Acidithiobacillus spp. were among t

Acidithiobacillus spp. were among the bacteria first named as species of Thiobacillus on the basis that they are rod- shaped Gram-negative bacteria that can oxidize reduced forms of sulfur. Most acidophilic species were reclassified as Acidithiobacillus spp. following phylogenetic (16S rRNA gene sequence) analysis (Kelly & Wood, 2000), but two ‘species’ of iron-oxidizing acidithiobacilli could not be affiliated to the new genus. One of these, ‘Thiobacillus ferrooxidans’ strain m-1, had previously been highlighted by Harrison (1982) as a probable distinct species. Many years later, it was fully described as the type strain of the novel genus and species Acidiferrobacter thiooxydans (Af. thiooxydans) (Hallberg et al., 2011). Af. thiooxydans shares many physiological characteristics with the type strain of At. ferrooxidans (At. ferrooxidansT), including being a facultative anaerobe that oxidizes iron and reduced sulfur (though not hydrogen). Differences include a requirement for reduced sulfur by Af. thiooxydans, and the fact that the latter is more tolerant of extreme acidity and moderately high temperatures (growth occurs at up to 47 uC) than At. ferrooxidansT. The situation with the other iron-oxidizing ‘Thiobacillus’ sp. (‘Thiobacillus prosperus’) still awaits reso- lution. The main distinguishing feature of this acidophile is its tolerance to salt, being able to grow in up to 3.5 % (0.6 M) sodium chloride, whereas most iron-oxidizing acidithiobacilli are inhibited by 1 % salt (Nicolle et al., 2009). Both the original strain and a novel strain (V6) have

been shown to grow optimally in the presence of 1–2 % sodium chloride and also, like Af. thiooxydans, require reduced sulfur (e.g. tetrathionate) for rapid oxidation of ferrous iron in liquid media (Nicolle et al., 2009).
The 16S rRNA gene sequences of Af. thiooxydans and ‘T. prosperus’ clearly place them within the Gammaproteo- bacteria, a class with which Acidithiobacillus spp. have generally been considered to be affiliated. However, Williams et al. (2010), using data obtained from multi- protein analysis, have challenged the generally accepted view that the order Acidithiobacillales is affiliated to the Gammaproteobacteria, and suggested that these bacteria, and the neutrophilic iron-oxidizing marine bacterium Mariprofundus ferrooxydans, diverged after the establish- ment of the Alphaproteobacteria and before the separation of the Betaproteobacteria/Gammaproteobacteria. A more obvious divergence from the pattern that all acidophilic iron-oxidizing proteobacteria are gammaproteobacteria is the named, but as yet non-validated, betaproteobacterium ‘Ferrovum myxofaciens’ (‘Fv. myxofaciens’) (Kimura et al., 2011).

Kết quả (Việt) 1:

Acidithiobacillus spp. là một trong các vi khuẩn đầu tiên được đặt tên như loài Thiobacillus trên cơ sở đó họ là cây gậy-hình vi khuẩn Gram âm có thể ôxy hóa giảm các hình thức của lưu huỳnh. Đặt acidophilic loài được phân loại lại như Acidithiobacillus spp. sau phát sinh loài phân tích (16S rRNA gene sequence) (Kelly & gỗ, 2000), nhưng hai 'loài' của oxy hóa sắt acidithiobacilli có thể không được liên kết để chi mới. Một trong số này, 'Thiobacillus ferrooxidans' căng thẳng m-1, có trước đó được đánh dấu bởi Harrison (1982) là một loài riêng biệt có thể xảy ra. Nhiều năm sau đó, nó đã được hoàn toàn mô tả như là các chủng loại của các tiểu thuyết chi và loài Acidiferrobacter thiooxydans (Af. thiooxydans) (Hallberg và ctv., năm 2011). AF. thiooxydans chia sẻ nhiều đặc điểm sinh lý với chủng loại tại. ferrooxidans (lúc ferrooxidansT), trong đó có là một danh dạng ôxi hóa lưu huỳnh sắt và giảm (mặc dù không phải hiđrô). Sự khác biệt bao gồm một yêu cầu về giảm lưu huỳnh bởi Af. thiooxydans, và thực tế là sau đó là hơn khoan dung của cực độ chua và nhiệt độ vừa phải cao (tăng trưởng xảy ra lúc lên đến 47 uC) hơn lúc. ferrooxidansT. Tình hình với khác oxy hóa sắt 'Thiobacillus' sp. ('Thiobacillus prosperus') vẫn đang chờ reso-lution. Các tính năng phân biệt chính của acidophile này là khả năng chịu muối, có thể phát triển lên đến 3,5% (0,6 M) clorua natri, trong khi hầu hết oxy hóa sắt acidithiobacilli ức chế bởi 1% muối (Nicolle et al., 2009). Sự căng thẳng ban đầu và một dòng cuốn tiểu thuyết (V6) được hiển thị để phát triển tối ưu sự hiện diện của 1-2% natri clorua và ngoài ra, như Af. thiooxydans, yêu cầu giảm lưu huỳnh (ví dụ như tetrathionate) cho quá trình oxy hóa nhanh chóng của sắt màu trong phương tiện truyền thông chất lỏng (Nicolle et al., 2009).16S rRNA gene chuỗi của Af. thiooxydans và 'T. prosperus' rõ ràng đặt chúng trong các vi khuẩn Gammaproteo, một lớp học với những Acidithiobacillus spp. có nói chung được coi là để được liên kết. Tuy nhiên, Williams et al. (2010), bằng cách sử dụng dữ liệu thu được từ phân tích đa-protein, đã thách thức giao diện chung được chấp nhận đơn đặt hàng Acidithiobacillales là liên kết để Gammaproteobacteria, và đề nghị các vi khuẩn, và neutrophilic sắt oxy hóa biển vi khuẩn Mariprofundus ferrooxydans, tách ra sau khi thiết lập-ment của Alphaproteobacteria và trước khi sự chia tách của Betaproteobacteria/Gammaproteobacteria. Một phân kỳ rõ ràng hơn từ các mô hình rằng tất cả acidophilic sắt oxy hóa sơ là gammaproteobacteria là được đặt tên, nhưng như được nêu ra không-xác nhận, betaproteobacterium 'Ferrovum myxofaciens' ('Fv. myxofaciens') (Kimura và ctv., năm 2011).

