Synonymy of the yeast genera Monili

Synonymy of the yeast genera Moniliella and Trichosporonoides and proposal of Moniliella fonsecae sp. nov. and five new species combinations
Carlos A. Rosa1, Sasitorn Jindamorakot2, Savitree Limtong3, Takashi Nakase4, Marc-André Lachance5, Abel Fidalgo-Jiménez6,7, Heide-Marie Daniel7, Fernando C. Pagnocca8, João Inácio9 and Paula B. Morais10
+ Author Affiliations

1Departamento de Microbiologia, ICB, CP 486, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG 31270-901, Brazil
2BIOTEC Culture Collection, National Center for Genetic Engineering and Biotechnology (BIOTEC), 113 Paholyothin Road, Klong 1, Klong Luang, Pathumthani 12120, Thailand
3Department of Microbiology, Faculty of Science, Kasetsart University, 50 Paholyothin Road, Bangkok 10900, Thailand
4NITE Biological Resource Center (NBRC), National Institute of Technology and Evaluation, 2-5-8 Kazusakamatari, Kisaraza, Chiba 292-0818, Japan
5Department of Biology, University of Western Ontario, London, ON N6A 5B7, Canada
6Instituto de Ecología y Sistemática (IES), Carretera de Varona, km 3½ Capdevila, Boyeros, AP8029 CP 10800, Ciudad de la Habana, Cuba
7Mycothèque de l'Université catholique de Louvain (MUCL), Member of the Belgian Coordinated Collection of Microorganisms (BCCMTM), Croix du Sud 3, bte 6, 1348 Louvain la-Neuve, Belgium
8Departamento de Bioquímica e Microbiologia, Centro de Estudos de Insetos Sociais, Universidade Estadual Paulista, Avenida 24A, 1515 Rio Claro, SP 13506-900, Brazil
9Centro de Recursos Microbiológicos (CREM), Biotechnology Unit, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade Nova de Lisboa, 2829-516 Caparica, Portugal
10Laboratório de Microbiologia Ambiental e Biologia, Campus Universitário de Palmas, Fundação Universidade Federal do Tocantins, Palmas, Tocantins 77010-154, Brazil
Correspondence
Carlos A. Rosa
carlrosa@icb.ufmg.br

Next Section
Abstract

Analyses of nucleotide sequences from the D1/D2 domains of the large-subunit rDNA and phenotypic characteristics showed that the genera Moniliella and Trichosporonoides are members of a single, monophyletic clade that would be best represented by a single anamorphic genus. On the basis of taxonomic priority, we propose the transfer of the five species of the genus Trichosporonoides to the genus Moniliella. The description of the genus Moniliella is emended and the following new combinations are proposed: Moniliella madida comb. nov., Moniliella megachiliensis comb. nov., Moniliella nigrescens comb. nov., Moniliella oedocephalis comb. nov. and Moniliella spathulata comb. nov. In addition, ten strains representing a novel yeast species belonging to the Moniliella clade were isolated from flowers in Thailand, Cuba and Brazil. Analysis of the internal transcribed spacer and D1/D2 large-subunit rDNA sequences indicated that the isolates represent a single species that was distinct from other species of the Moniliella clade. The name Moniliella fonsecae sp. nov. is proposed to accommodate these strains. The type strain is BCC 7726T (=CBS 10551T).

ITS, internal transcribed spacer LSU, large subunit
Previous Section
Next Section
The GenBank/EMBL/DDBJ accession numbers for the sequences reported in this paper are DQ400366, AM947064, EF137915, EU252153 and EU545185.
The genus Moniliella was proposed by Stolk & Dakin (1966) to accommodate two novel species, M. acetoabutens and M. tomentosa. Two other species, Moniliella suaveolens and Moniliella mellis, were described by von Arx (1972) and Rao & de Hoog (1975), respectively. De Hoog & Guého (1984) proposed the new combination Moniliella pollinis for M. tomentosa var. pollinis on the basis of slight ecological, morphological and physiological differences, supported by a marked difference in the DNA G+C content. In general, the four Moniliella species are associated with fatty substrates, honey, pollen, tobacco, human sputum or spoiled foods (de Hoog & Smith, 1998a). The genus is similar to Trichosporonoides (Haskins & Spencer, 1967) and the two were considered to be possibly synonymous by Boekhout (1998) and de Hoog & Smith (1998a, b). The descriptions of the two genera were based on similar phenotypic characteristics. Species of both genera form smooth, velvety or cerebriform colonies, and most become olivaceous; pseudomycelium and arthroconidia are formed; sugars are fermented; nitrate is assimilated; the diazonium blue B reaction is positive; urease is produced; coenzyme Q-9 is produced; and xylose and fucose are absent from cell walls (de Hoog & Smith, 1998a, b). The type species of the genus Moniliella is M. acetoabutens, and the type species of the genus Trichosporonoides is T. oedocephalis (de Hoog & Smith, 1998a, b).

In the course of three independent studies of yeasts associated with plants in Thailand, Cuba and Brazil, several isolates of an unidentified yeast species were found. Analysis of sequences of the internal transcribed spacer (ITS) and D1/D2 domains of the large-subunit (LSU) rDNA showed that these strains represented a single species that was genetically distinct from other species in the Moniliella–Trichosporonoides clade. The name Moniliella fonsecae sp. nov. is proposed for the novel species, in honour of the Portuguese yeast researcher Álvaro Fonseca, in recognition of his contributions to yeast systematics and ecology. In addition, we propose the transfer of Trichosporonoides species to the genus Moniliella based on phenotypic characteristics and phylogenetic sequence analyses.

