15.4 What Kinds of Covalent Modific

15.4 What Kinds of Covalent Modification Regulate the Activity of Enzymes? 461
substrate sequence has an alanine residue where serine occurs in the PKA target se-
quence; Ala is sterically similar to serine but lacks a phosphorylatable OH group.
When these PKA regulatory subunits bind cAMP, they undergo a conformational
change and dissociate from the catalytic (C) subunits, and the active site of PKA is free
to bind and phosphorylate its targets. In other protein kinases, the pseudosubstrate
sequence involved in intrasteric control and the kinase domain are part of the same
polypeptide chain. In these cases, binding of an allosteric effector (like cAMP) in-
duces a conformational change in the protein that releases the pseudosubstrate se-
quence from the active site of the kinase domain.
The abundance of many protein kinases in cells is an indication of the great impor-
tance of protein phosphorylation in cellular regulation. Exactly 113 protein kinase
genes have been recognized in yeast, and 868 putative protein kinase genes have been
identified in the human genome. Tyrosine kinases (protein kinases that phosphorylate
Tyr residues) occur only in multicellular organisms (yeast has no tyrosine kinases).
Tyrosine kinases are components of signaling pathways involved in cell–cell communi-
cation (see Chapter 32).
Phosphorylation Is Not the Only Form of Covalent Modification
That Regulates Protein Function
Several hundred different chemical modifications of proteins have been dis-
covered thus far, ranging from carboxylation (addition of a carboxyl group),
acetylation (addition of an acetyl group, see Figure 29.30), prenylation (see
Figure 9.23), and glycosylation (see Figures 7.32–7.39) to covalent attachment
of a polypeptide to the protein (addition of ubiquitin to free amino groups on
proteins; see Figure 31.8), to name just a few. A compilation of known protein
modifications can be found in RESID, the European Bioinformatics Institute
online database (http://www.ebi.ac.uk/RESID/). Only a small number of these co-
valent modifications are used to achieve metabolic regulation through reversible
conversion of an enzyme between active and inactive forms. Table 15.3 presents a few
examples.
+ cAMP
cAMP cAMP
cAMP cAMP
+ 2
C C
C R R R R
R2C2
inactive R2–(cAMP)4
ANIMATED FIGURE 15.10 Cyclic
AMP–dependent protein kinase (also known as
PKA) is a 150- to 170-kD R2C2 tetramer in mam-
malian cells. The two R (regulatory) subunits bind
cAMP (KD  3 -
108 M); cAMP binding releases
the R subunits from the C (catalytic) subunits.
C subunits are enzymatically active as monomers.
See this figure animated at www.cengage.com/
login.
Reaction Amino Acid Side Chain Reaction (see figure indicated)
Adenylylation Tyrosine Transfer of AMP from ATP to Tyr-OH
(Figure 25.16)
Uridylylation Tyrosine Transfer of UMP from UTP to Tyr-OH
(Figure 25.17)
ADP-ribosylation Arginine Transfer of ADP-ribose from NAD to
Arg (Figure 25.8)
Methylation Glutamate Transfer of methyl group from
S-adenosylmethionine to Glu
-carboxyl group
Oxidation-reduction Cysteine (disulfide) Reduction of Cys-S−S-Cys to
Cys-SH HS-Cys (Figure 21.27)
TABLE 15.3 Additional Examples of Regulation by Covalent Modification

Kết quả (Việt) 1:

