Glycoside hydrolases (EC 3.2.1.-) a

Glycoside hydrolases (EC 3.2.1.-) are a widespread group of enzymes which hydrolyse the glycosidic bond between two or more carbohydrates or between a carbohydrate and a non-carbohydrate moiety. The IUBMB Enzyme nomenclature of glycoside hydrolases is based on their substrate specificity and occasionally on their molecular mechanism; such a classification does not reflect (and was not intended to) the structural features of these enzymes. A classification of glycoside hydrolases in families based on amino acid sequence similarities has been proposed a few years ago. Because there is a direct relationship between sequence and folding similarities, such a classification:

(i) reflects the structural features of these enzymes better than their sole substrate specificity,

(ii) helps to reveal the evolutionary relationships between these enzymes,

(iii) provides a convenient tool to derive mechanistic information [1] [2]

(iv) illustrates the difficulty of deriving relationships between family membership and substrate specificity

The Carbohydrate-Active Enzymes database (CAZy) provides a continuously updated list of the glycoside hydrolase families. Because the fold of proteins is better conserved than their sequences, some of the families can be grouped in ’clans’ :
(i) when new sequences are found to be related to more than one family,
(ii) when the sensitivity of sequence comparison methods is increased or
(iii) when structural determinations demonstrate the resemblance between members of different families [3]

The established ’clans’ are given in form of a table below.

Kết quả (Việt) 1:

Glycoside hydrolases (EC 3.2.1.-) là một nhóm phổ biến rộng rãi của các enzym mà hydrolyse glycosidic mối liên kết giữa hai hoặc nhiều carbohydrate hoặc giữa một carbohydrate và một đảo carbohydrate. Danh nghĩa IUBMB Enzyme glycoside hydrolases dựa trên đặc trưng bề mặt và đôi khi ngày của cơ chế phân tử; một phân loại không phản ánh (và không được dự định để) các tính năng cấu trúc của các enzym. Một phân loại của glycoside hydrolases trong gia đình dựa trên axit amin tự tương tự đã được đề xuất một vài năm trước đây. Bởi vì có một mối quan hệ trực tiếp giữa trình tự và gấp tương, một phân loại:(i) phản ánh các tính năng cấu trúc của các enzym tốt hơn so với các đặc trưng bề mặt duy nhất của họ,(ii) giúp để lộ các mối quan hệ tiến hóa giữa các enzym,(iii) cung cấp một công cụ thuận tiện để lấy được thông tin mechanistic [1] [2](iv) minh họa khó khăn trong phát sinh mối quan hệ giữa các thành viên gia đình và đặc trưng bề mặtCơ sở dữ liệu đang hoạt động Carbohydrate enzyme (CAZy) cung cấp một danh sách cập nhật liên tục của glicozit rất gia đình. Bởi vì các nếp gấp của protein bảo tồn tốt hơn so với trình tự của họ, một số các gia đình có thể được nhóm lại trong 'gia tộc': (i) khi trình tự mới được tìm thấy có liên quan đến nhiều hơn một gia đình,(ii) khi tăng độ nhạy của chuỗi so sánh phương pháp hoặc(iii) khi cấu trúc quyết định chứng minh sự giống nhau giữa các thành viên gia đình khác nhau [3]Các 'được thành lập gia tộc' được đưa ra trong các hình thức của một bảng dưới đây.

Kết quả (Việt) 2:

Hydrolases glycoside (EC 3.2.1.-) là một nhóm rộng rãi của các enzym thủy phân mà các trái phiếu glycosidic giữa hai hoặc nhiều carbohydrate hay giữa một carbohydrate và một phân nưa không carbohydrate. Các IUBMB Enzyme danh pháp của hydrolases glycoside được dựa trên đặc trưng bề mặt của họ và đôi khi vào cơ chế phân tử của chúng; một phân loại như vậy không phản ánh (và không có ý định) các đặc điểm cấu trúc của các enzym. Một phân loại của hydrolases glycoside trong gia đình dựa trên acid amin tương tự đã được đề xuất một vài năm trước đây. Bởi vì có một mối quan hệ trực tiếp giữa các trình tự và gấp tương đồng, một phân loại như: (i) phản ánh các đặc điểm cấu trúc của các enzym này tốt hơn so với chất nền đặc trưng duy nhất của họ, (ii) giúp tiết lộ mối quan hệ tiến hóa giữa các enzyme, (iii) cung cấp một công cụ thuận tiện để lấy được thông tin cơ học [1] [2] (iv) minh họa các khó khăn trong việc phát sinh các mối quan hệ giữa các thành viên trong gia đình và chất nền đặc Cơ sở dữ liệu Carbohydrate-Active Enzymes (CAZy) cung cấp một danh sách cập nhật liên tục của các gia đình glycoside hydrolase. Bởi vì các nếp gấp của protein là tốt hơn được bảo tồn hơn trình tự của họ, một số gia đình có thể được nhóm lại trong "dòng họ": (i) khi trình tự mới được phát hiện là có liên quan đến nhiều hơn một gia đình, (ii) khi độ nhạy của so sánh trình tự phương pháp được tăng hoặc (iii) khi xác định cấu trúc thể hiện sự giống nhau giữa các thành viên trong gia đình khác nhau [3] Các thành lập 'tộc' được đưa ra trong hình thức của một bảng dưới đây.