The origins of strains of the novel species studied are listed in Table 1⇓. The strain from Thailand was isolated from an unidentified flower collected in Khao-Yai National Park, Nakhonratchasima Province, in November 2000. The strain from Cuba was collected in October 2005 from a flower of Angelonia pilosella (Scophulariaceae), province Pinar del Río, near the city Viñales. The Brazilian strains were isolated from flowers of Byrsonima orbigniana (‘murici’, Malpighiaceae) collected in a forest fragment (Ipuca) of the Lago Verde Estate, in the flooded plains of the Araguaia River, state of Tocantins, in June 2005. The nectary regions of flowers were scraped gently with a sterile loop and streak-inoculated onto YM agar (comprising: 1.0 % glucose, 0.5 % peptone, 0.3 % malt extract, 0.3 % yeast extract and 2.0 % agar, w/v) containing 100 mg chloramphenicol l−1. The plates were incubated at room temperature (25±3 °C) for 3–8 days. Each different yeast morphotype was purified and maintained on YM slants or in liquid nitrogen storage for later identification. The yeasts were characterized by using standard methods (Yarrow, 1998). Identifications followed the taxonomic keys of Kurtzman & Fell (1998).

View this table:
In this window In a new window
Table 1.
List of isolates of Moniliella fonsecae sp. nov

BCC, BIOTEC Culture Collection, Thailand; CBS, Centraalbureau voor Schimmelcultures, The Netherlands; UFMG, Culture Collection of Micro-organisms and Cells of the Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil; MUCL, Mycothèque de l'Université catholique de Louvain, Belgium; CRGF, Collection of Fungal Genetic Resources, Cuba.

The ITS/5.8S rDNA and the D1/D2 variable domains of the LSU rDNA were amplified directly from whole cells as described previously (Marinoni & Lachance, 2004). The amplified DNA was cleaned on QIAquick PCR columns (Qiagen) and sequenced using an ABI sequencer at the John P. Robarts Research Institute, London, Ontario, Canada. The type strains of M. acetoabutens and M. mellis were also sequenced. The sequence was edited with the program DNAMAN, version 6 (Lynnon BioSoft). Existing sequences for other yeasts were retrieved from GenBank. The CLUSTAL W software (Thompson et al., 1994) incorporated in DNAMAN was used to align the sequences and construct a neighbour-joining tree with 1000 bootstrap iterations using the Kimura two-parameter transform.

Sequence comparisons indicated that the strains from Brazil, Cuba and Thailand represented a novel yeast species belonging to the Moniliella–Trichosporonoides clade (Fig. 1⇓). The isolate from Thailand and the Brazilian strain UFMG-05-T44 had the same sequence in the ITS/5.8S and D1/D2 LSU rDNA. The Cuban strain had two substitutions in the D1/D2 LSU rDNA and two substitutions in the ITS region in comparison with the other two. The closest relatives of this novel species were M. acetoabutens, M. suaveolens and Trichosporonoides spathulata. The D1/D2 LSU rDNA sequence of the novel species differed by 15 % or more (nearly 100 substitutions, depending on the alignment) from any related species, indicating a long history of divergent evolution. The phylogram in Fig. 1⇓ further showed that the genera Moniliella and Trichosporonoides are members of a single, monophyletic clade that would be best represented by a single anamorphic genus, as suggested by Boekhout (1998), because of their similar phenotypic characteristics. The genus Moniliella was described in 1966 (Stolk & Dakin, 1966) and has taxonomic priority over Trichosporonoides, which was described in 1967 (Haskins & Spencer, 1967). On the basis of taxonomic priority, the name Moniliella fonsecae sp. nov. is proposed for the novel species isolated from flowers in Thailand, Cuba and Brazil.

Fig. 1.
View larger version:
In this page In a new window
Download as PowerPoint Slide
Fig. 1.
Neighbour-joining phylogram based on the D1/D2 divergent domains of the LSU rDNA sequence of M. fonsecae sp. nov. and its closest relatives. Percentage bootstrap values were obtained from 1000 iterations. Bar, 5 % sequence divergence.

The isolation of M. fonsecae sp. nov. in Thailand, Cuba and Brazil suggests that it is a widespread organism adapted to flowers of tropical forest ecosystems and to the insects that visit these flowers. M. fonsecae sp. nov. has a narrow physiological profile, assimilating only a few carbon sources. This suggests that the yeast is a habitat specialist, possibly restricted to sugary substrat

1Departamento de Microbiologia, ICB, CP 486, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG 31270-901, Brazil
2BIOTEC Culture Collection, National Center for Genetic Engineering and Biotechnology (BIOTEC), 113 Paholyothin Road, Klong 1, Klong Luang, Pathumthani 12120, Thailand
3Department of Microbiology, Faculty of Science, Kasetsart University, 50 Paholyothin Road, Bangkok 10900, Thailand
4NITE Biological Resource Center (NBRC), National Institute of Technology and Evaluation, 2-5-8 Kazusakamatari, Kisaraza, Chiba 292-0818, Japan
5Department of Biology, University of Western Ontario, London, ON N6A 5B7, Canada
6Instituto de Ecología y Sistemática (IES), Carretera de Varona, km 3½ Capdevila, Boyeros, AP8029 CP 10800, Ciudad de la Habana, Cuba
7Mycothèque de l'Université catholique de Louvain (MUCL), Member of the Belgian Coordinated Collection of Microorganisms (BCCMTM), Croix du Sud 3, bte 6, 1348 Louvain la-Neuve, Belgium
8Departamento de Bioquímica e Microbiologia, Centro de Estudos de Insetos Sociais, Universidade Estadual Paulista, Avenida 24A, 1515 Rio Claro, SP 13506-900, Brazil
9Centro de Recursos Microbiológicos (CREM), Biotechnology Unit, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade Nova de Lisboa, 2829-516 Caparica, Portugal
10Laboratório de Microbiologia Ambiental e Biologia, Campus Universitário de Palmas, Fundação Universidade Federal do Tocantins, Palmas, Tocantins 77010-154, Brazil
Correspondence
Carlos A. Rosa
carlrosa@icb.ufmg.br
 
Next Section
Abstract

Analyses of nucleotide sequences from the D1/D2 domains of the large-subunit rDNA and phenotypic characteristics showed that the genera Moniliella and Trichosporonoides are members of a single, monophyletic clade that would be best represented by a single anamorphic genus. On the basis of taxonomic priority, we propose the transfer of the five species of the genus Trichosporonoides to the genus Moniliella. The description of the genus Moniliella is emended and the following new combinations are proposed: Moniliella madida comb. nov., Moniliella megachiliensis comb. nov., Moniliella nigrescens comb. nov., Moniliella oedocephalis comb. nov. and Moniliella spathulata comb. nov. In addition, ten strains representing a novel yeast species belonging to the Moniliella clade were isolated from flowers in Thailand, Cuba and Brazil. Analysis of the internal transcribed spacer and D1/D2 large-subunit rDNA sequences indicated that the isolates represent a single species that was distinct from other species of the Moniliella clade. The name Moniliella fonsecae sp. nov. is proposed to accommodate these strains. The type strain is BCC 7726T (=CBS 10551T).

