Một điểm quan trọng khác trong mẫu mô hoặc tế bào là cô lập thủ tục thường xuyên gây áp lực di động và proteome có thể thay đổi để đáp ứng với những căng thẳng. Sự hình thành tăng phản ứng oxy loài (ROS) trong quá trình lấy mẫu tế bào và khai thác DNA là một artifact nổi tiếng làm phức tạp các phân tích của oxy hoá hư hại tại vivo. Vì ROS cũng có thể ôxy hóa protein và kích hoạt phản ứng thích nghi, tiềm năng cho các thay đổi artifactual trong proteome là quan trọng, đặc biệt là cho các sản phẩm gen liên quan đến căng thẳng. Mối quan tâm lớn thứ hai trong tế bào homogenization và phân là kích hoạt protease nội sinh, có thể tách nhiều protein để những mảnh vỡ. Mặc dù proteomic phân tích của các mảnh vỡ vẫn có thể mang lại thông tin hữu ích, những nỗ lực để liên kết các dữ liệu được mua các phần phân đoạn dựa trên trọng lượng phân tử có thể gây nhầm lẫn. Cuối cùng, theo cách thức mà trong đó một mẫu mô được chuẩn bị và lưu trữ có thể rất nhiều ảnh hưởng đến sự thành công của phân tích proteomic. Mẫu mô cố định là nói chung không thích hợp cho phân tích proteomic, vì mô điều trị với formaldehyde hoặc định hình tương tự như một số cross-links protein và ngăn chặn quá trình tiêu hóa và phục hồi bất kỳ mảnh vỡ peptide. Ngược lại, phần đông lạnh có thể rất amenable để phân tích protein.
đang được dịch, vui lòng đợi..