Sequence analysis revealed 12 SNPs

Sequence analysis revealed 12 SNPs in the coding (exonic)
region of TLR-4 gene given in Table 1. The Coding DNA
Sequences of Murrah TLR-4 gene (Exon 1, 2, and 3)
were conceptually translated and compared with those
of Bubalus bubalis reported sequences (NCBI Accession
number EU386358). At position 75nt of exon 1, only one
SNP (T to C) has been identified which has resulted in a
substitution of Threonine to Methionine. Exon 2 did not
show any change in base sequence. However, a total of 11
SNPs have been identified in exon 3 at nucleotide positions
311, 315, 316, 318, 386, 401, 411, 551, 555, 636, and 994.
Only five of these nucleotide changes result into changes in
amino acids leading to nonsynonymous SNPs. In the only
report available till date, Sonawane [6] has reported a total
of six SNPs, out of which 4 are nonsynonymous, two each in
exons 1 and 3. He also did not observe any SNP in exon 2.
However, in Holstein cattle, Sharma et al. [4] have reported
3 SNPs: 1 in promoter region (P-226) and 2 in exon 3 (1656
and 2021). Wang et al. [5] identified 1 SNP at nucleotide 1397
in exon 3. Wang et al., 2007 have reported 31 SNPs scattered
through the 5 flanking region to exon 3. Five of these SNPs
were coded for amino acid substitution.

Kết quả (Việt) 1:

Chuỗi phân tích cho thấy 12 SNPs trong các mã hóa (exonic)khu vực của TLR-4 gen được đưa ra trong bảng 1. DNA mã hóaTrình tự của gene Murrah TLR-4 (Exon 1, 2 và 3)khái niệm đã được dịch và so sánh với những ngườicủa trâu chi báo cáo trình tự (NCBI gia nhậpsố EU386358). Tại vị trí 75nt của exon 1, chỉ có mộtSNP (T-C) đã được xác định đó đã dẫn đến mộtthay thế của Threonine để Methionin. Exon 2 khôngHiển thị bất kỳ thay đổi trong cơ sở chuỗi. Tuy nhiên, tổng số 11SNPs đã được xác định trong exon 3 vị trí nucleotide311, 315, 316, 318, 386, 401, 411, 551, 555, 636, và 994.Chỉ có năm của những thay đổi này nucleotide kết quả vào những thay đổi trongaxit amin dẫn đến nonsynonymous SNPs. Trong duy nhấtbáo cáo có sẵn cho đến nay, Sonawane [6] đã báo cáo tổng cộngcủa sáu SNPs, trong đó 4 là nonsynonymous, hai mỗi nămexon 1 và 3. Ông cũng đã không quan sát bất kỳ SNP trong exon 2.Tuy nhiên, ở gia súc Holstein, Sharma et al. [4] đã báo cáo3 SNPs: 1 trong promoter vùng (P-226) và 2 trong exon 3 (1656và 2021). Wang et al. [5] xác định 1 SNP tại nucleotide 1397trong exon 3. Wang và ctv., 2007 đã thông báo 31 SNPs rải rácthông qua 5 khu vực để exon 3 sườn. Năm trong số những SNPsđã mã hoá cho thay thế axit amin.

Kết quả (Việt) 2:

Phân tích trình tự tiết lộ 12 SNPs trong mã hóa (exonic)
khu vực của TLR-4 gen được đưa ra trong Bảng 1. Mã hóa DNA
Sequences của Murrah TLR-4 gen (Exon 1, 2, và 3)
được khái niệm dịch và so sánh với
các Bubalus bubalis báo cáo trình tự (NCBI nhập
số EU386358). Ở vị trí 75nt của exon 1, chỉ có một
SNP (T để C) đã được xác định đó đã dẫn đến một
sự thay thế của Threonine để Methionine. Exon 2 đã không
cho thấy bất kỳ thay đổi trong trình tự base. Tuy nhiên, tổng cộng 11
SNPs đã được xác định trong exon 3 tại các vị trí nucleotide
311, 315, 316, 318, 386, 401, 411, 551, 555, 636, và 994.
Chỉ năm của những thay đổi nucleotide dẫn đến những thay đổi trong
amino axit dẫn đến SNPs nonsynonymous. Trong các chỉ
báo cáo có sẵn cho đến nay, Sonawane [6] đã báo cáo tổng
số sáu SNPs, trong đó 4 là nonsynonymous, hai trong mỗi
exon 1 và 3. Ông cũng đã không thực hiện bất kỳ SNP trong exon 2.
Tuy nhiên, trong Holstein gia súc, Sharma et al. [4] đã báo cáo
3 SNPs: 1 trong vùng promoter (P-226) và 2 trong exon 3 (1656
và 2021). Wang et al. [5] xác định 1 SNP tại nucleotide 1397
trong exon 3. Wang et al., 2007 đã báo cáo 31 SNPs rải rác
thông qua 5 vùng chầu để exon 3. Năm trong số các SNPs
đã được mã hoá để thay thế amino acid.