ITS, internal transcribed spacer LSU, large subunit
Previous Section
Next Section
The GenBank/EMBL/DDBJ accession numbers for the sequences reported in this paper are DQ400366, AM947064, EF137915, EU252153 and EU545185.
The genus Moniliella was proposed by Stolk & Dakin (1966) to accommodate two novel species, M. acetoabutens and M. tomentosa. Two other species, Moniliella suaveolens and Moniliella mellis, were described by von Arx (1972) and Rao & de Hoog (1975), respectively. De Hoog & Guého (1984) proposed the new combination Moniliella pollinis for M. tomentosa var. pollinis on the basis of slight ecological, morphological and physiological differences, supported by a marked difference in the DNA G+C content. In general, the four Moniliella species are associated with fatty substrates, honey, pollen, tobacco, human sputum or spoiled foods (de Hoog & Smith, 1998a). The genus is similar to Trichosporonoides (Haskins & Spencer, 1967) and the two were considered to be possibly synonymous by Boekhout (1998) and de Hoog & Smith (1998a, b). The descriptions of the two genera were based on similar phenotypic characteristics. Species of both genera form smooth, velvety or cerebriform colonies, and most become olivaceous; pseudomycelium and arthroconidia are formed; sugars are fermented; nitrate is assimilated; the diazonium blue B reaction is positive; urease is produced; coenzyme Q-9 is produced; and xylose and fucose are absent from cell walls (de Hoog & Smith, 1998a, b). The type species of the genus Moniliella is M. acetoabutens, and the type species of the genus Trichosporonoides is T. oedocephalis (de Hoog & Smith, 1998a, b).

In the course of three independent studies of yeasts associated with plants in Thailand, Cuba and Brazil, several isolates of an unidentified yeast species were found. Analysis of sequences of the internal transcribed spacer (ITS) and D1/D2 domains of the large-subunit (LSU) rDNA showed that these strains represented a single species that was genetically distinct from other species in the Moniliella–Trichosporonoides clade. The name Moniliella fonsecae sp. nov. is proposed for the novel species, in honour of the Portuguese yeast researcher Álvaro Fonseca, in recognition of his contributions to yeast systematics and ecology. In addition, we propose the transfer of Trichosporonoides species to the genus Moniliella based on phenotypic characteristics and phylogenetic sequence analyses.

The origins of strains of the novel species studied are listed in Table 1⇓. The strain from Thailand was isolated from an unidentified flower collected in Khao-Yai National Park, Nakhonratchasima Province, in November 2000. The strain from Cuba was collected in October 2005 from a flower of Angelonia pilosella (Scophulariaceae), province Pinar del Río, near the city Viñales. The Brazilian strains were isolated from flowers of Byrsonima orbigniana (‘murici’, Malpighiaceae) collected in a forest fragment (Ipuca) of the Lago Verde Estate, in the flooded plains of the Araguaia River, state of Tocantins, in June 2005. The nectary regions of flowers were scraped gently with a sterile loop and streak-inoculated onto YM agar (comprising: 1.0 % glucose, 0.5 % peptone, 0.3 % malt extract, 0.3 % yeast extract and 2.0 % agar, w/v) containing 100 mg chloramphenicol l−1. The plates were incubated at room temperature (25±3 °C) for 3–8 days. Each different yeast morphotype was purified and maintained on YM slants or in liquid nitrogen storage for later identification. The yeasts were characterized by using standard methods (Yarrow, 1998). Identifications followed the taxonomic keys of Kurtzman & Fell (1998).

View this table:
In this window In a new window
Table 1.
List of isolates of Moniliella fonsecae sp. nov

BCC, BIOTEC Culture Collection, Thailand; CBS, Centraalbureau voor Schimmelcultures, The Netherlands; UFMG, Culture Collection of Micro-organisms and Cells of the Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil; MUCL, Mycothèque de l'Université catholique de Louvain, Belgium; CRGF, Collection of Fungal Genetic Resources, Cuba.

The ITS/5.8S rDNA and the D1/D2 variable domains of the LSU rDNA were amplified directly from whole cells as described previously (Marinoni & Lachance, 2004). The amplified DNA was cleaned on QIAquick PCR columns (Qiagen) and sequenced using an ABI sequencer at the John P. Robarts Research Institute, London, Ontario, Canada. The type strains of M. acetoabutens and M. mellis were also sequenced. The sequence was edited with the program DNAMAN, version 6 (Lynnon BioSoft). Existing sequences for other yeasts were retrieved from GenBank. The CLUSTAL W software (Thompson et al., 1994) incorporated in DNAMAN was used to align the sequences and construct a neighbour-joining tree with 1000 bootstrap iterations using the Kimura two-parameter transform.

