The ‘iron bacteria’ were among the

The ‘iron bacteria’ were among the first prokaryotes to be observed and recorded by pioneer microbiologists, such as Ehrenberg and Winogradsky, in the 19th century. They were originally considered to be bacteria that catalysed the oxidation of iron II (Fe2+, ferrous iron) to iron III (Fe3+, ferric iron), often causing the latter to precipitate and accumulate as extensive, ochre-like deposits (Supple- mentary Fig. S1a), although the definition of what con- stitutes an ‘iron bacterium’ has been extended to include prokaryotes that, like Geobacter spp., catalyse the dissim- ilatory reduction of ferric to ferrous iron. Iron-oxidizing prokaryotes have continued to be the focus of a con- siderable body of research, due to not only the perceived importance of these micro-organisms in the global iron cycle and industrial applications (chiefly biomining), but also discoveries over the past 20 or so years of novel genera and species that catalyse the dissimilatory oxidation of iron at circum-neutral pH in micro-aerobic and anaerobic environments (Emerson et al., 2010). While classified species of iron-oxidizing bacteria occur in a number of phyla within the domain Bacteria, including the Nitro- spirae and the Firmicutes, the majority are included within the largest bacterial phylum, the Proteobacteria. Within this phylum are found iron-oxidizing bacteria that have different physiologies in terms of their response to oxygen (obligate aerobes, facultative and obligate anaerobes)and pH optima for growth (neutrophiles, moderate and extreme acidophiles). These bacteria are the subject matter of this review. Other related reviews that have focused on particular groups and aspects of iron-oxidizing proteo- bacteria and other bacteria include those by Straub et al. (2001) (anaerobic iron oxidizers), Weber et al. (2006) (anae- robic iron oxidizers), Johnson & Hallberg (2008) (acid- ophilic species) and Emerson et al. (2010) (environmental and genomic aspects).

Biogeochemistry of iron
Iron is the most abundant element (by weight) in planet earth, and the second most abundant metal (after aluminium) in the lithosphere, where it is present at a mean concentration of 5 % (Lutgens & Tarbuck, 2000). It occurs in a number of mineral phases, including oxides, carbonates, silicates and sulfides. Banded iron formations (BIFs; oxidized deposits of Pre-Cambrian age) are the largest accumulations of iron in the lithosphere (Nealson, 1983), containing about 28 % (by weight) iron. Laterites are surface deposits of oxidized iron, and are important as they contain significant reserves of metals of economic value, such as nickel and cobalt (Elias, 2002). Iron is an essential nutrient for all known life forms, with the seeming exception of Lactobacillus spp. (Archibald, 1983). It is usually required only in trace amounts (i.e. it is a micro- nutrient), although in some exceptional cases such as the magnetotactic bacteria, cellular iron contents are up to 11.5-fold greater than in more ‘typical’ bacteria (Chavadar & Bajekal, 2008).

Kết quả (Việt) 1:

Các vi khuẩn sắt' cũng nằm trong số các sinh đầu tiên được quan sát và ghi lại bởi tiên phong microbiologists, chẳng hạn như Ehrenberg và Winogradsky, trong thế kỷ 19. Họ đã được ban đầu được coi là vi khuẩn phản quá trình oxy hóa của sắt II (Fe2 +, sắt màu) để sắt III (Fe3 +, sắt III), thường gây ra sau để kết tủa và tích lũy như trầm tích rộng lớn, giống như ochre (Supple-mentary hình. S1a), mặc dù định nghĩa của những gì con-stitutes một loại vi khuẩn' sắt' đã được mở rộng để bao gồm sinh rằng, giống như Geobacter spp., catalyse giảm dissim-ilatory của sắt để bằng sắt. Sắt oxy hóa sinh có tiếp tục được tập trung của một cơ thể con-siderable của nghiên cứu, do không chỉ nhận thức tầm quan trọng của các vi sinh vật trong chu kỳ toàn cầu sắt và ứng dụng công nghiệp (chủ yếu là biomining), nhưng cũng được phát hiện trong quá khứ 20 hoặc hơn năm của tiểu thuyết chi và loài catalyse dissimilatory quá trình oxy hóa của sắt ở pH trung tính mục trong môi trường vi hiếu khí và kỵ khí (Emerson et al. 2010). Trong khi phân loại các loài vi khuẩn sắt oxy hóa xảy ra trong một số ngành trong vùng vi khuẩn, bao gồm cả Nitro-spirae và Firmicutes, phần lớn được bao gồm trong ngành lớn nhất của vi khuẩn, sơ. Trong ngành này được tìm thấy sắt oxy hóa các vi khuẩn có physiologies khác nhau về phản ứng của họ để oxy (bắt aerobes, dạng và bắt kháng) và độ pH optima cho sự tăng trưởng (neutrophiles, acidophiles trung bình và cực). Các vi khuẩn là vấn đề của nhận xét này. Đánh giá liên quan khác đã tập trung vào nhóm cụ thể và các khía cạnh của oxy hóa sắt proteo-vi khuẩn và vi khuẩn khác bao gồm những người bởi Straub et al. (2001) (kỵ khí sắt oxidizers), Weber et al. (2006) (anae - robic sắt oxidizers), Johnson & Hallberg (2008) (axit-ophilic loài) và Emerson et al. (2010) (khía cạnh môi trường và gen).Biogeochemistry of ironIron is the most abundant element (by weight) in planet earth, and the second most abundant metal (after aluminium) in the lithosphere, where it is present at a mean concentration of 5 % (Lutgens & Tarbuck, 2000). It occurs in a number of mineral phases, including oxides, carbonates, silicates and sulfides. Banded iron formations (BIFs; oxidized deposits of Pre-Cambrian age) are the largest accumulations of iron in the lithosphere (Nealson, 1983), containing about 28 % (by weight) iron. Laterites are surface deposits of oxidized iron, and are important as they contain significant reserves of metals of economic value, such as nickel and cobalt (Elias, 2002). Iron is an essential nutrient for all known life forms, with the seeming exception of Lactobacillus spp. (Archibald, 1983). It is usually required only in trace amounts (i.e. it is a micro- nutrient), although in some exceptional cases such as the magnetotactic bacteria, cellular iron contents are up to 11.5-fold greater than in more ‘typical’ bacteria (Chavadar & Bajekal, 2008).

