của các đầu dò phát hiện đa hình tiết lộ nó với chỉ một trong hai enzyme. Trong số các thiết bị thăm dò dị loại, chỉ có đầu dò gen histone H4C14 tiết lộ đa hình giữa SF265 và Banksii.
Các mô hình RFLP của SF265, Banksii, và lai của họ, SFB5, cho rằng Banksii chủ yếu là
hình. la, b. Mẫu RFLP cho đầu dò lai với DNA từ SF265 (S), Banksii (B), SFB5 (F1) và cách ly F 2 thế hệ con cháu của SF265 chéo x Banksii (F2). Probe pMaCIR214 thấy một mảnh duy nhất cho mỗi hồ sơ đồng hợp tử (ví dụ, đường 1 và 2) sử dụng DNA EcoRV-tiêu hóa. b Probe pMaCIR1108 hiển thị hai mảnh cho mỗi cấu hình đồng hợp tử (ví dụ, đường 1, 5, 6), sử dụng DNA Drai-tiêu hóa. Thăm dò này cho thấy SF265 dị hợp tử (ngõ 2). Dải tần số 1 và 3 (lần lượt là 2 và 4) luôn cosegregated đồng hợp tử, nhưng mà SF265 là dị hợp tử ở nhiều locus đa hình giữa hai đan có (Hình. Lb). SF265 và Banksii chia sẻ một ban nhạc phổ biến cho hầu hết các thiết bị thăm dò mà SF265 là dị hợp tử.
Do đó, khoảng một nửa trong số các locus tiết lộ bởi tàu thăm dò như vậy không phân ly trong quần thể F 2, và do đó chỉ có 21 ~ o của tất cả các thiết bị thăm dò có thể được sử dụng để xây dựng một bản đồ liên kết từ thập SF265 x Banksii.