Sequence comparisons indicated that the strains from Brazil, Cuba and Thailand represented a novel yeast species belonging to the Moniliella–Trichosporonoides clade (Fig. 1⇓). The isolate from Thailand and the Brazilian strain UFMG-05-T44 had the same sequence in the ITS/5.8S and D1/D2 LSU rDNA. The Cuban strain had two substitutions in the D1/D2 LSU rDNA and two substitutions in the ITS region in comparison with the other two. The closest relatives of this novel species were M. acetoabutens, M. suaveolens and Trichosporonoides spathulata. The D1/D2 LSU rDNA sequence of the novel species differed by 15 % or more (nearly 100 substitutions, depending on the alignment) from any related species, indicating a long history of divergent evolution. The phylogram in Fig. 1⇓ further showed that the genera Moniliella and Trichosporonoides are members of a single, monophyletic clade that would be best represented by a single anamorphic genus, as suggested by Boekhout (1998), because of their similar phenotypic characteristics. The genus Moniliella was described in 1966 (Stolk & Dakin, 1966) and has taxonomic priority over Trichosporonoides, which was described in 1967 (Haskins & Spencer, 1967). On the basis of taxonomic priority, the name Moniliella fonsecae sp. nov. is proposed for the novel species isolated from flowers in Thailand, Cuba and Brazil.

Fig. 1.
View larger version:
In this page In a new window
Download as PowerPoint Slide
Fig. 1.
Neighbour-joining phylogram based on the D1/D2 divergent domains of the LSU rDNA sequence of M. fonsecae sp. nov. and its closest relatives. Percentage bootstrap values were obtained from 1000 iterations. Bar, 5 % sequence divergence.

The isolation of M. fonsecae sp. nov. in Thailand, Cuba and Brazil suggests that it is a widespread organism adapted to flowers of tropical forest ecosystems and to the insects that visit these flowers. M. fonsecae sp. nov. has a narrow physiological profile, assimilating only a few carbon sources. This suggests that the yeast is a habitat specialist, possibly restricted to sugary substrat

0/5000

Từ: -

Sang: -

Kết quả (Việt) 1: [Sao chép]

Sao chép!