Kết quả (Việt) 2:

Các 'vi khuẩn sắt' nằm trong số những sinh vật nhân sơ đầu tiên được quan sát và ghi lại bởi vi sinh vật tiên phong, như Ehrenberg và Winogradsky, trong thế kỷ 19. Họ đã được ban đầu được coi là vi khuẩn xúc tác quá trình oxy hóa sắt II (Fe2 +, sắt II) thành sắt III (Fe3 +, sắt III), thường gây ra sau này để kết tủa và tích lũy, tiền gửi đất son giống như mở rộng (phần phụ tương hỗ Hình . S1A), mặc dù định nghĩa của những gì con- stitutes một 'sắt vi khuẩn' đã được mở rộng để bao gồm các sinh vật nhân sơ, giống như Geobacter spp., xúc tác cho sự giảm ilatory dissim- của sắt với sắt màu. Sắt-oxy hóa prokaryotes đã tiếp tục là trọng tâm của một cơ thể siderable góp của nghiên cứu, do không chỉ ra tầm quan trọng nhận thức của các vi sinh vật trong chu trình sắt toàn cầu và các ứng dụng công nghiệp (chủ yếu là biomining), nhưng cũng có những khám phá về quá khứ 20 hay như vậy năm và loài cuốn tiểu thuyết xúc tác quá trình oxy hóa dissimilatory sắt ở pH trung tính circum trong môi trường vi hiếu khí và kỵ khí (Emerson et al., 2010). Trong khi loài phân loại vi khuẩn sắt-oxy hóa xảy ra ở một số phyla trong Vi khuẩn miền, bao gồm cả các Ni-tô spirae và Firmicutes, phần lớn được bao gồm trong phylum vi khuẩn lớn nhất, Proteobacteria. Trong vòng phylum này là vi khuẩn sắt-oxy hóa được tìm thấy rằng có physiologies khác nhau về phản ứng của họ với oxy (bắt buộc Vi khuẩn hiếu khí, vi khuẩn kỵ khí tùy nghi và bắt buộc) và optima pH cho tăng trưởng (neutrophiles, vừa phải và acidophiles cực). Những vi khuẩn này là những vấn đề của tổng quan này. Đánh giá khác liên quan mà đã tập trung vào các nhóm đặc biệt và các khía cạnh của vi khuẩn proteo- sắt-oxy hóa và các vi khuẩn khác bao gồm những bằng Straub et al. (2001) (oxi hóa sắt kỵ khí), Weber et al. (2006) (anae- oxi hóa kỵ sắt), Johnson & Hallberg (2008) (điện môi chịu acid loài ophilic) và Emerson et al. (2010) (môi trường và các khía cạnh di truyền). Biogeochemistry sắt Sắt là nguyên tố phổ biến nhất (theo trọng lượng) trong hành tinh trái đất, và các kim loại nhiều thứ hai (sau nhôm) trong thạch quyển, nơi mà nó hiện diện ở nồng độ trung bình của 5% (Lutgens & Tarbuck, 2000). Nó xảy ra trong một số giai đoạn khoáng sản, bao gồm các oxit, cacbonat, silicat và sulfide. Thành hệ sắt dải (BIFs; tiền gửi oxy hóa của tuổi Pre-Cambri) là tích lũy lớn nhất của sắt trong thạch quyển (Nealson, 1983), có chứa khoảng 28% (theo trọng lượng) sắt. Laterites là tiền gửi trên bề mặt của sắt bị oxy hóa, và rất quan trọng vì chúng chứa trữ lượng đáng kể của các kim loại có giá trị kinh tế, chẳng hạn như nickel và cobalt (Elias, 2002). Sắt là một chất dinh dưỡng cần thiết cho tất cả các dạng sống được biết đến, với ngoại lệ dường như Lactobacillus spp. (Archibald, 1983). Nó thường được yêu cầu chỉ trong một lượng nhỏ (tức là nó là một chất dinh dưỡng vi), mặc dù trong một số trường hợp đặc biệt như vi khuẩn magnetotactic, nội dung sắt di động là lên đến 11,5 lần lớn hơn so với nhiều vi khuẩn 'điển hình' (Chavadar & Bajekal , 2008).