Stewart [42] used endoPG, OPA1-3, O

Stewart [42] used endoPG, OPA1-3, OPA2-1 and two microsatellite
flanking regions for phylogenetic analysis of citrus brown spot
worldwide. Pathogenic forms of A. alternata appear to have radiated
from a recent common saprophytic ancestor [43]. With the divergence
of the citrus 2 lineage, Stewart [42] suggested that a more complex
evolution history is possible. Radiation may have occurred with the
brown spot pathogen, two lineages of the citrus brown spot pathogen
exist. Based on the coalescent analyses and GCPSR results; lineage
citrus 2 appears to be derived from citrus 1. Loci Flank-F3 and OPA1-3
revealed strong evidence for a history of recombination among lineages.
Andrew et al. [23] estimated phylogenies using endoPG, OPA1-3, and
OPA10-2, and showed that A. arborescens formed a monophyletic
sister group to A. alternata in the OPA1-3 and 10-2 phylogenies, but
not in the endoPG phylogeny. This and the putative recombination
observed in evolutionary history of OPA1-3 suggest that A. arborescens
and A. alternata are recently diverged closely-related species. For future
studies, a more distant relative of A. alternata may be more appropriate
as an out group [42].

Kết quả (Việt) 2:

Stewart [42] sử dụng endoPG, OPA1-3, OPA2-1 và hai microsatellite
vùng chầu để phân tích phát sinh loài của họ cam quýt đốm nâu
trên toàn thế giới. Hình thức gây bệnh của A. alternata xuất hiện để có bức xạ
từ một tổ tiên chung gần hoại sinh [43]. Với sự phân kỳ
của cam quýt 2 dòng, Stewart [42] cho rằng một phức tạp hơn
lịch sử tiến hóa là có thể. Bức xạ có thể xảy ra với các
điểm mầm bệnh màu nâu, hai dòng của cam quýt đốm nâu mầm bệnh
tồn tại. Dựa trên phân tích các coalescent và kết quả GCPSR; dòng họ
cam quýt 2 dường như được bắt nguồn từ cam quýt 1. loci Flank-F3 và OPA1-3
tiết lộ bằng chứng mạnh mẽ cho một lịch sử của sự tái tổ hợp giữa các dòng.
Andrew et al. [23] phylogenies ước tính sử dụng endoPG, OPA1-3, và
OPA10-2, và cho thấy rằng A. arborescens hình thành một đơn ngành
nhóm chị A. alternata trong OPA1-3 và 10-2 phylogenies, nhưng
không phải trong phát sinh học endoPG. Này và tái tổ hợp giả định
quan sát thấy trong lịch sử tiến hóa của OPA1-3 cho rằng A. arborescens
và A. alternata vừa được tách ra loài chặt chẽ liên quan đến. Trong tương lai
nghiên cứu, một người họ hàng xa hơn của A. alternata có thể thích hợp hơn
là một nhóm ra [42].