Synonymy của nấm men chi Moniliella và Trichosporonoides và đề nghị của Moniliella fonsecae sp. Tháng mười một. và năm kết hợp loài mớiCarlos A. Rosa1, Sasitorn Jindamorakot2, Savitree Limtong3, Takashi Nakase4, Marc-André Lachance5, Abel Fidalgo-Jiménez6, 7, Heide-Marie Daniel7, Fernando C. Pagnocca8, João Inácio9 và Paula B. Morais10+ Tác giả chi nhanh1Departamento de Microbiologia, ICB, CP 486, Universidade liên bang de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG 31270-901, Bra-xin2BIOTEC văn hóa bộ sưu tập, Trung tâm quốc gia cho kỹ thuật di truyền và công nghệ sinh học (BIOTEC), 113 Paholyothin Road, Klong 1, Klong Luang, Pathumthani 12120, Thái Lan3Department của vi sinh vật học, khoa học khoa học, đại học Kasetsart, 50 Paholyothin Road, Bangkok 10900, Thái Lan4NITE sinh học tài nguyên Trung tâm (NBRC), viện công nghệ và đánh giá, 2-5-8 Kazusakamatari, Kisaraza, Chiba 292-0818, Nhật bản5Department của sinh học, đại học Western Ontario, London, vào N6A 5B7, Canada6Instituto de Ecología y Sistemática (IE), Carretera de Varona, km 3½ Capdevila, Boyeros, AP8029 CP 10800, Ciudad de la Habana, Cuba7Mycothèque de l'Université catholique de Louvain (MUCL), thành viên của các Bỉ phối hợp bộ sưu tập của vi sinh vật (BCCMTM), Croix du Sud 3, bte 6, 1348 Louvain la-Neuve, Bỉ8Departamento de Bioquímica e Microbiologia, Centro de Estudos de Insetos Sociais, Universidade Estadual Paulista, Avenida 24A, 1515 Rio Claro, SP 13506-900, Bra-xin9Centro de Recursos Microbiológicos (CREM), đơn vị công nghệ sinh học, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade Nova de Lisboa, 2829-516 Caparica, Bồ Đào Nha10Laboratório de Microbiologia Ambiental e Biologia, khuôn viên trường Universitário de Palmas, Fundação Universidade liên bang do Tocantins Tocantins, Palmas, Bra-xin 77010-154,Thư từCarlos A. Rosacarlrosa@icb.UFMG.br Phần kế tiếpTóm tắtPhân tích các trình tự nucleotide từ các lĩnh vực D1/D2 lớn tiểu đơn vị rDNA và đặc điểm kiểu hình cho thấy rằng các chi Moniliella và Trichosporonoides là các thành viên của một nhánh đơn ngành duy nhất mà sẽ được tốt nhất đại diện bởi một chi anamorphic. Trên cơ sở phân loại ưu tiên, chúng tôi đề xuất chuyển 5 loài thuộc chi Trichosporonoides chi Moniliella. Mô tả của chi Moniliella emended và các kết hợp mới sau đây được đề xuất: Moniliella madida lược. Tháng mười một, Moniliella megachiliensis chải. Tháng mười một, Moniliella nigrescens chải. Tháng mười một, Moniliella oedocephalis chải. Tháng mười một. và Moniliella spathulata lược. Tháng mười một. Ngoài ra, mười chủng đại diện cho một cuốn tiểu thuyết nấm men loài thuộc nhánh Moniliella bị cô lập từ Hoa ở Thái Lan, Cuba và Bra-xin. Phân tích nội bộ sao chép lại spacer và D1/D2 lớn tiểu đơn vị rDNA chuỗi chỉ ra rằng các chủng đại diện cho một loài duy nhất là khác biệt với các loài khác của nhánh Moniliella. Tên Moniliella fonsecae sp. Tháng mười một. được đề xuất để chứa các chủng. Các chủng loại là BCC 7726T (= CBS 10551T).Của nó, nội bộ phiên âm spacer LSU, lớn tiểu đơn vịPhần trướcPhần kế tiếpCác con số gia nhập GenBank/EMBL/DDBJ cho các cảnh báo cáo trong giấy này là DQ400366, AM947064, EF137915, EU252153 và EU545185.Chi Moniliella được đề xuất bởi Stolk & Dakin (1966) để chứa hai tiểu thuyết loài, M. acetoabutens và M. tomentosa. Hai loài khác, Moniliella suaveolens và Moniliella mellis, đã được miêu tả bởi von Arx (1972) và Rao & de Hoog (1975), tương ứng. De Hoog & Guého (1984) đề xuất kết hợp mới Moniliella pollinis M. tomentosa var. pollinis trên cơ sở nhỏ khác biệt sinh thái, hình thái học và sinh lý, được hỗ trợ bởi một sự khác biệt được đánh dấu trong nội dung DNA G + C. Nói chung, các loài Moniliella được liên kết với chất béo, mật ong, phấn hoa, thuốc lá, đờm của con người hoặc hư hỏng thực phẩm (de Hoog & Smith, 1998a). Chi tương tự như Trichosporonoides (Haskins & Spencer, 1967) và hai được coi là có thể đồng nghĩa của Boekhout (1998) và de Hoog & Smith (1998a, b). Các mô tả của hai chi được dựa trên các kiểu hình tương tự. Loài của cả hai chi tạo thành trơn, mượt hay cerebriform thuộc địa, và hầu hết trở thành olivaceous; pseudomycelium và arthroconidia được thành lập; đường được lên men; nitrat là đồng hóa; phản ứng B diazoni màu xanh là tích cực; urease sản xuất; coenzym Q-9 được sản xuất; và xylose và fucose được vắng mặt từ thành tế bào (de Hoog & Smith, 1998a, b). Loài điển hình của chi Moniliella là M. acetoabutens, và loài điển hình của chi Trichosporonoides là T. oedocephalis (de Hoog & Smith, 1998a, b).Trong quá trình ba nghiên cứu độc lập của nấm men liên kết với nhà máy ở Thái Lan, Cuba và Brazil, một số chủng của một loài không rõ nguồn gốc nấm men đã được tìm thấy. Phân tích các trình tự của các spacer sao chép lại nội bộ (ITS) và D1/D2 tên miền của rDNA (LSU) lớn tiểu đơn vị cho thấy rằng các chủng đại diện cho một