LINKING THE SOIL TO THE CLINICThe m

LINKING THE SOIL TO THE CLINIC
The mobility of resistance genes is well-documented in both the environment and in the clinic, but tangible links between the two remain elusive. The above-mentioned examples of aminoglycoside resistance (Benveniste and Davies, 1973), CTX-M in Kluyvera spp. (Humeniuk et al., 2002) and qnr in waterborne Vibrio, Shewanella, and Aeromonas (Poirel et al., 2005a,b; Baquero et al., 2008) are conclusive examples of recent exchange between the environmental and clinical resistomes. Comparing the amino acid sequence of the aminoglycoside phosphotransferase APH(3r) between transposons found in Gram-negative and Gram-positive pathogens and from environmental bacteria (Bacillus circulans and Streptomyces fradiae) also indicates that they have diverged from a common ancestor (Trieu-Cuot and Courvalin, 1986). These examples provide powerful evidence that resistance is able to move from the environment into pathogens, but given the prevalence of resistance genes in environmental reservoirs, certainly more examples of transfer exist?
The acquisition of antibiotic resistance by clinic pathogens from the environment must follow the same rules as all gene transfer events: the most likely place for gene exchange is a niche shared by pathogens and environmental organisms (Wiedenbeck and Cohan, 2011). Sommer et al. (2009) used functional genomics to clone and express DNA from the human microbiome and select for resistance to various antibiotics. The healthy human microbiome is presumably in constant contact with environmental organisms, but is also exposed to pathogenic microorganisms. This approach identified several new resistance factors, but importantly also identified a number of resistance genes harbored in the aerobic gut flora of healthy individuals that are also found in major pathogens (Sommer et al., 2009). Wiedenbeck and Cohan (2011) propose screening for resistance genes in the metagenomes of other organisms from which we frequently acquire pathogens, like agricultural animals, mice, ticks, and mosquitoes, as com- mensal microorganisms could provide an important link to pathogens.

Kết quả (Việt) 1:

LIÊN KẾT ĐẤT ĐẾN PHÒNG KHÁMDi động của gen kháng là các tài liệu trong cả hai môi trường và trong các phòng khám, nhưng các liên kết hữu hình giữa hai vẫn còn khó nắm bắt. Các ví dụ nêu trên aminoglycoside kháng (Benveniste và Davies, 1973), CTX-M Kluyvera spp. (Humeniuk et al., 2002) và qnr trong nghề Vibrio, Shewanella và Aeromonas (Poirel et al., 2005a, b; Baquero et al, 2008) là ví dụ kết luận tại cuộc trao đổi giữa môi trường và lâm sàng resistomes. So sánh trình tự axit amin aminoglycoside phosphotransferase APH(3r) giữa các transposon tìm thấy trong các tác nhân gây bệnh Gram âm và Gram dương và từ môi trường vi khuẩn (trực khuẩn circulans và Streptomyces fradiae) cũng chỉ ra rằng họ đã tách ra từ một tổ tiên chung (Trieu-Cuot và Courvalin, 1986). Những ví dụ này cung cấp bằng chứng mạnh mẽ sức đề kháng là khả năng di chuyển từ môi trường vào tác nhân gây bệnh, nhưng do sự phổ biến của gen kháng trong môi trường hồ chứa, chắc chắn thêm ví dụ về chuyển tồn tại?Việc mua lại của kháng kháng sinh của bệnh viện tác nhân gây bệnh từ môi trường phải thực hiện theo các quy tắc tương tự như tất cả các sự kiện chuyển gen: là nơi có nhiều khả năng cho việc trao đổi gen là một thích hợp được chia sẻ bởi các tác nhân gây bệnh và môi trường sinh vật (Wiedenbeck và Cohan, năm 2011). Sommer et al. (2009) sử dụng chức năng gen để sao chép và nhận DNA từ microbiome của con người và chọn cho sức đề kháng với thuốc kháng sinh khác nhau. Microbiome con người khỏe mạnh là có lẽ là liên tục tiếp xúc với môi trường sinh vật, nhưng cũng được tiếp xúc với vi sinh vật gây bệnh. Identified phương pháp tiếp cận này mới kháng nhiều yếu tố, nhưng quan trọng cũng identified một số gen kháng harbored trong flora hiếu khí đường ruột khỏe mạnh gồm các cá nhân cũng được tìm thấy trong các tác nhân gây bệnh chính (Sommer et al., 2009). Wiedenbeck và Cohan (2011) đề nghị kiểm tra cho các gen kháng trong metagenomes các sinh vật khác mà chúng tôi thường xuyên mua lại tác nhân gây bệnh, giống như các loài động vật nông nghiệp, con chuột, bọ ve, và muỗi, như com - mensal vi sinh vật có thể cung cấp một liên kết quan trọng với tác nhân gây bệnh.

Kết quả (Việt) 2:

LIÊN KẾT CỦA ĐẤT ĐẾN KHÁM
tính cơ động của các gen kháng là tốt tài liệu trong cả môi trường và trong phòng khám, nhưng các liên kết hữu hình giữa hai vẫn còn khó nắm bắt. Các ví dụ nêu trên của kháng sinh aminoglycoside (Benveniste và Davies, 1973), CTX-M trong Kluyvera spp. (. Humeniuk et al, 2002) và qnr trong đường nước Vibrio, Shewanella, và Aeromonas (Poirel et al, 2005a, b;.. Baquero et al, 2008) là những ví dụ thuyết phục về việc trao đổi gần đây giữa resistomes môi trường và lâm sàng. So sánh trình tự amino acid của APH aminoglycoside phosphotransferase (3r) giữa transposon được tìm thấy trong các mầm bệnh Gram âm và Gram dương và vi khuẩn môi trường (circulans Bacillus và Streptomyces fradiae) cũng chỉ ra rằng họ đã tách ra từ một tổ tiên chung (Triệu-Cuot và Courvalin, 1986). Những ví dụ này cung cấp bằng chứng mạnh mẽ rằng kháng có thể di chuyển từ môi trường vào các mầm bệnh, nhưng với sự phổ biến của các gen kháng trong hồ chứa môi trường, chắc chắn nhiều ví dụ về chuyển giao tồn tại?
Việc mua lại của kháng kháng sinh của phòng khám tác nhân gây bệnh từ môi trường phải tuân theo các quy tắc như tất cả các sự kiện chuyển gen: nơi có khả năng nhất để trao đổi gen là một niche được chia sẻ bởi các mầm bệnh và sinh vật môi trường (Wiedenbeck và Cohan, 2011). Sommer et al. (2009) đã sử dụng gen chức năng sao chép và bày tỏ DNA từ các microbiome con người và chọn cho sức đề kháng với các kháng sinh khác nhau. Các microbiome người khỏe mạnh là lẽ thường xuyên liên lạc với sinh vật môi trường, mà còn được tiếp xúc với các vi sinh vật gây bệnh. Cách tiếp cận này identi fi ed một số yếu tố kháng cự mới, nhưng quan trọng cũng identi fi ed một số gen kháng ấp ủ trong aerobic ora ruột fl của người khỏe mạnh cũng được tìm thấy trong tác nhân gây bệnh chủ yếu (Sommer et al., 2009). Wiedenbeck và Cohan (2011) đề nghị sàng lọc gen kháng trong metagenomes của các sinh vật khác mà từ đó chúng tôi thường xuyên có được tác nhân gây bệnh, như động vật nông nghiệp, chuột, bọ ve và muỗi, như đồng vi sinh vật mensal có thể cung cấp một liên kết quan trọng với các mầm bệnh.