A nucleoside triphosphate (NTP) is a molecule containing a nucleoside bound to three phosphates (also known as a nucleotide). Nucleotide derivatives are necessary for life, as they are the building blocks of nucleic acids and have thousands of other roles in cell metabolism and regulation. NTPs generally provide energy and phosphate group for phosphorylations.
Natural nucleotide triphosphates include adenosine triphosphate (ATP), guanosine triphosphate (GTP), cytidine triphosphate (CTP), 5-methyluridine triphosphate (m5UTP), and uridine triphosphate (UTP). ATP is a major source of cellular energy. GTP is a very frequent cofactor of enzymes and proteins.
The terms ATP, GTP, CTP, and UTP refer to those nucleotide triphosphates that contain ribose. The nucleotide triphosphates containing deoxyribose are called dNTPs, and take the prefix deoxy- in their names and small d- in their abbreviations: deoxyadenosine triphosphate (dATP), deoxyguanosine triphosphate (dGTP), deoxycytidine triphosphate (dCTP), deoxythymidine triphosphate (dTTP) and deoxyuridine triphosphate. The dNTPs are the building blocks for DNA (they lose two of the phosphate groups in the process of incorporation).
Apart from (d)ATP, (d)GTP, (d)CTP, (d)TTP and (d)UTP, there are other less abundant NTPs, such as intermediates of nucleotide metabolism, but also "rare" natural nucleotides or even artificial nucleotides.[1] An example of rare NTPs are the tautomeric forms of some NTPs. They can cause mismatched base pairing during DNA replication. For example, a tautomeric form of cytosine is capable of forming 3 hydrogen bonds with adenine, and it will spontaneously tautomerize to its original cytosine form, causing a mismatch. By a similar token, the deamination of cytosine leads to uracil, whereas a deamination of a commonly encountered (in eukaryotes) 5-methylcytosine will lead to thymine. However, the 3' to 5' exonuclease activity of DNA polymerase III ensures that mismatched bases are excised during replication.
Generally nucleotides are nucleosides (a ribose/deoxyribose sugar covalently bonded to a nitrogenous base, such as adenine) that have 5' phosphate(s). However, for the sake of technical terminology, nucleotides are given classifications as nucleosides with a suffix describing the number of phosphates present in a specific unit. For example, if a nucleotide has one phosphate, it is a nucleoside monophosphate (NMP). If the nucleotide has two phosphates, then it is called a nucleoside diphosphate (NDP), and for three, it is a nucleoside triphosphate (NTP). The nucleotides that contain a ribose sugar are the monomers of RNA and those that contain a deoxyribose sugar compose DNA.
NTPs, NDPs and NMPs are ubiquitous in the cell cytoplasm, nucleus and organelles. Given their multifarious functions, their levels are under fairly tight metabolic control. Shifts in the ratio of available nucleotides can cause shifts in their incorporation, which, if not corrected, can lead to mutations. Most of the discussion on mutual ratios of nucleotides should belong under entry nucleotide, but concentrating strictly on the abundance of the triphosphorylated versions, we find that ATP spending is replenished by oxidative phosphorylation, while phosphorylation status of other nucleotides is regulated by NDP kinases (EC 2.7.4.6) and NMP kinases (EC 2.7.4.4) that use ATP pool as their cross-phosphorylation source.
Nucleoside triphosphate (NTP) là một phân tử chứa một nucleoside bị ràng buộc vào ba phốt phát (cũng được biết đến như là một nucleotide). Nucleotide derivatives là cần thiết cho cuộc sống, vì họ là những khối xây dựng của các axit nucleic và có hàng ngàn các vai trò trong sự trao đổi chất của tế bào và các quy định. NTPs thường cung cấp năng lượng và phosphate nhóm cho phosphorylations.Tự nhiên nucleotide triphosphates bao gồm adenosine triphosphate (ATP), guanosine triphosphate (GTP), cytidine triphosphate (CTP), 5-methyluridine triphosphate (m5UTP) và uridine triphosphate (UTP). ATP là một nguồn chính của năng lượng tế bào. GTP là một cofactor rất thường xuyên của enzyme và protein.Các điều khoản ATP, GTP, CTP và UTP tham khảo những triphosphates nucleotide có chứa ribose. Triphosphates nucleotide có chứa deoxyribose được gọi là dNTPs, và mất các tiền tố deoxy-trong tên và nhỏ d-trong chữ viết tắt của họ: deoxyadenosine triphosphate (dATP), deoxyguanosine triphosphate (dGTP), deoxycytidine triphosphate (dCTP), deoxythymidine triphosphate (dTTP) và deoxyuridine triphosphate. Các dNTPs là các khối xây dựng cho DNA (họ mất hai trong số các nhóm photphat trong quá trình kết hợp).Ngoài (d) ATP, (d) GTP, (d) CTP, (d) TTP và (d) UTP, có khác NTPs ít phổ biến hơn, chẳng hạn như trung gian chuyển hóa nucleotide, nhưng cũng "hiếm" nucleotide tự nhiên hoặc nhân tạo thậm chí nucleotide. [1] một ví dụ hiếm NTPs là tautome các hình thức của một số NTPs. Họ có thể gây ra không khớp cơ sở ghép trong quá trình sao chép DNA. Ví dụ, một dạng tautome cytosine có khả năng tạo 3 liên kết hiđrô với adenine, và nó sẽ tự tautomerize để hình thức cytosine có bản gốc của nó gây ra một không phù hợp. Bởi một mã thông báo tương tự, deamination cytosine dẫn đến uracil, trong khi một deamination một 5-methylcytosine thường gặp (ở sinh vật nhân chuẩn) sẽ dẫn đến thymine. Tuy nhiên, các 3' đến 5' exonuclease hoạt động của DNA polymerase III đảm bảo căn cứ không khớp được excised trong quá trình sao chép.Nói chung nucleotide là nucleosides (một đường ribose/deoxyribose một liên kết với một cơ sở nitrogenous, chẳng hạn như adenine) có 5' phosphate(s). Tuy nhiên, vì lợi ích của thuật ngữ kỹ thuật, nucleotide được phân loại như là nucleosides với một hậu tố mô tả số lượng phốt phát hiện diện trong một đơn vị cụ thể. Ví dụ, nếu một nucleotide có một phosphate, nó là một nucleoside monophosphate (NMP). Nếu nucleotide có hai phốt phát, sau đó nó được gọi là một diphosphate nucleoside (NDP), và cho ba, nó là một nucleoside triphosphate (NTP). Các nucleotide có chứa một đường ribose là monome RNA và những người có chứa đường deoxyribose soạn DNA.NTPs, NDPs and NMPs are ubiquitous in the cell cytoplasm, nucleus and organelles. Given their multifarious functions, their levels are under fairly tight metabolic control. Shifts in the ratio of available nucleotides can cause shifts in their incorporation, which, if not corrected, can lead to mutations. Most of the discussion on mutual ratios of nucleotides should belong under entry nucleotide, but concentrating strictly on the abundance of the triphosphorylated versions, we find that ATP spending is replenished by oxidative phosphorylation, while phosphorylation status of other nucleotides is regulated by NDP kinases (EC 2.7.4.6) and NMP kinases (EC 2.7.4.4) that use ATP pool as their cross-phosphorylation source.
đang được dịch, vui lòng đợi..