loài duy nhất là về mặt di truyền khác biệt với các loài khác trong nhánh Moniliella-Trichosporonoides. Tên Moniliella fonsecae sp. Tháng mười một. được đề xuất cho các loài mới lạ, để vinh danh các nhà nghiên cứu nấm men Bồ Đào Nha Álvaro Fonseca, để công nhận đóng góp nấm men hệ thống hóa và sinh thái học. Ngoài ra, chúng tôi đề nghị chuyển loài Trichosporonoides sang chi Moniliella dựa trên kiểu hình đặc điểm và phân tích phát sinh loài Chuỗi.Nguồn gốc của chủng loài tiểu thuyết học được liệt kê trong bảng 1⇓. Sự căng thẳng từ Thái Lan bị cô lập từ một hoa xác thu thập trong công viên quốc gia Khao Yai, tỉnh Nakhonratchasima, tháng 11 năm 2000. Sự căng thẳng từ Cuba đã được thu thập trong tháng 10 năm 2005 từ một hoa Angelonia pilosella (Scophulariaceae), tỉnh Pinar del Río, gần thành phố Viñales. Brazil chủng đã được phân lập từ các hoa của Byrsonima orbigniana ('murici', Malpighiaceae) thu thập trong một rừng mảnh (Ipuca) của Estate Lago Verde, ở vùng đồng bằng ngập nước của Sông Araguaia, bang Tocantins, tháng 6 năm 2005. Vùng mật hoa được cạo nhẹ nhàng với một vòng lặp vô trùng và streak tiêm chủng vào YM agar (bao gồm: 1,0% đường, chế phẩm peptone 0,5%, chiết xuất mạch Nha 0,3%, 0,3% nấm men chiết xuất và 2,0% agar, w/v) có chứa 100 mg chloramphenicol l−1. Các mảng được ủ ở nhiệt độ phòng (25±3 ° C) cho 3-8 ngày. Mỗi morphotype nấm men khác nhau đã được tinh khiết và duy trì trên YM nghiêng hoặc trong nitơ lỏng lưu trữ để xác định sau này. Các nấm men được đặc trưng bằng cách sử dụng phương pháp tiêu chuẩn (Yarrow, 1998). Giấy tờ chứng theo các phím phân loại của Kurtzman & giảm (1998).Xem bảng này:Trong cửa sổ này trong một cửa sổ mớiBảng 1.Danh sách các chủng của Moniliella fonsecae sp. Tháng mười mộtBCC, bộ sưu tập văn hóa BIOTEC, Thái Lan; CBS, Centraalbureau voor Schimmelcultures, Hà Lan; UFMG, bộ sưu tập văn hóa của vi sinh vật và các tế bào của Universidade liên bang de Minas Gerais, Brazil; MUCL, Mycothèque de l'Université catholique de Louvain, Bỉ; CRGF, bộ sưu tập của nấm tài nguyên di truyền, Cuba.ITS / 5.8S rDNA và lĩnh vực biến D1/D2 LSU rDNA đã được khuếch đại trực tiếp từ toàn bộ các tế bào như mô tả trước đó (Marinoni & Lachance, năm 2004). Khuếch đại DNA đã được làm sạch trên QIAquick PCR cột (Qiagen) và trình tự bằng cách sử dụng một sequencer ABI ở John P. Robarts Research Institute, London, Ontario, Canada. Các chủng loại của M. acetoabutens và M. mellis cũng được trình tự. Trình tự được chỉnh sửa với chương trình DNAMAN, phiên bản 6 (Lynnon BioSoft). Các trình tự sẵn có cho nấm men khác được lấy từ GenBank. Phần mềm CLUSTAL W (Thompson và ctv., 1994) tích hợp vào trong DNAMAN được sử dụng để sắp xếp các chuỗi và xây dựng một cây hàng xóm tham gia với 1000 bootstrap lặp đi lặp lại bằng cách sử dụng biến đổi hai tham số Kimura.So sánh trình tự chỉ ra rằng chủng từ Brazil, Cuba và Thái Lan đại diện cho một cuốn tiểu thuyết nấm men loài thuộc nhánh Moniliella-Trichosporonoides (hình 1⇓). Isolate từ Thái Lan và căng thẳng Brazil UFMG-05-T44 đã có cùng một trình tự trong ITS / 5.8S và D1/D2 LSU rDNA. Sự căng thẳng Cuba đã thay thế hai trong rDNA D1/D2 LSU và thay thế hai vùng ITS so với hai. Các họ hàng gần gũi nhất của loài này cuốn tiểu thuyết là M. acetoabutens, M. suaveolens và Trichosporonoides spathulata. Dãy D1/D2 LSU rDNA tiểu thuyết loài khác biệt với 15% hoặc hơn (gần 100 thay thế, tùy thuộc vào liên kết) từ bất kỳ liên quan đến loài, cho thấy một lịch sử lâu dài về sự tiến hóa khác nhau. Phylogram trong hình 1⇓ hơn nữa cho thấy rằng các chi Moniliella và Trichosporonoides là các thành viên của một nhánh đơn ngành duy nhất mà sẽ là tốt nhất đại diện bởi một chi duy nhất anamorphic, theo đề nghị của Boekhout (1998), bởi vì đặc điểm tương tự như kiểu hình của họ. Chi Moniliella được miêu tả năm 1966 (Stolk & Dakin, 1966) và có phân loại ưu tiên trong Trichosporonoides, được miêu tả năm 1967 (Haskins & Spencer, 1967). Trên cơ sở phân loại ưu tiên, tên Moniliella fonsecae sp. Tháng mười một. đề nghị để tiểu thuyết loài bị cô lập từ Hoa ở Thái Lan, Cuba và Bra-xin.Hình 1.Xem phiên bản lớn hơn:Trong trang này trong một cửa sổ mớiTải xuống như PowerPoint SlideHình 1.Tham gia hàng xóm phylogram dựa trên các lĩnh vực khác nhau D1/D2 của dãy LSU rDNA của M. fonsecae sp. Tháng mười một. và họ hàng gần nhất của nó. Tỷ lệ phần trăm giá trị bootstrap đã thu được từ 1000 lặp đi lặp lại. Bar, 5% chuỗi phân kỳ.Sự cô lập của M. fonsecae sp. Tháng mười một. tại Thái Lan, Cuba và Brazil cho thấy rằng nó là một sinh vật phổ biến rộng rãi thích nghi để Hoa của hệ sinh thái rừng nhiệt đới và các loài côn trùng mà truy cập những bông hoa. M. fonsecae sp. Tháng mười một. có một hồ sơ sinh lý hẹp, đồng hóa chỉ một vài nguồn cacbon. Điều này cho thấy rằng các men là một chuyên gia môi trường sống, có thể bị giới hạn để có đường substrat

