Sự khác nhau đã được tìm thấy trong các loài của chi Enterococcus, Lactococcus, Lactobacillus, Pediococcus, và Leuconostoc. Tuy nhiên, trường hợp của comigration đã được quan sát, khiến nó không thể đạt được một xác định rõ ràng của một số loài (Ercolini et al., 2001a). Thành viên của các chi Bacillus phân lập từ bánh mì ropy gần đây đã được phân biệt ở mức độ loài bằng phương pháp PCR-DGGE (Pepe et al., 2003). Guerrini et al. (2003) đã chứng minh rằng PCR-DGGE có thể được sử dụng để phân biệt Oenococcus oeni từ các loài khác có liên quan của Leuconostoc chi. Hơn nữa, DGGE động của khu vực V3 16S rDNA cũng được sử dụng để phân biệt Micrococcaceae từ xúc xích lên men bằng cách so sánh sự di cư của các amplicon từ các phân lập với các sản phẩm PCR từ các chủng tham khảo. Chủng Staphylococcus xylosus, Staphylococcus carnosus, và Staphylococcus simulans có thể được xác định (Cocolin et al., 2001b). Blaiotta et al. (2003) gần đây đã sử dụng chiến lược tương tự cho việc xác định các chủng tụ cầu từ xúc xích lên men. Trong trường hợp này, trong khi hầu hết các loài tụ cầu có thể phân biệt rõ ràng bằng cách phân tích DGGE của vùng V3 16S rDNA, một số loài có thể không thể phân biệt được. Kết luận là phân tích PCR-DGGE của vi khuẩn phân lập từ thực phẩm không phải lúc nào cũng thích hợp cho việc xác định tất cả các loài, nhưng có thể được sử dụng để sàng lọc và nhóm phân lập và giảm số lượng các nền văn hóa để xác định bởi phân tử hoặc sinh hóa
phương pháp. Việc xác định các chủng thực phẩm bởi PCRDGGE gần đây đã được thực hiện bằng cách khuếch đại các phần của các gen khác nhau từ 16S rDNA. Thật thú vị, Cocolin et al. (2002c) đã có thể xác định năm loài Listeria trên cơ sở của sự khác biệt trong các IAP khuếch đại (protein xâm lược liên quan) gen, trong đó cho phép các amplicon được phân cách bằng DGGE. Các tác giả cũng có thể phân biệt một số chủng vi khuẩn Listeria monocytogenes
và làm nổi bật những tiềm năng của phương pháp để chẩn đoán nhanh chóng của các loài Listeria trong thực phẩm.
đang được dịch, vui lòng đợi..