15.4 những gì loại của cộng hoá trị sửa đổi điều chỉnh hoạt động của các enzym? 461bề mặt dãy có một dư lượng alanine nơi serine xảy ra trong PKA mục tiêu se-quence; Ala là sterically tương tự như serine nhưng thiếu một nhóm OH phosphorylatable.Khi những subunits quy định PKA ràng buộc trại, họ trải qua một conformationalthay đổi và chia rẻ từ subunits (C) chất xúc tác, và các trang web hoạt động của PKA là miễn phíđể ràng buộc và phosphorylate mục tiêu của mình. Trong các protein kinase, pseudosubstratetrình tự tham gia vào intrasteric kiểm soát và kinase miền là một phần của cùng mộtpolypeptide chuỗi. Trong những trường hợp này, ràng buộc của một effector allosteric (như trại) tại -duces là một thay đổi conformational của protein mà bản phát hành pseudosubstrate se -quence từ các trang web hoạt động của tên miền kinase.Sự phong phú của nhiều protein kinase trong tế bào là một dấu hiệu của impor lớn-tance của phosphorylation protein trong di động quy định. Chính xác 113 protein kinasegen đã được công nhận trong nấm men, và 868 giả định protein kinase gen đãđược xác định trong bộ gen của con người. Tyrosine kinase (protein kinase mà phosphorylateDư lượng TYR) xảy ra chỉ trong các sinh vật đa bào (nấm men đã không tyrosine kinase). Tyrosine kinase là thành phần của tín hiệu con đường tham gia vào tế bào-tế bào communi-cation (xem chương 32).Phosphorylation không phải là hình thức duy nhất của cộng hoá trị sửa đổi Đó quy định chức năng ProteinSửa đổi một vài trăm hóa học khác nhau của protein có là dis-được bảo hiểm như vậy đến nay, khác nhau, từ carboxylation (bổ sung của một nhóm carboxyl),acetylation (bổ sung của một Nhóm axetyl, xem hình 29,30), prenylation (xemCon số 9.23), và glycosylation (xem số liệu 7.32-7.39) để tập tin đính kèm cộng hoá trịcủa một polypeptide (bổ sung của ubiquitin miễn phí nhóm amino proteinprotein; Xem hình 31.8), để đặt tên chỉ là một vài. Một trình biên dịch được biết đến proteinSửa đổi có thể được tìm thấy ở RESID, viện tin sinh học châu Âutrực tuyến cơ sở dữ liệu (http://www.ebi.ac.uk/RESID/). Chỉ một số ít các co-c cải tiến được sử dụng để đạt được các quy định trao đổi chất thông qua tay kéochuyển đổi của một loại enzyme giữa dạng hoạt động và không hoạt động. Bảng 15.3 trình bày một vàiVí dụ.+ cắm trạiTrại trạiTrại trại+ 2B bC R R R RR2C2R2 không hoạt động-(trại) 4Hoạt hình con số 15,10 CyclicAMP-phụ thuộc vào protein kinase (còn gọi làPKA) là một tetramer R2C2 kD 150 để 170 ở mam-tế bào Mali. Ràng buộc hai R (Pháp lý) subunitsTrại (KD 3- 10 8 M); Trại ràng buộc bản phát hànhR subunits từ subunits (xúc tác) C.C subunits enzymatically hoạt động như monome.Xem này hình hoạt hình lúc www.cengage.com/đăng nhập.Phản ứng dây chuyền phản ứng axít amin bên (xem hình chỉ ra)Adenylylation Tyrosine chuyển của AMP từ ATP Tyr-Oh(Hình 25.16)Uridylylation Tyrosine chuyển của UMP từ UTP Tyr-Oh(Figure 25.17)ADP-ribosylation Arginine Transfer of ADP-ribose from NAD toArg (Figure 25.8)Methylation Glutamate Transfer of methyl group from S-adenosylmethionine to Glu -carboxyl groupOxidation-reduction Cysteine (disulfide) Reduction of Cys-S−S-Cys to Cys-SH HS-Cys (Figure 21.27)TABLE 15.3 Additional Examples of Regulation by Covalent Modification

Kết quả (Việt) 2:

15.4 Các loại gì của cộng hoá trị Modification Quy định Hoạt động của enzim? 461
dãy chất nền có một dư lượng alanine nơi serine xảy ra trong mục tiêu PKA se-
sequence; Ala là sterically tương tự như serine nhưng lại thiếu một nhóm OH phosphorylatable.
Khi các tiểu đơn vị quy định PKA ràng buộc cAMP, họ trải qua một cấu hình không
thay đổi và phân tách từ các chất xúc tác (C) tiểu đơn vị, và vị trí hoạt động của PKA là miễn phí
để ràng buộc và phosphorylate mục tiêu của mình . Trong protein kinase khác, pseudosubstrate
trình tự liên quan đến kiểm soát intrasteric và miền kinase là một phần của cùng một
chuỗi polypeptide. Trong những trường hợp này, ràng buộc của một effector allosteric (như cAMP) trong-
duces một sự thay đổi về hình dạng của protein mà nhả se- pseudosubstrate
sequence từ các trang web đang hoạt động trong lĩnh vực kinase.
Sự phong phú của nhiều protein kinase trong tế bào là một dấu hiệu của các trọng lớn
tầm phosphoryl hóa protein trong các quy định của tế bào. Chính xác 113 kinase protein
gene đã được ghi nhận trong nấm men, và 868 gen protein kinase giả định đã được
xác định trong hệ gen của con người. Tyrosine kinase (protein kinase mà phosphorylate
dư Tyr) chỉ xảy ra ở các sinh vật đa bào (nấm men không có tyrosine kinase).
Tyrosine kinase là thành phần của đường tín hiệu liên quan đến tế bào của tế bào communi-
cation (xem Chương 32).
Phosphoryl Is Not Mẫu Chỉ các kết hóa trị Modification
Đó Điều chỉnh chức năng Protein
Vài trăm thay đổi hóa học khác nhau của protein đã được dis-
bao phủ vậy, đến nay, từ carboxyl (thêm một nhóm cacboxyl),
acetyl hóa (thêm một nhóm acetyl, xem hình 29.30), prenylation (xem
Hình 9,23), và glycosyl hóa (xem hình 7,32-7,39) để kết cộng hóa trị gắn bó
của một polypeptide với protein (thêm ubiquitin để nhóm amin tự do trên
protein, xem hình 31.8), tên chỉ là một vài. Một trình biên dịch của protein được gọi
thay đổi có thể được tìm thấy trong resid, các Bioinformatics châu Âu Viện
cơ sở dữ liệu trực tuyến (http://www.ebi.ac.uk/RESID/). Chỉ có một số nhỏ các đồng
sửa đổi valent được sử dụng để đạt được quy định trao đổi chất qua đảo ngược
chuyển đổi của một enzyme giữa các hình thức hoạt động và không hoạt động. Bảng 15.3 trình bày một vài
ví dụ.
+ CAMP
cAMP cAMP
cAMP cAMP
+ 2
CC
C RRRR
R2C2
không hoạt động R2- (cAMP) 4
ANIMATED HÌNH 15.10 Cyclic
AMP phụ thuộc vào protein kinase (còn được gọi là
PKA) là một 150 tới 170 kD R2C2 tetramer trong mam-
tế bào Mali. Hai R (điều chỉnh) tiểu đơn vị liên kết
cAMP (KD 3 -
10 8 M?); cAMP ràng buộc phát hành
các tiểu đơn vị R từ (xúc tác) tiểu đơn vị C.
C tiểu đơn vị là enzym hoạt động như là monome.
Xem hình này hoạt hình tại www.cengage.com/
đăng nhập.
Reaction Amino Acid Side Chain Reaction (xem hình chỉ định)
Adenylylation Tyrosine Chuyển nhượng AMP từ ATP để Tyr-OH
(Hình 25.16)
Uridylylation Tyrosine Chuyển UMP từ UTP để Tyr-OH
(Hình 25.17)
ADP-ribosylation Chuyển Arginine của ADP-ribose từ NAD? để
Arg (Hình 25.8)
Methyl hóa Glutamate Chuyển nhóm methyl từ
S-adenosylmethionine để Glu
-carboxyl nhóm?
ử Cysteine ​​(disulfide) Giảm Cys-S-S-Cys đến
Cys-SH HS-Cys (Hình 21.27)
TABLE 15.3 Các ví dụ bổ sung Quy chế bởi kết hóa trị Modification