đang được dịch, vui lòng đợi..

Kết quả (Việt) 2:[Sao chép]

Sao chép!

Đồng nghĩa của các chi nấm men Moniliella và Trichosporonoides và đề nghị của Moniliella fonsecae sp. Tháng mười một và năm loài kết hợp mới
Carlos A. Rosa1, Sasitorn Jindamorakot2, Savitree Limtong3, Takashi Nakase4, Marc-André Lachance5, Abel Fidalgo-Jiménez6,7, Heide-Marie Daniel7, Fernando C. Pagnocca8, João Inácio9 và Paula B. Morais10
+ Tác giả Chi nhánh 1Departamento de Microbiologia, ICB, CP 486, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG 31270-901, Brazil 2BIOTEC Bộ sưu tập văn hóa, Trung tâm quốc gia về kỹ thuật di truyền và Công nghệ sinh học (BIOTEC), 113 Paholyothin Road, Klong 1, Klong Luang, Pathumthani 12120, Thailand 3Department Vi sinh, Khoa Khoa học, Đại học Kasetsart, 50 Paholyothin Road, Bangkok 10900, Thailand 4NITE Trung tâm Tài nguyên sinh vật (NBRC), Viện Công nghệ và đánh giá, 2-5-8 Kazusakamatari, Kisaraza, Chiba 292- 0818, Nhật Bản 5Department Sinh học, Đại học Western Ontario, London, ON N6A 5B7, Canada 6Instituto de ECOLOGIA y Sistemática (IES), Carretera de Varona, km 3½ Capdevila, Boyeros, AP8029 CP 10800, Ciudad de la Habana, Cuba 7Mycothèque de l'Université catholique de Louvain (MUCL), thành viên của bộ sưu tập phối hợp Bỉ của vi sinh vật (BCCMTM), Croix du Sud 3, BTE 6, 1348 Louvain la-Neuve, Bỉ 8Departamento de Bioquímica e Microbiologia, Centro de Estudos de Insetos Sociais, Universidade Estadual Paulista, Avenida 24A, 1515 Rio Claro, SP 13506-900, Brazil 9Centro de Recursos Microbiológicos (CREM), Công nghệ sinh học Unit, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade Nova de Lisboa, 2829-516 Caparica, Bồ Đào Nha 10Laboratório de Microbiologia Ambiental e Biologia, Campus Universitario de Palmas, Fundação Universidade Federal làm Tocantins, Palmas, Tocantins 77010-154, Brazil Correspondence Carlos A. Rosa carlrosa@icb.ufmg.br phần tiếp theo Tóm tắt phân tích trình tự nucleotide từ các lĩnh vực D1 / D2 của mô lớn subunit rDNA và đặc điểm kiểu hình cho thấy các chi Moniliella và Trichosporonoides là thành viên của một nhánh đơn ngành duy nhất mà có thể biểu diễn tốt nhất bởi một chi anamorphic duy nhất. Trên cơ sở phân loại ưu tiên, chúng tôi đề nghị chuyển trong năm loài Trichosporonoides chi đến chi Moniliella. Việc mô tả chi Moniliella được emended và các kết hợp mới sau đây được đề xuất: Moniliella madida lược. Tháng Mười Một, Moniliella megachiliensis lược. Tháng Mười Một, Moniliella nigrescens lược. Tháng Mười Một, Moniliella oedocephalis lược. Tháng mười một và Moniliella spathulata lược. Tháng mười một Ngoài ra, mười chủng đại diện cho một loại men bia mới thuộc nhánh Moniliella được phân lập từ hoa ở Thái Lan, Cuba và Brazil. Phân tích của spacer chép nội và D1 / D2 lớn tiểu đơn vị trình tự rDNA chỉ ra rằng các phân lập đại diện cho một loài duy nhất phân biệt được với các loài khác của nhánh Moniliella. Tên Moniliella fonsecae sp. Tháng mười một được đề xuất để thích ứng với những chủng. Các loại căng thẳng là BCC 7726T (= 10551T CBS). ITS, spacer chép nội LSU, tiểu đơn vị lớn Phần trước phần tiếp theo Những con số nhập GenBank / EMBL / DDBJ cho các trình tự báo cáo trong bài báo này là DQ400366, AM947064, EF137915, EU252153 và EU545185 . Các chi Moniliella đã được đề xuất bởi Stolk & Dakin (1966) để chứa hai loài mới, M. acetoabutens và M. tomentosa. Hai loài khác, suaveolens Moniliella và Moniliella Mellis, được mô tả bởi von Arx (1972) và Rao & de Hoog (1975), tương ứng. De Hoog & Guého (1984) đề xuất pollinis kết hợp Moniliella mới cho M. tomentosa var. pollinis trên cơ sở của sự khác biệt về sinh thái, hình thái và sinh lý nhẹ, được hỗ trợ bởi một sự khác biệt rõ rệt về nội dung DNA G + C. Nói chung, bốn loài Moniliella được kết hợp với chất béo, mật ong, phấn hoa, thuốc lá, đờm con người hoặc các thực phẩm hư hỏng (de Hoog & Smith, 1998). Các chi là tương tự như Trichosporonoides (Haskins & Spencer, 1967) và hai người đã có thể coi là đồng nghĩa bởi Boekhout (1998) và de Hoog & Smith (1998a, b). Những mô tả của hai chi đã được dựa trên những đặc điểm kiểu hình tương tự. Loài của cả hai chi thành, mịn màng hay cerebriform thuộc địa, và hầu hết trở thành olivaceous; pseudomycelium và arthroconidia được hình thành; đường được lên men; nitrate được đồng hóa; các phản ứng diazonium xanh B là tích cực; urease được sản xuất; coenzyme Q-9 được sản xuất; và xylose và fucose vắng mặt từ thành tế bào (de Hoog & Smith, 1998a, b). Các loài điển hình của chi Moniliella được M. acetoabutens, và các loài điển hình của chi Trichosporonoides là T. oedocephalis (de Hoog & Smith, 1998a, b). Trong quá trình ba nghiên cứu độc lập của nấm men kết hợp với các nhà máy ở Thái Lan, Cuba và Brazil, một số chủng của một loài nấm không rõ nguồn gốc đã được tìm thấy. Phân tích trình tự của các spacer nội chép (ITS) và D1 / D2 lĩnh vực của tiểu đơn vị lớn (LSU) rDNA cho thấy rằng những dòng này đại diện cho một loài duy nhất là khác biệt về mặt di truyền từ các loài khác trong nhánh Moniliella-Trichosporonoides. Tên Moniliella fonsecae sp. Tháng mười một được đề xuất cho các loài mới, trong danh dự của các nhà nghiên cứu nấm men Bồ Đào Nha Álvaro Fonseca, để ghi nhận những đóng góp của ông cho hệ thống học nấm men và sinh thái. Ngoài ra, chúng tôi đề nghị chuyển loài Trichosporonoides đến chi Moniliella dựa trên những đặc điểm kiểu hình và trình tự các phân tích. Nguồn gốc của chủng của các loài mới học được liệt kê trong Bảng 1⇓. Sự căng thẳng từ Thái Lan đã được phân lập từ một loài hoa không xác định được thu thập ở Vườn Quốc gia Khao Yai-, tỉnh Nakhonratchasima, vào tháng Mười năm 2000. Sự căng thẳng từ Cuba đã được thu thập vào tháng Mười năm 2005 từ một bông hoa của Angelonia pilosella (Scophulariaceae), tỉnh Pinar del Río, gần thành phố Viñales. Các chủng Brazil đã được phân lập từ hoa của Byrsonima orbigniana ('Murici', Họ Sơ ri) thu thập trong một mảnh rừng (Ipuca) của Lago Verde động sản, ở vùng đồng bằng ngập lũ của sông Araguaia, nhà nước của Tocantins, vào tháng Sáu năm 2005. Các tuyến mật của hoa vùng hoa đã được cạo nhẹ nhàng với một vòng lặp vô trùng và tiêm vào streak-agar YM (gồm: glucose 1,0%, 0,5% peptone, 0,3% chiết xuất mạch nha, 0,3% chiết xuất nấm men và agar 2,0%, w / v) có chứa 100 mg cloramphenicol l-1. Các tấm được ủ ở nhiệt độ phòng (25 ± 3 ° C) cho 3-8 ngày. Mỗi morphotype nấm men khác nhau đã được tịnh hóa và duy trì trên slants YM hoặc lưu trữ trong nitơ lỏng để xác định sau. Các men này được đặc trưng bằng cách sử dụng các phương pháp tiêu chuẩn (Yarrow, 1998). Sự xác định theo các phím phân loại của Kurtzman & Fell (1998). Xem bảng này: Trong cửa sổ này Trong một cửa sổ mới Bảng 1. Danh sách các chủng Moniliella fonsecae sp. Tháng Mười Một BCC, BIOTEC Bộ sưu tập văn hóa, Thái Lan; CBS, Centraalbureau voor Schimmelcultures, Hà Lan; UFMG, Bộ sưu tập văn hóa của vi sinh vật và tế bào của Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil; MUCL, Mycothèque de l'Université catholique de Louvain, Bỉ; CRGF, Collection Tài nấm di truyền, Cuba. Các ITS / 5.8S rDNA và D1 / D2 lĩnh vực biến của LSU rDNA được khuếch đại trực tiếp từ toàn bộ các tế bào như mô tả trước đây (Marinoni & LaChance, 2004). DNA thu được làm sạch trên cột QIAquick PCR (Qiagen) và trình tự sử dụng một sequencer ABI tại Viện John P. Robarts Research, London, Ontario, Canada. Các chủng loại M. acetoabutens và M. Mellis cũng đã được giải trình tự. Trình tự đã được chỉnh sửa với DNAMAN chương trình, phiên bản 6 (Lynnon BioSoft). Trình tự hiện tại cho nấm men khác được lấy từ GenBank. Các phần mềm CLUSTAL W (Thompson et al., 1994) được thành lập tại DNAMAN đã được sử dụng để sắp xếp các trình tự và xây dựng một cây hàng xóm-tham gia với 1000 lặp bootstrap sử dụng Kimura hai tham số chuyển đổi. so sánh trình tự chỉ ra rằng các chủng từ Brazil, Cuba Thái Lan và đại diện cho một loại men bia mới thuộc nhánh Moniliella-Trichosporonoides (Fig. 1⇓). Phân lập từ Thái Lan và sự căng thẳng của Brazil UFMG-05-T44 có cùng một trình tự trong ITS / 5.8S và D1 / D2 LSU rDNA. Sự căng thẳng Cuba có hai thay thế trong D1 / D2 LSU rDNA và hai thay thế trong khu vực ITS so với hai người kia. Những người thân cận nhất của loài mới này là M. acetoabutens, M. suaveolens và Trichosporonoides spathulata. Các chuỗi D1 / D2 LSU rDNA của các loài khác nhau theo cuốn tiểu thuyết 15% hoặc nhiều hơn (gần 100 thay thế, tùy thuộc vào sự sắp xếp) từ bất kỳ loài nào liên quan, cho thấy một lịch sử lâu dài của sự tiến hóa khác nhau. Các phylogram trong hình. 1⇓ tiếp tục cho thấy rằng các chi Moniliella và Trichosporonoides là thành viên của một nhánh đơn ngành duy nhất mà có thể biểu diễn tốt nhất bởi một chi anamorphic duy nhất, theo đề nghị của Boekhout (1998), vì các đặc điểm kiểu hình tương tự của họ. Các chi Moniliella đã được mô tả vào năm 1966 (Stolk & Dakin, 1966) và có ưu tiên phân loại trên Trichosporonoides, được mô tả vào năm 1967 (Haskins & Spencer, 1967). Trên cơ sở phân loại ưu tiên, tên Moniliella fonsecae sp. Tháng mười một được đề xuất cho các loài mới được phân lập từ hoa ở Thái Lan, Cuba và Brazil. Fig. . 1 Xem phiên bản lớn hơn: Trong trang này Trong một cửa sổ mới Download như PowerPoint Slide hình. 1. Neighbour-gia phylogram dựa trên D1 / D2 lĩnh vực khác nhau của chuỗi LSU rDNA của M. fonsecae sp. Tháng mười một và họ hàng gần nhất của nó. Tỷ lệ phần trăm giá trị bootstrap được thu thập từ năm 1000 lặp lại. Bar, 5% chuỗi phân kỳ. Sự cô lập của M. fonsecae sp. Tháng mười một ở Thái Lan, Cuba và Brazil cho thấy rằng nó là một sinh vật phổ biến phù hợp với hoa của hệ sinh thái rừng nhiệt đới và các loài côn trùng thăm những bông hoa. M. fonsecae sp. Tháng mười một có một hồ sơ cá nhân sinh lý hẹp, chỉ đồng hóa một vài nguồn carbon. Điều này cho thấy rằng nấm men là một chuyên gia về môi trường sống, có thể hạn chế đến substrat ngọt

