Regardless of the choice of a given

Regardless of the choice of a given proteomic separation technique, gel-based or gel-free, a mass spectrometer is al-ways the primary tool for protein identification. Before the advent of MS, protein sequences were determined by Edman degradation. However, during the last decade, significant improvements have been made in the application of MS for the determination of protein sequences (Domon and Aeber-sold, 2006; Lambert et al., 2005). Mass spectrometers con-sist of an ion source, the mass analyzer and an ion detection system. Analysis of proteins by MS occurs in three major steps (a) protein ionization and generation of gas-phase ions, (b) separation of ions according to their mass to charge ratio and (c) detection of ions (Mann et al., 2001). In gel-free ap-proaches such as ICAT and MudPIT, samples are directly analyzed by MS whereas, in gel-based proteomics (2-DE and 2-D DIGE), the protein spots are first excised from the gel and then digested with trypsin. The resulting peptides are then separated by LC or directly analyzed by MS. The ex-perimentally-derived peptide masses are correlated with the
peptide fingerprints of known proteins in the databases using search engines (e.g. Mascot, Sequest).

Kết quả (Việt) 1:

Bất kể sự lựa chọn của một kỹ thuật tách proteomic nhất định, dựa trên gel hay gel-miễn phí, một máy đo phổ khối lượng là al-cách công cụ chính để xác định protein. Trước khi sự ra đời của MS, chuỗi protein đã được xác định bởi sự suy thoái của Edman. Tuy nhiên, trong suốt thập kỷ qua, cải tiến đáng kể đã được thực hiện trong các ứng dụng của MS cho việc xác định các chuỗi protein (Domon và Aeber bán ra, 2006; Lambert et al., 2005). Quang phổ kế khối lượng côn-sist một nguồn ion, phân tích khối lượng và một hệ thống phát hiện ion. Phân tích về protein của MS xảy ra trong ba bước chính (a) protein ion hóa và các thế hệ của giai đoạn khí ion, (b) phân chia các ion theo khối lượng của họ để tính tỉ lệ và (c) phát hiện của các ion (Mann và ctv., 2001). Ở miễn phí gel ap-proaches như ICAT và MudPIT, mẫu được trực tiếp phân tích bởi MS trong khi đó, trong gel dựa trên proteomic (2 DE và 2-D DIGE), điểm protein đầu tiên excised từ gel và sau đó tiêu hóa với trypsin. Peptide kết quả sau đó được tách ra bởi LC hoặc trực tiếp phân tích bởi MS. Khối lượng peptide ex-perimentally-nguồn gốc có tương quan với các peptide dấu vân tay được biết protein trong cơ sở dữ liệu bằng cách sử dụng công cụ tìm kiếm (ví dụ như Mascot, Sequest).

Kết quả (Việt) 2:

Bất kể sự lựa chọn của một kỹ thuật tách protein học nhất định, gel dựa trên hoặc gel-free, khối phổ là al-cách công cụ chính để xác định protein. Trước khi sự ra đời của MS, các chuỗi protein được xác định bởi sự suy thoái Edman. Tuy nhiên, trong thập kỷ qua, những cải tiến đáng kể đã được thực hiện trong các ứng dụng của MS để xác định các chuỗi protein (Domon và Aeber bán, 2006; Lambert et al., 2005). Quang phổ kế khối lượng con-sist của một nguồn ion, phân tích khối lượng và một hệ thống phát hiện ion. Phân tích các protein bằng MS xảy ra trong ba bước chính (a) ion hóa protein và thế hệ của các ion khí-pha, (b) tách các ion theo khối lượng của chúng để tính tỷ lệ và phát hiện (c) của các ion (Mann et al., 2001 ). Trong gel-free ap-proaches như iCat và MudPIT, các mẫu được phân tích trực tiếp của MS trong khi đó, trong proteomics gel dựa trên (2-DE và 2-D DIGE), các điểm protein lần đầu tiên được cắt ra từ gel và sau đó tiêu hóa với trypsin. Các peptide kết quả sau đó tách ra bởi LC hoặc trực tiếp phân tích bởi MS. Các khối lượng peptide cũ perimentally có nguồn gốc từ tương quan với các
dấu vân tay peptide của protein được biết đến trong cơ sở dữ liệu sử dụng công cụ tìm kiếm (ví dụ như Mascot, Sequest).