Comparisons of our siphoviral phage

Comparisons of our siphoviral phage genomes to 26 other bacteriophage genomes revealed 3 shared clusters of orthologous groups, 2 of particular interest within this core genome was an endolysin (PF01520, an N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase) potentially capable of digesting the C. perfringens peptidoglycan and a holin (PF04531) that dis rupts the bacterial cell wall. Comparative analyses of the evolutionary history and genomic context of these common phage proteins revealed 2 important results: 1) strongly significant host-specific sequence variation within the endolysin, and 2) a protein domain architecture apparently unique to our phage genomes in which the endolysin is located upstream of its associated holin.

Kết quả (Việt) 1:

So sánh của chúng tôi bộ gen phage siphoviral phải 26 khác bacteriophage bộ gen tiết lộ 3 cụm chia sẻ của nhóm orthologous, 2 quan tâm đặc biệt trong bộ gen lõi này là một endolysin (PF01520, một amidase N-acetylmuramoyl-l-alanine) có khả năng có khả năng tiêu hóa C. perfringens peptidoglycan và một holin (PF04531) mà dis rupts tế bào vi khuẩn. Các phân tích so sánh của lịch sử tiến hóa và gen bối cảnh của các protein thực khuẩn thường tiết lộ 2 các kết quả quan trọng: 1) mạnh mẽ đáng kể dành riêng cho máy chủ lưu trữ chuỗi biến thể trong endolysin, và 2) là một kiến trúc protein miền duy nhất rõ ràng cho chúng tôi bộ gen phage trong đó endolysin là phía thượng lưu của nó liên quan đến holin.

Kết quả (Việt) 2:

So sánh bộ gen của phage siphoviral của chúng tôi đến 26 bộ gen vi khuẩn khác thổ lộ 3 cụm chia sẻ của nhóm orthologous, 2 quan tâm đặc biệt trong hệ gen của lõi này là một endolysin (PF01520, một N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase) có khả năng có khả năng tiêu hóa C. perfringens peptidoglycan và một Holín (PF04531) mà dis rupts vách tế bào vi khuẩn. Phân tích so sánh của lịch sử tiến hóa và bối cảnh của bộ gen của các protein thực khuẩn thường thấy 2 kết quả quan trọng: 1) mạnh đáng kể sự thay đổi trình tự chủ cụ thể trong endolysin, và 2) một protein cấu trúc miền dường như duy nhất cho bộ gen phage của chúng tôi trong đó là endolysin nằm ở thượng nguồn của Holín liên quan của nó.