đang được dịch, vui lòng đợi..

Kết quả (Việt) 3:[Sao chép]

Sao chép!

đang được dịch, vui lòng đợi..

Các ngôn ngữ khác

Hỗ trợ công cụ dịch thuật: Albania, Amharic, Anh, Armenia, Azerbaijan, Ba Lan, Ba Tư, Bantu, Basque, Belarus, Bengal, Bosnia, Bulgaria, Bồ Đào Nha, Catalan, Cebuano, Chichewa, Corsi, Creole (Haiti), Croatia, Do Thái, Estonia, Filipino, Frisia, Gael Scotland, Galicia, George, Gujarat, Hausa, Hawaii, Hindi, Hmong, Hungary, Hy Lạp, Hà Lan, Hà Lan (Nam Phi), Hàn, Iceland, Igbo, Ireland, Java, Kannada, Kazakh, Khmer, Kinyarwanda, Klingon, Kurd, Kyrgyz, Latinh, Latvia, Litva, Luxembourg, Lào, Macedonia, Malagasy, Malayalam, Malta, Maori, Marathi, Myanmar, Mã Lai, Mông Cổ, Na Uy, Nepal, Nga, Nhật, Odia (Oriya), Pashto, Pháp, Phát hiện ngôn ngữ, Phần Lan, Punjab, Quốc tế ngữ, Rumani, Samoa, Serbia, Sesotho, Shona, Sindhi, Sinhala, Slovak, Slovenia, Somali, Sunda, Swahili, Séc, Tajik, Tamil, Tatar, Telugu, Thái, Thổ Nhĩ Kỳ, Thụy Điển, Tiếng Indonesia, Tiếng Ý, Trung, Trung (Phồn thể), Turkmen, Tây Ban Nha, Ukraina, Urdu, Uyghur, Uzbek, Việt, Xứ Wales, Yiddish, Yoruba, Zulu, Đan Mạch, Đức, Ả Rập, dịch ngôn ngữ.