3.2 Molecular modeling of MA2077Mol

3.2 Molecular modeling of MA2077
Molecular modeling of MA2077 was performed using WAM [21] and the model was viewed as mentioned in
Section 2.4. In MA2077, five residues of VH pertaining to vernier zone (H48:I, H67:A, H69:L, H71:V, and H78:A) and one residue belonging to both vernier zone as well as interchain packing (H93:T) were analyzed for interaction with CDRs, since these were non-identical in the human template. Representative analysis of interaction of H48:I (I156) and H93:T (T205) with other residues within a distance cut-off of 5 Å has been shown (Supporting information, Fig. S1A and S1B). The isoleucine at H48 (I156) was predicted to interact with six other residues, out of which, two residues H169 and F172 belong to CDR2. Moreover, I156 interacts with W155 and G157, which were both predicted to be in the vernier zone and common to the human template. In addition, I156 also interacted with the CDR1 terminating residue W144, which is conserved across the murine and human templates (Supporting information, Fig. S1A). Similarly, threonine at H93 (T205) was predicted to interact with six other residues, three of which G207, F213, and Y215 belong to CDR3. T205 also interacted with W216 at the boundary of CDR3 and the vernier zone residue R206, both of which are conserved across the murine and human sequences (Supporting information, Fig. S1B).

Kết quả (Việt) 1:

3.2 phân tử mô hình của MA2077Các mô hình phân tử của MA2077 đã được thực hiện bằng cách sử dụng WAM [21] và các mô hình đã được xem như đã đề cập trongPhần 2.4. Trong MA2077, các dư lượng năm của VH liên quan đến khu vực vernier (H48: tôi, H67:A, H69:L, H71:V, và H78:A) và một dư lượng thuộc cả vernier khu vực cũng như interchain đóng gói (H93:T) đã được phân tích cho tương tác với CDRs, kể từ khi chúng được không giống nhau trong mẫu của con người. Đại diện phân tích của các tương tác của H48: tôi (I156) và H93:T (T205) với các dư lượng trong một khoảng cách cắt của 5 Å đã được hiển thị (thông tin hỗ trợ, hình. S1A và S1B). Isoleucine tại H48 (I156) đã được dự đoán để tương tác với sáu dư lượng khác, trong đó, hai dư lượng H169 và F172 thuộc về CDR2. Hơn nữa, I156 tương tác với W155 và G157, đã được dự đoán là ở vùng vernier và phổ biến cho các mẫu của con người. Ngoài ra, I156 cũng tương tác với các dư lượng terminating CDR1 W144, mà bảo tồn trên chuột và con người mẫu (hỗ trợ thông tin, hình. S1A). Tương tự, threonine tại H93 (T205) đã được dự đoán để tương tác với sáu khác dư lượng, ba trong số đó G207, F213 và Y215 thuộc về CDR3. T205 cũng tương tác với W216 ở ranh giới của CDR3 và dư lượng vernier khu R206, cả hai đều được bảo tồn qua các chuỗi các và con người (hỗ trợ thông tin, hình. S1B).

Kết quả (Việt) 2:

3.2 Mô hình phân tử của MA2077
mô hình phân tử của MA2077 được thực hiện bằng cách sử dụng WAM [21] và các mô hình đã được xem như đã đề cập trong
phần 2.4. Trong MA2077, năm dư lượng VH liên quan đến Vernier khu (H48: I, H67: A, H69: L, H71: V, và H78: A) và một dư lượng thuộc cả khu vernier cũng như buộc xây xích đóng gói (H93: T ) được phân tích cho sự tương tác với các CDR, vì đây là những không giống nhau trong các mẫu của con người. Phân tích đại diện tương tác của H48: I (I156) và H93: T (T205) có dư lượng khác trong một khoảng cách cut-off của 5 Å đã được chứng minh (Hỗ trợ thông tin, hình S1A và S1B.). Các isoleucine tại H48 (I156) được dự đoán sẽ tương tác với sáu phế liệu khác, trong đó, hai dư H169 và F172 thuộc CDR2. Hơn nữa, I156 tương tác với W155 và G157, mà cả hai đều dự đoán là trong vùng vernier và phổ biến cho các mẫu con người. Ngoài ra, I156 cũng tương tác với các CDR1 chấm dứt dư lượng W144, được bảo tồn qua (thông tin hỗ trợ, hình. S1A) chuột và mẫu con người. Tương tự như vậy, threonine ở H93 (T205) được dự đoán sẽ tương tác với sáu phế liệu khác, ba trong số đó G207, F213, và Y215 thuộc CDR3. T205 cũng tương tác với W216 tại ranh giới của CDR3 và vùng vernier cặn R206, cả hai đều được bảo tồn qua (thông tin hỗ trợ, S1B hình.) Chuột và trình tự của con người.