Kết quả (Việt) 2:

Acidithiobacillus spp. là những vi khuẩn đầu tiên có tên là loài Thiobacillus trên cơ sở đó họ đang rod- vi khuẩn Gram âm có hình dạng mà có thể oxy hóa các hình thức giảm của lưu huỳnh. Hầu hết các loài ưa acid đã được phân loại lại như Acidithiobacillus spp. sau khi phân tích phát sinh loài (trình tự gen 16S rRNA) (Kelly & Wood, 2000), nhưng hai 'loài' của acidithiobacilli sắt-oxy hóa có thể không được liên kết với các chi mới. Một trong những "Thiobacillus ferrooxidans 'căng m-1, trước đó đã được đánh dấu bởi Harrison (1982) là một loài riêng biệt có thể xảy ra. Nhiều năm sau đó, nó đã được mô tả đầy đủ như các loại biến dạng của chi tiểu thuyết và các loài Acidiferrobacter thiooxydans (Af. Thiooxydans) (Hallberg et al., 2011). Af. thiooxydans sẻ nhiều đặc điểm sinh lý với các loại chủng của At. ferrooxidans (Tại ferrooxidansT.), bao gồm cả bị một yếm khí tuỳ ý rằng oxy hóa sắt và giảm lưu huỳnh (mặc dù không phải hydrogen). Biệt này bao gồm một yêu cầu để giảm lưu huỳnh bằng Af. thiooxydans, và thực tế là sau này là hơn khoan dung độ axit cực cao và nhiệt độ cao vừa phải (tăng trưởng xảy ra với tốc độ lên đến 47 UC) so Tại. ferrooxidansT. Tình hình với các khác sắt-oxy hóa 'Thiobacillus' sp. ('Thiobacillus prosperus') vẫn đang chờ lution reso-. Các tính năng phân biệt chính của acidophile này là sự khoan dung của mình cho muối, có thể phát triển lên đến 3,5% (0,6 M) natri clorua, trong khi hầu hết acidithiobacilli sắt-oxy hóa bị ức chế bởi 1% muối (Nicolle et al., 2009). Cả hai chủng gốc và một chủng mới (V6) đã được hiển thị để phát triển tối ưu trong sự hiện diện của 1-2% natri clorua và cũng như Af. thiooxydans, đòi hỏi phải giảm lưu huỳnh (ví dụ như tetrathionate) cho quá trình oxy hóa nhanh chóng của sắt II trong môi trường lỏng (Nicolle et al., 2009). Các 16S rRNA trình tự gen của Af. thiooxydans và 'T. prosperus 'đặt rõ ràng chúng trong vi khuẩn Gammaproteo-, một lớp học mà Acidithiobacillus spp. nhìn chung bị coi là có liên quan. Tuy nhiên, Williams et al. (2010), sử dụng dữ liệu thu được từ phân tích protein đa, đã thách thức các quan điểm được chấp nhận chung rằng trật tự Acidithiobacillales là liên kết đến các Gammaproteobacteria, và cho rằng những vi khuẩn, và các vi khuẩn biển Mariprofundus ferrooxydans sắt-oxy hóa trung tính, tách ra sau khi thành lập - ment của Alphaproteobacteria và trước khi việc tách các Betaproteobacteria / Gammaproteobacteria. Một phân kỳ rõ ràng hơn từ các mô hình mà tất cả proteobacteria sắt-oxy hóa ưa acid là gammaproteobacteria là đặt tên, nhưng vẫn chưa không xác nhận, betaproteobacterium 'Ferrovum myxofaciens' ('FV. Myxofaciens') (Kimura et al., 2011).