ABSTRACT In Arabidopsis seeds, germ

ABSTRACT In Arabidopsis seeds, germination is promoted only by phytochromes, principally phytochrome B (phyB) and
phytochrome A (phyA). Despite the abundant information concerning the molecular basis of phyB signaling downstream
of PIF1/PIL5, the signaling network inducing germination by phyA is poorly known. Here, we describe the influence of
phyA on the transcriptome of Arabidopsis seeds when germination is induced by a far-red (FR) pulse. The expression of
11% of the genome was significantly regulated by phyA. Most of the genes were up-regulated and the changes noted
late (i.e. 5 h after a FR pulse), whereas changes in down-regulated genes were more abundant earlier (i.e. 0.5 h after a FR
pulse). Auxin- and GA-associated elements were overrepresented in the genes that were modified by phyA. A significant
number of genes whose expression was affected by phyA had not been previously reported to be dependent on PIL5.
Among them, homozygotic mutant seeds of MYB66, a SAUR-like protein, PIN7, and GASA4 showed an impaired promo-
tion of germination by phyA. Natural variation at the transcriptional level was found in early signaling and GA metabolic
genes, but not in ABA metabolic and expansin genes between Columbia and Landsberg erecta accessions. Although
phyA and phyB/PIL5 signaling pathways share some molecular components, our data suggest that phyA signaling is
partially independent of PIL5 when germination is promoted by very low fluences of light.

Kết quả (Việt) 1:

Trừu tượng trong Arabidopsis hạt, nảy mầm được phát huy chỉ bởi phytochromes, chủ yếu phytochrome B (phyB) và phytochrome (phyA). Mặc dù các thông tin phong phú liên quan đến cơ sở phân tử của phyB ở hạ nguồn tín hiệu của PIF1/PIL5, tín hiệu mạng inducing nảy mầm bởi phyA kém được biết đến. Ở đây, chúng tôi mô tả ảnh hưởng của phyA trên transcriptome Arabidopsis hạt khi nảy mầm gây ra bởi một xung (FR) far-red. Sự biểu hiện của 11% của bộ gen đã được đáng kể quy định của phyA. Hầu hết các gen đã được quy định lên và thay đổi các ghi nhận muộn (tức là 5 h sau đợt xung FR), trong khi những thay đổi trong quy định xuống gen đã phong phú hơn trước đó (tức là cách 0.5 h sau một FR xung). Auxin và GA kết hợp các yếu tố đã được overrepresented trong các gen đã được thay đổi bởi phyA. Một đáng kể số lượng các gen có biểu hiện bị ảnh hưởng bởi phyA không có được báo cáo trước đó phụ thuộc vào PIL5. Trong số đó, homozygotic đột biến hạt giống của MYB66, một giống như SAUR protein, PIN7, và GASA4 cho thấy một quảng cáo bị suy giảm-tion của nảy mầm bởi phyA. Các biến thể tự nhiên ở mức transcriptional được tìm thấy trong đầu tín hiệu và GA trao đổi chất gen, nhưng không phải tại ABA trao đổi chất và expansin gen giữa Columbia và Landsberg erecta accessions. Mặc dù phyA và phyB/PIL5 tín hiệu con đường chia sẻ một số thành phần phân tử, dữ liệu của chúng tôi cho thấy rằng phyA tín hiệu là một phần độc lập của PIL5 khi nảy mầm thúc đẩy bởi fluences rất thấp của ánh sáng.

Kết quả (Việt) 2:

TÓM TẮT Trong hạt giống Arabidopsis, nảy mầm được khuyến khích chỉ bởi phytochrome, chủ yếu phytochrome B (phyB) và
phytochrome A (Phya). Mặc dù các thông tin phong phú liên quan đến các cơ sở phân tử của phyB hiệu hạ lưu
của PIF1 / PIL5, mạng báo hiệu gây sự nảy mầm của Phya được ít được biết đến. Ở đây, chúng ta mô tả ảnh hưởng của
Phya trên transcriptome giống Arabidopsis khi nảy mầm được gây ra bởi một xa-đỏ (FR) xung. Sự biểu hiện của
11% bộ gen đã được quy định đáng kể bởi Phya. Hầu hết các gen tăng có quy định và thay đổi ghi chú
cuối (tức là 5 giờ sau khi một xung FR), trong khi những thay đổi trong gen quy định xuống được phong phú hơn trước đó (tức là 0,5 giờ sau khi FR
xung). Auxin- và các yếu tố liên quan GA được nhiều ở các gen đã được sửa đổi bởi Phya. Một đáng kể
số lượng gen có biểu hiện bị ảnh hưởng bởi Phya trước đó đã không được báo cáo là phụ thuộc vào PIL5.
Trong số đó, hạt giống đột biến của homozygotic MYB66, một protein Saur giống, pin7, và GASA4 cho thấy một khuyến mãi suy
tion của sự nảy mầm của Phya. Biến đổi tự nhiên ở mức độ phiên mã đã được tìm thấy trong tín hiệu sớm và trao đổi chất GA
gen, nhưng không phải trong ABA trao đổi chất và expansin gen giữa Columbia và Landsberg đan có erecta. Mặc dù
Phya và phyB / PIL5 đường tín hiệu chia sẻ một số thành phần phân tử, dữ liệu của chúng tôi cho thấy rằng tín hiệu Phya là
một phần độc lập của PIL5 khi nảy mầm được thúc đẩy bởi fluences rất thấp của ánh sáng.